MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017365	TTTGT	2	10	2423	2432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017365	TTTTA	2	10	4910	4919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017365	GCTTT	2	10	13479	13488	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017365	AAATC	2	10	25763	25772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017365	AAATT	2	10	30072	30081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017365	TTTTG	2	10	63747	63756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017365	TTTTA	2	10	83268	83277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017365	AATAT	2	10	84270	84279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017365	GAAAG	2	10	91008	91017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017365	AGAAA	2	10	100311	100320	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017365	ATTTA	2	10	141974	141983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017365	CTTTT	2	10	144221	144230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017365	CTTTT	2	10	144494	144503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017365	TATTT	2	10	151711	151720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017365	TTGTT	2	10	154220	154229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017365	CTCAT	2	10	154249	154258	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017365	ATGAA	2	10	159333	159342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017365	TATAT	2	10	179310	179319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017365	GTCTA	2	10	183656	183665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017365	GGATT	2	10	184209	184218	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017365	GATTG	2	10	201939	201948	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017365	TGATT	2	10	210762	210771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017365	TAAAA	2	10	216839	216848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017365	TAAAA	2	10	230690	230699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017365	TTATT	2	10	238755	238764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017365	CTTTT	2	10	240880	240889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017365	TTTAA	2	10	242471	242480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017365	TCGTG	2	10	251731	251740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017365	TAAAT	2	10	253151	253160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017365	GTTTT	2	10	272035	272044	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017365	GCATG	2	10	279232	279241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017365	TTAAT	2	10	282393	282402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017365	GTTTT	2	10	282423	282432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017365	TGATT	2	10	287268	287277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017365	GAATA	2	10	302463	302472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017365	AATTT	2	10	302557	302566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017365	TTTTA	2	10	317261	317270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017365	AATTA	2	10	326611	326620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017365	TTTAT	2	10	328149	328158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017365	TATTT	2	10	349567	349576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017365	AGTAA	2	10	373326	373335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017365	AGTGA	2	10	373623	373632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017365	AGATG	2	10	375100	375109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017365	TTGAA	2	10	375332	375341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017365	TAAAC	2	10	387364	387373	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017365	GTTAA	2	10	423200	423209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017365	ACTTG	2	10	435566	435575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017365	TTTTA	2	10	467108	467117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017365	TACGA	2	10	470615	470624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017365	ATTCA	2	10	473692	473701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017365	GTTAA	2	10	476380	476389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017365	TTATA	2	10	487634	487643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017365	TTTAG	2	10	490091	490100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017365	AAAAT	2	10	496864	496873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017365	TTAAA	2	10	501547	501556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017365	TAAAA	2	10	520679	520688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017365	TAAAA	2	10	526741	526750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017365	TTTAA	2	10	535162	535171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017365	ATTTT	2	10	535239	535248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017365	AAATA	2	10	535444	535453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017365	TTAAT	2	10	542878	542887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017365	ATAAA	2	10	583756	583765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017365	TGAGA	2	10	583791	583800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017365	TAAAA	2	10	593005	593014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017365	TTTTA	2	10	602708	602717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017365	TAGAA	2	10	634919	634928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017365	TACTA	2	10	645359	645368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017365	TAAAT	2	10	647202	647211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017365	CACAT	2	10	647670	647679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017365	TTGAC	2	10	652812	652821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017365	TTGAT	2	10	655406	655415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017365	ATTCC	2	10	659256	659265	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017365	TAGAA	2	10	668167	668176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017365	ATTAA	2	10	668270	668279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017365	GTTTT	2	10	678686	678695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017365	ATTTA	2	10	681909	681918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017365	AAACA	2	10	687794	687803	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017365	CTTTT	2	10	688847	688856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017365	AAGCG	2	10	788514	788523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017365	CCTTA	2	10	788626	788635	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017365	TCGTT	2	10	810237	810246	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017365	TACAA	2	10	824317	824326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017365	ATTAA	2	10	830062	830071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017365	ACATT	2	10	834949	834958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017365	AAAAC	2	10	846295	846304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017365	TATTT	2	10	848187	848196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017365	TTAAA	2	10	851126	851135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017365	TTTTA	2	10	877278	877287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017365	TTGAA	2	10	877482	877491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017365	