MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F57

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017367	AAAAAG	2	12	5157	5168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017367	AAACAC	2	12	18410	18421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017367	TTTCTT	2	12	23076	23087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017367	TTTGTT	2	12	26010	26021	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017367	GGTAAA	2	12	91563	91574	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017367	AGCGGT	2	12	92007	92018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017367	CTAAAA	2	12	112658	112669	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017367	ATTTTT	2	12	135992	136003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017367	GTATTT	2	12	155250	155261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017367	TTGTTT	2	12	174830	174841	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017367	TAAAAA	2	12	189351	189362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017367	ATTCTT	2	12	206922	206933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017367	ACTCAA	2	12	226071	226082	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017367	TATAAT	2	12	232873	232884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017367	ATTAAA	2	12	246684	246695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017367	ATTTTA	2	12	269765	269776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017367	AGAGAA	2	12	275680	275691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017367	TAAAAT	2	12	295960	295971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017367	TTTTTA	2	12	314988	314999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017367	GATTTA	2	12	376265	376276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017367	AAAATA	2	12	488038	488049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017367	TAAAAA	2	12	502132	502143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017367	CAAACG	2	12	510367	510378	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017367	TATTAG	2	12	511467	511478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017367	ATTTTT	2	12	513539	513550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017367	ACTTTA	2	12	520997	521008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017367	TATTTT	2	12	527102	527113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017367	TTTAAT	2	12	537970	537981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017367	TTTGGA	2	12	552797	552808	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017367	TTGTAA	2	12	576178	576189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017367	TTTAAA	2	12	601346	601357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017367	ATTTTA	2	12	634333	634344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017367	TAAAAT	2	12	641426	641437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017367	ATAGAA	2	12	733667	733678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017367	AAGAAA	2	12	740442	740453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017367	AAAAAT	2	12	747461	747472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017367	AAAACT	2	12	904167	904178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017367	ATTTTT	2	12	934204	934215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017367	AAAAAG	2	12	954689	954700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017367	ATTATA	2	12	977848	977859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017367	ATTGAA	2	12	985256	985267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017367	CTCTCG	2	12	1029955	1029966	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017367	TTAAAA	2	12	1032514	1032525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017367	AGAAAG	3	18	1032615	1032632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017367	TCCTAT	2	12	1070814	1070825	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017367	AACGCT	2	12	1179509	1179520	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017367	ACTTAA	2	12	1250263	1250274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017367	AAACTT	2	12	1272560	1272571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017367	ATTTTT	2	12	1304036	1304047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017367	TAAAAA	2	12	1332129	1332140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017367	AGTTTT	2	12	1395613	1395624	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017367	AGCGGG	2	12	1406771	1406782	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017367	GTTTTA	2	12	1416865	1416876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017367	TAAAAA	2	12	1417691	1417702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017367	AAGCCA	2	12	1417843	1417854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017367	ATGGTG	2	12	1418029	1418040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017367	CTAAGT	2	12	1428983	1428994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017367	TGTTTA	2	12	1438393	1438404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.