MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F57

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017367	ATGC	2	8	4293	4300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017367	ACTA	2	8	5060	5067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017367	TTTG	2	8	7544	7551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017367	ATAA	2	8	9753	9760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017367	ATTC	2	8	9956	9963	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017367	TTAA	2	8	13768	13775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017367	AGTT	2	8	16714	16721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017367	ATCA	2	8	22825	22832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017367	GATT	2	8	25321	25328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017367	ATTA	2	8	25417	25424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017367	AGCG	2	8	31109	31116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017367	ACCA	2	8	57468	57475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017367	TGAA	2	8	57750	57757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017367	TAGA	2	8	57778	57785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017367	TTCT	2	8	57822	57829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017367	TTTA	2	8	61843	61850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017367	TAAA	2	8	61879	61886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017367	TTCA	2	8	66092	66099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017367	TTAA	2	8	67729	67736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017367	TTTA	2	8	72856	72863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017367	TATT	2	8	87027	87034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017367	TTTA	2	8	90918	90925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017367	CATG	2	8	91062	91069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017367	ACTC	2	8	91910	91917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017367	CTTT	2	8	93150	93157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017367	GTTT	2	8	93212	93219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017367	TTTG	2	8	93242	93249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017367	TTTC	2	8	98505	98512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017367	ATAA	2	8	103595	103602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017367	TCAA	2	8	103615	103622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017367	CTAT	2	8	104645	104652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017367	TGAT	2	8	111321	111328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017367	TAAT	2	8	111430	111437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017367	TTGT	2	8	111460	111467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017367	TTCC	2	8	112493	112500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017367	CTTT	2	8	112553	112560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017367	CTTT	2	8	113047	113054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017367	CTAA	2	8	115952	115959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017367	AATG	2	8	118552	118559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017367	AATG	2	8	123145	123152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017367	TAAA	2	8	127848	127855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017367	ATTT	2	8	129381	129388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017367	AAAG	2	8	129391	129398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017367	GCGG	2	8	131294	131301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017367	GCTT	2	8	131318	131325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017367	ATCA	2	8	142838	142845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017367	TGAA	2	8	144481	144488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017367	TTAG	2	8	145463	145470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017367	TTCT	2	8	149946	149953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017367	AGGG	2	8	150170	150177	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017367	CACC	2	8	150241	150248	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_017367	CTTT	2	8	152199	152206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017367	ATTT	2	8	153576	153583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017367	GTTT	2	8	157091	157098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017367	ATTT	2	8	159867	159874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017367	CAAA	2	8	161661	161668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017367	TAAG	2	8	165223	165230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017367	AAAT	2	8	184877	184884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017367	TCAA	2	8	185102	185109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017367	CACT	2	8	195401	195408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017367	TTTC	2	8	195669	195676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017367	TAAC	2	8	195688	195695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017367	AATA	2	8	195699	195706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017367	AATA	2	8	195708	195715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017367	GAAT	2	8	195759	195766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017367	TTTA	2	8	198388	198395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017367	TTTA	2	8	198402	198409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017367	TTGA	2	8	198523	198530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017367	TTGG	2	8	198580	198587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017367	GATT	2	8	201856	201863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017367	CGCT	2	8	201975	201982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017367	CATT	2	8	207106	207113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017367	TTTG	2	8	207125	207132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017367	TTCA	2	8	208947	208954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017367	TTAG	2	8	222491	222498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017367	CTTT	2	8	222506	222513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017367	CTAG	2	8	222540	222547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017367	TGCA	2	8	228418	228425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017367	GAGC	2	8	228510	228517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017367	GTTT	2	8	228527	228534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017367	TTAA	2	8	230016	230023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017367	AATG	2	8	231969	231976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017367	TTGA	2	8	233031	233038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017367	ACAA	2	8	233090	233097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017367	TATT	2	8	241908	241915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017367	CGCT	2	8	247865	247872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017367	ATTT	2	8	247874	247881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017367	TTAG	2	8	248296	248303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017367	AAAT	2	8	248339	248346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017367	TCTT	2	8	249338	249345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017367	GAAA	2	8	251793	251800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017367	ATTA	2	8	253172	253179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017367	TTTA	2	8	254693	254700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017367	TCAT	2	8	259094	259101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017367	TCAA	2	8	260454	260461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017367	TAAT	2	8	275634	275641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017367	CCAT	2	8	303909	303916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017367	TGAA	2	8	322245	322252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017367	TTAT	2	8	323419	323426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017367	TGAT	2	8	324844	324851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017367	TTAA	2	8	342516	342523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017367	CTAT	2	8	351707	351714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017367	TCAA	2	8	357766	357773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017367	TTAA	2	8	362236	362243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017367	GTTT	2	8	362359	362366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017367	TTTG	2	8	379157	379164	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017367	TGAG	2	8	379274	379281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017367	ATTG	2	8	381988	381995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017367	TTGG	2	8	384221	384228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017367	AAAT	2	8	390367	390374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017367	TCAA	2	8	395835	395842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017367	AATC	2	8	396383	396390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017367	TGAA	2	8	403014	403021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017367	CTAA	2	8	403022	403029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017367	TAAA	2	8	413575	413582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017367	TAAA	2	8	425070	425077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017367	TTTA	2	8	434646	434653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017367	GTTT	2	8	442023	442030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017367	TTTC	2	8	446349	446356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017367	GGGT	2	8	448239	448246	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017367	GAAA	2	8	448296	448303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017367	AACA	2	8	448309	448316	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017367	CTTT	2	8	461119	461126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017367	CCAA	2	8	462459	462466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017367	AGGT	2	8	467164	467171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017367	TCAA	2	8	480445	480452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017367	TTAA	2	8	480518	480525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017367	CAAT	2	8	482632	482639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017367	GTTT	2	8	495549	495556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017367	CACC	2	8	495641	495648	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017367	GTGG	2	8	495913	495920	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017367	TATC	2	8	510312	510319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017367	AATT	2	8	518722	518729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017367	ACAA	2	8	521060	521067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017367	TAAA	2	8	524038	524045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017367	ATTG	2	8	531810	531817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017367	CAAC	3	12	534582	534593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017367	CTTA	2	8	537789	537796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017367	GATT	2	8	547078	547085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017367	TTTA	2	8	552832	552839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017367	AGAA	2	8	553046	553053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017367	TGAT	2	8	554800	554807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017367	ATGC	2	8	554868	554875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017367	ACAA	2	8	564897	564904	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017367	CCTT	2	8	565043	565050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017367	CTTT	2	8	569166	569173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017367	GTTG	2	8	578608	578615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017367	GTTA	2	8	580518	580525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017367	ATCA	2	8	581593	581600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017367	CTTT	2	8	581695	581702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.