AGCCT	2	10	882747	882756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017365	AGTTA	2	10	891034	891043	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017365	TAAAA	2	10	901070	901079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017365	TATTT	2	10	904131	904140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017365	TATTT	2	10	913116	913125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017365	TTTTA	2	10	917744	917753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017365	TTATT	2	10	917838	917847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017365	AAAAC	2	10	932014	932023	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017365	TCATT	2	10	932577	932586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017365	ATTTT	2	10	940046	940055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017365	ATTTT	3	15	940078	940092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017365	ACAAG	2	10	945438	945447	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017365	ATTAA	2	10	950244	950253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017365	CTTTA	2	10	951864	951873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017365	TGGTT	2	10	965566	965575	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017365	TTATT	2	10	985996	986005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017365	CTTTA	2	10	996813	996822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017365	TTAAC	2	10	1003144	1003153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017365	TTTTA	2	10	1004278	1004287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017365	GTTTT	2	10	1013186	1013195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017365	AAATC	2	10	1016097	1016106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017365	AACTT	2	10	1042198	1042207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017365	AATAT	2	10	1049167	1049176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017365	AAAAC	2	10	1085476	1085485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017365	AAATG	2	10	1103192	1103201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017365	AATTT	2	10	1118834	1118843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017365	TTTTA	2	10	1129712	1129721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017365	TAAAC	2	10	1139243	1139252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017365	GGTTT	2	10	1143541	1143550	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017365	ACCAA	2	10	1155488	1155497	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017365	TAGCA	2	10	1155948	1155957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017365	TGTTT	2	10	1162823	1162832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017365	AAGAA	2	10	1182062	1182071	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017365	TTAAA	2	10	1187117	1187126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017365	TTTTG	2	10	1190142	1190151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017365	GATTT	2	10	1190160	1190169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017365	AGAAA	2	10	1193185	1193194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017365	TTTTG	2	10	1206530	1206539	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017365	AATTT	2	10	1207924	1207933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017365	ATTTG	2	10	1213800	1213809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017365	ACAGA	2	10	1235221	1235230	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017365	TAGAT	2	10	1239505	1239514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017365	AAATT	2	10	1244897	1244906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017365	AATTT	2	10	1248614	1248623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017365	CAAAA	2	10	1255313	1255322	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017365	TTTTG	2	10	1263626	1263635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017365	TATCT	2	10	1287796	1287805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017365	TGTAA	2	10	1301879	1301888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017365	TAAAA	2	10	1303761	1303770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017365	TTTGT	2	10	1318014	1318023	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017365	TTTAA	2	10	1318031	1318040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017365	GAGCG	2	10	1331140	1331149	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017365	TGTGA	2	10	1353139	1353148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017365	AATTA	2	10	1353330	1353339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017365	ATTTT	2	10	1355825	1355834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017365	TTCAA	2	10	1357363	1357372	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017365	CTCAT	2	10	1357593	1357602	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017365	TCACT	2	10	1359072	1359081	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017365	TACTT	2	10	1359370	1359379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017365	TAAAT	2	10	1359768	1359777	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017365	TTTTA	2	10	1375423	1375432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017365	AAATT	2	10	1375937	1375946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017365	TATAA	2	10	1375973	1375982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017365	GTTTT	2	10	1387156	1387165	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017365	CACGA	2	10	1388548	1388557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_017365	TTACC	2	10	1389346	1389355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017365	TTTTA	2	10	1389677	1389686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017365	TAAGC	2	10	1401132	1401141	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017365	ATAAA	2	10	1441400	1441409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017365	TTATT	2	10	1446441	1446450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017365	TAATA	2	10	1459464	1459473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017365	TATTT	2	10	1462184	1462193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017365	AGTTT	2	10	1466455	1466464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017365	TGGGT	2	10	1469133	1469142	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017365	GATAA	2	10	1485342	1485351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017365	TTTAT	2	10	1487188	1487197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017365	GCTTG	2	10	1487223	1487232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_017365	TATAA	2	10	1497163	1497172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017365	GTGTT	2	10	1513298	1513307	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017365	TTTTA	2	10	1513458	1513467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017365	AATCA	2	10	1515362	1515371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_017365	TTGTT	2	10	1543879	1543888	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017365	TTAAA	2	10	1550412	1550421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017365	TTTTG	2	10	1564353	1564362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017365	ATAAA	2	10	1564448	1564457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017365	TAAAA	3	15	1569057	1569071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017365	TTAAA	2	10	1569483	1569492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.