MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F16

Total Repeats: 464

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017368	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017368	ATGC	2	8	4277	4284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017368	AAAG	2	8	4955	4962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017368	ATAA	2	8	9476	9483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017368	ATTC	2	8	9679	9686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017368	TTAA	2	8	13493	13500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017368	AGTT	2	8	16440	16447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017368	ATCA	2	8	22551	22558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017368	GATT	2	8	25019	25026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017368	ATTA	2	8	25115	25122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017368	CAAT	2	8	25833	25840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017368	AGCG	2	8	30843	30850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017368	GTTA	2	8	54969	54976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017368	AAGT	2	8	57097	57104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017368	TGAA	2	8	57205	57212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017368	TAGA	2	8	57233	57240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017368	TTCT	2	8	57277	57284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017368	TTTA	2	8	61294	61301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017368	TAAA	2	8	61330	61337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017368	CTAG	2	8	65409	65416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017368	TTCA	2	8	65531	65538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017368	TTAA	2	8	67165	67172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017368	TTTA	2	8	72292	72299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017368	CTAA	2	8	73251	73258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017368	CTGA	2	8	73272	73279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017368	CTAA	2	8	73293	73300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017368	TTTA	2	8	92042	92049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017368	CATG	2	8	92185	92192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017368	AAAG	2	8	92689	92696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017368	ACTC	2	8	93039	93046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017368	GTTT	2	8	94281	94288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017368	TTTC	2	8	99680	99687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017368	GGTG	2	8	106752	106759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017368	TCCC	2	8	106822	106829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017368	AAAG	2	8	111330	111337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017368	TTCA	2	8	112331	112338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017368	TTTA	2	8	112358	112365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017368	TGAT	2	8	113975	113982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017368	ATCA	2	8	120614	120621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017368	AACA	2	8	120737	120744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017368	TTGA	2	8	124338	124345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017368	AAGC	2	8	126033	126040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017368	CCGC	2	8	126056	126063	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017368	CTTT	2	8	127959	127966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017368	AAAT	2	8	127969	127976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017368	ATTT	2	8	129501	129508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017368	GCAT	2	8	130566	130573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017368	TCAT	2	8	134201	134208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017368	CATT	2	8	138853	138860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017368	TTAG	2	8	141453	141460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017368	AAAG	2	8	144358	144365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017368	AAAG	2	8	144853	144860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017368	GAAG	2	8	144910	144917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017368	ACAA	2	8	145916	145923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017368	AATT	2	8	145975	145982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017368	AATC	2	8	146087	146094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017368	CTTG	2	8	146715	146722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017368	GTGG	2	8	146723	146730	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017368	CAAG	2	8	148136	148143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017368	TAAA	2	8	148547	148554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017368	ATTT	2	8	151415	151422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017368	TCTT	2	8	152859	152866	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017368	CAAA	2	8	153200	153207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017368	TAAG	2	8	156763	156770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017368	TCAA	2	8	176648	176655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017368	CTTG	2	8	176993	177000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017368	CACT	2	8	186960	186967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017368	TAAC	2	8	187222	187229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017368	AATA	2	8	187233	187240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017368	AATA	2	8	187242	187249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017368	GAAT	2	8	187293	187300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017368	TTTA	2	8	189922	189929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017368	GATT	2	8	192986	192993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017368	CGCT	2	8	193105	193112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017368	CATT	2	8	198205	198212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017368	TTTG	2	8	198224	198231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017368	TTCA	2	8	200094	200101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017368	TTAG	2	8	213646	213653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017368	CTAG	2	8	213695	213702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017368	CTTT	2	8	214198	214205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017368	TAAA	2	8	215354	215361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017368	TGTT	2	8	216188	216195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017368	TTTA	2	8	221186	221193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017368	AATG	2	8	223141	223148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017368	TTGA	2	8	224208	224215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017368	AAAG	2	8	224382	224389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017368	TTAT	2	8	233282	233289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017368	CGCT	2	8	239233	239240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017368	ATTT	2	8	239242	239249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017368	AATA	2	8	239782	239789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017368	TCTT	2	8	240779	240786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017368	GAAA	2	8	243261	243268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017368	TTTA	2	8	246180	246187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017368	TTAG	2	8	250539	250546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017368	CTTT	2	8	250892	250899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017368	TCAA	2	8	252097	252104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017368	TAAT	2	8	267299	267306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017368	AAAG	2	8	267344	267351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017368	TGAT	2	8	277174	277181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017368	TCAA	2	8	310025	310032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017368	AACA	2	8	313656	313663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017368	TTAA	2	8	314489	314496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017368	GTTT	2	8	314612	314619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017368	GCTT	2	8	331222	331229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017368	TTTG	2	8	331401	331408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017368	TGAG	2	8	331518	331525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017368	TTGG	2	8	334233	334240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017368	TTGG	2	8	336297	336304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017368	AAAT	2	8	342444	342451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017368	GCTT	2	8	347704	347711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017368	TCAA	2	8	347791	347798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017368	AATC	2	8	348343	348350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017368	TCTT	2	8	348744	348751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017368	TGAA	2	8	355021	355028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017368	CTAA	2	8	355029	355036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017368	TAAA	2	8	365234	365241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017368	TTAA	2	8	376718	376725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017368	TAAA	2	8	376729	376736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017368	TTTA	2	8	384710	384717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017368	TTGT	2	8	384975	384982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017368	CTTT	2	8	385038	385045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017368	TTTC	2	8	385126	385133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017368	CAAA	2	8	385178	385185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017368	AAAC	2	8	388595	388602	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017368	GTTT	2	8	392118	392125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017368	TTTC	2	8	396438	396445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017368	GGGT	2	8	398329	398336	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017368	GAAA	2	8	398386	398393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017368	AACA	2	8	398399	398406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017368	TTGA	2	8	409071	409078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017368	CCAA	2	8	412541	412548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017368	AGGT	2	8	417252	417259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017368	TCAA	2	8	430590	430597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017368	CAAT	2	8	432777	432784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017368	CACC	2	8	445763	445770	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017368	GTGG	2	8	446036	446043	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017368	AACA	2	8	446066	446073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017368	TATC	2	8	460507	460514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017368	TGTT	2	8	484285	484292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017368	GATT	2	8	489420	489427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017368	AAAG	2	8	491941	491948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017368	CACC	2	8	491953	491960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_017368	GGTT	2	8	492118	492125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017368	TTAT	2	8	492990	492997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017368	ATAA	2	8	493088	493095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017368	TCTT	2	8	496117	496124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017368	CATT	2	8	497935	497942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017368	CAAT	2	8	500725	500732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017368	AAAG	2	8	513128	513135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017368	ATCT	2	8	514294	514301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_017368	ATTT	2	8	532299	532306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.