MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GA	15	30	7356	7385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017362	TA	3	6	9909	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017362	CA	3	6	16804	16809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017362	GC	3	6	23220	23225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017362	GC	3	6	23611	23616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017362	AG	3	6	24206	24211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017362	CG	3	6	24291	24296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017362	TC	3	6	24358	24363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017362	AT	3	6	24749	24754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017362	GT	3	6	25116	25121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017362	GT	3	6	25626	25631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017362	TA	3	6	27559	27564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017362	GC	3	6	36816	36821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017362	TG	3	6	37060	37065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017362	TG	3	6	37145	37150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017362	AT	3	6	37502	37507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017362	AG	3	6	40699	40704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017362	GC	3	6	57974	57979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017362	AG	3	6	58102	58107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017362	GC	3	6	58611	58616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017362	GC	3	6	58688	58693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017362	CT	3	6	58793	58798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017362	AG	4	8	59222	59229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017362	GC	3	6	59672	59677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017362	GA	3	6	59688	59693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017362	GA	3	6	61685	61690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017362	GC	3	6	62345	62350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017362	AC	3	6	62759	62764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017362	AG	3	6	63625	63630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017362	TA	3	6	63839	63844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017362	GT	3	6	64783	64788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017362	AG	3	6	64953	64958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017362	TG	3	6	65851	65856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017362	AG	3	6	69473	69478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017362	TA	5	10	75796	75805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017362	AG	3	6	81380	81385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017362	AG	3	6	81404	81409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017362	AG	3	6	89747	89752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017362	TA	3	6	93240	93245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017362	TA	3	6	103744	103749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017362	CT	3	6	108999	109004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017362	GT	3	6	117217	117222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017362	TA	4	8	121739	121746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017362	AG	3	6	131398	131403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017362	GA	4	8	132720	132727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017362	CT	3	6	132976	132981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017362	GC	3	6	135924	135929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017362	TG	3	6	160051	160056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017362	TC	3	6	161061	161066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017362	TC	3	6	163237	163242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017362	AC	3	6	172673	172678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017362	GT	3	6	175210	175215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017362	GA	3	6	178787	178792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017362	AT	3	6	184430	184435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017362	TC	3	6	185444	185449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017362	TC	3	6	185671	185676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017362	TA	3	6	199094	199099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017362	TA	3	6	199330	199335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017362	AT	3	6	210121	210126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017362	TG	3	6	222485	222490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017362	AG	3	6	228533	228538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017362	AG	3	6	228707	228712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017362	GT	3	6	230094	230099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017362	AG	3	6	261039	261044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017362	TA	4	8	261075	261082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017362	AG	3	6	298292	298297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017362	AG	3	6	298964	298969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017362	AG	3	6	328940	328945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017362	TC	4	8	339569	339576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017362	AC	3	6	355598	355603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017362	TC	3	6	357975	357980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017362	TA	3	6	360103	360108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017362	AG	3	6	371639	371644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017362	CT	3	6	371852	371857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017362	AT	3	6	374539	374544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017362	AG	3	6	376225	376230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017362	CT	3	6	377064	377069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017362	AG	3	6	377154	377159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017362	AG	3	6	377340	377345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017362	CG	3	6	377374	377379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017362	AG	3	6	377682	377687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017362	GA	4	8	385769	385776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017362	GA	3	6	391289	391294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017362	TG	3	6	404105	404110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017362	GT	3	6	410201	410206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017362	AT	3	6	425893	425898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017362	TA	3	6	438717	438722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017362	GC	3	6	438809	438814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017362	AT	4	8	453248	453255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017362	AC	3	6	459793	459798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017362	CT	3	6	459887	459892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017362	GT	4	8	467055	467062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017362	AG	3	6	467073	467078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017362	GA	3	6	489168	489173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017362	TA	3	6	489821	489826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	AT	3	6	489992	489997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017362	TG	3	6	496645	496650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017362	CT	3	6	497132	497137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017362	CA	3	6	506823	506828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017362	AT	3	6	513243	513248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017362	AT	4	8	523162	523169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017362	AG	4	8	523375	523382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017362	GA	3	6	524955	524960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017362	GA	3	6	526175	526180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017362	AC	3	6	526756	526761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017362	GA	3	6	527067	527072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017362	AT	3	6	527555	527560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017362	TA	3	6	527561	527566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017362	CT	3	6	537140	537145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017362	AC	4	8	538550	538557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017362	TC	3	6	542857	542862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017362	GA	4	8	549569	549576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017362	AC	3	6	549853	549858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017362	TA	3	6	553958	553963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017362	AC	3	6	555388	555393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017362	AT	3	6	569257	569262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017362	AT	3	6	583292	583297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017362	TA	3	6	600727	600732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017362	TA	3	6	611847	611852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017362	CT	3	6	650486	650491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017362	TA	3	6	653728	653733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017362	AT	3	6	653734	653739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017362	CT	3	6	654990	654995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017362	TA	3	6	669289	669294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017362	GC	3	6	670254	670259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017362	AG	3	6	672797	672802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017362	CT	3	6	673557	673562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017362	AT	3	6	676718	676723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017362	TA	3	6	677560	677565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017362	AT	3	6	677579	677584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017362	TA	3	6	691595	691600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017362	CG	4	8	694703	694710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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134	NC_017362	AT	3	6	712010	712015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017362	TA	3	6	718305	718310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017362	GC	3	6	719573	719578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017362	AC	3	6	719595	719600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017362	TA	3	6	720319	720324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017362	TG	3	6	720653	720658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017362	GA	9	18	723725	723742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017362	AG	3	6	723746	723751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017362	GA	6	12	736704	736715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_017362	TG	3	6	744453	744458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017362	GA	3	6	748002	748007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017362	AG	4	8	754726	754733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017362	CT	4	8	755441	755448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017362	AG	3	6	764592	764597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017362	GA	3	6	776685	776690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017362	TA	3	6	776723	776728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017362	TC	3	6	795876	795881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017362	TG	3	6	801829	801834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017362	TC	3	6	804573	804578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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305	NC_017362	TA	3	6	1535905	1535910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_017362	TA	3	6	1535954	1535959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017362	GT	3	6	1537827	1537832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017362	CG	3	6	1554555	1554560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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311	NC_017362	GA	3	6	1556445	1556450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_017362	AC	3	6	1556679	1556684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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320	NC_017362	TG	3	6	1594502	1594507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
321	NC_017362	CT	3	6	1596865	1596870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
322	NC_017362	GT	3	6	1620762	1620767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.