MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	AG	3	6	5194	5199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017361	GA	7	14	7358	7371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017361	CA	3	6	16825	16830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017361	AG	3	6	26401	26406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017361	AG	3	6	41116	41121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017361	AG	3	6	59262	59267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017361	AG	3	6	61490	61495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017361	GC	3	6	62932	62937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017361	GT	3	6	63769	63774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017361	AT	3	6	69802	69807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017361	GT	3	6	79790	79795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017361	TA	4	8	79884	79891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017361	AT	3	6	79925	79930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017361	CT	3	6	82183	82188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017361	AG	3	6	86637	86642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017361	TC	3	6	93972	93977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017361	AG	3	6	95261	95266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017361	TA	3	6	98588	98593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017361	GT	3	6	105494	105499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017361	GA	3	6	131661	131666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017361	AT	3	6	134873	134878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017361	AG	3	6	135462	135467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017361	GC	3	6	138335	138340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017361	TG	3	6	154709	154714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017361	AG	3	6	164260	164265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017361	TC	3	6	166547	166552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017361	AG	3	6	169002	169007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017361	TC	3	6	170002	170007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017361	GA	3	6	182297	182302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017361	TC	3	6	187289	187294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017361	TA	3	6	188028	188033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017361	AT	3	6	201898	201903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017361	TA	4	8	202028	202035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017361	TA	3	6	202065	202070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017361	TA	4	8	202406	202413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017361	AT	3	6	202897	202902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017361	AT	3	6	212949	212954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017361	TG	3	6	225319	225324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	CT	3	6	228480	228485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017361	GT	3	6	233405	233410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017361	TC	3	6	239576	239581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017361	AG	3	6	303818	303823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017361	CT	3	6	304092	304097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017361	AG	3	6	304490	304495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017361	AC	3	6	317555	317560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017361	AG	3	6	327051	327056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017361	AG	3	6	336176	336181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017361	AG	3	6	345164	345169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017361	AG	3	6	359836	359841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017361	CT	3	6	359847	359852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017361	CT	3	6	360186	360191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017361	AG	3	6	362535	362540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017361	AT	3	6	374418	374423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017361	TC	3	6	374710	374715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017361	TA	3	6	379269	379274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017361	TC	3	6	379748	379753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017361	AG	3	6	382916	382921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017361	GA	4	8	392811	392818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017361	GT	3	6	415126	415131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017361	GC	3	6	416194	416199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017361	AG	3	6	421523	421528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017361	AG	3	6	429959	429964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017361	TA	3	6	443867	443872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017361	GC	3	6	443957	443962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017361	TA	3	6	458189	458194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017361	CT	3	6	461654	461659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017361	AG	3	6	472240	472245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017361	CA	3	6	484078	484083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017361	AG	3	6	494650	494655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017361	TA	3	6	495793	495798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017361	GA	3	6	496445	496450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017361	TA	3	6	502340	502345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017361	AG	3	6	506431	506436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017361	TA	3	6	512423	512428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017361	TG	3	6	512768	512773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017361	CA	3	6	513109	513114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017361	CT	3	6	513135	513140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017361	TC	3	6	513412	513417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017361	CT	3	6	513876	513881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017361	TA	3	6	514222	514227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017361	TA	3	6	527390	527395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017361	GA	3	6	530721	530726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017361	TA	3	6	532149	532154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017361	TG	3	6	532501	532506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017361	GA	3	6	532622	532627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017361	TA	3	6	540887	540892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017361	TA	3	6	547106	547111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017361	TC	3	6	559844	559849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017361	TG	3	6	561933	561938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	GT	3	6	567499	567504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017361	AT	3	6	567550	567555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017361	TA	3	6	567723	567728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017361	AG	3	6	588915	588920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017361	AT	3	6	589019	589024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017361	TG	3	6	589052	589057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017361	CT	3	6	589401	589406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017361	TC	3	6	610995	611000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017361	TA	3	6	617201	617206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017361	CT	8	16	617985	618000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017361	AG	3	6	632561	632566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017361	GT	3	6	655383	655388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017361	AG	3	6	655755	655760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017361	TC	3	6	656268	656273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017361	AC	3	6	656274	656279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017361	AG	3	6	656480	656485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017361	CT	3	6	659095	659100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017361	AC	3	6	663646	663651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017361	GA	3	6	666071	666076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017361	TA	3	6	688004	688009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017361	AC	3	6	695126	695131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017361	AT	3	6	699766	699771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017361	GT	3	6	706713	706718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017361	GC	3	6	723351	723356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017361	GT	3	6	727751	727756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017361	AG	3	6	730026	730031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017361	GT	4	8	730682	730689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017361	CT	6	12	730738	730749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017361	GT	4	8	735418	735425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017361	GA	3	6	751767	751772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017361	AG	3	6	766291	766296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017361	TC	3	6	771185	771190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017361	TC	3	6	780216	780221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017361	CT	3	6	789622	789627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017361	AG	3	6	798765	798770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017361	CT	3	6	810138	810143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017361	TC	3	6	817452	817457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017361	AT	3	6	820341	820346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017361	AT	3	6	820656	820661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017361	AG	3	6	820781	820786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017361	CT	3	6	822295	822300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017361	CA	3	6	823284	823289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017361	TA	3	6	827125	827130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017361	TA	3	6	827368	827373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017361	AC	3	6	830634	830639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017361	AG	3	6	849792	849797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017361	AC	4	8	851478	851485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017361	AG	3	6	857181	857186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017361	TC	3	6	857758	857763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017361	AC	3	6	863365	863370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017361	AC	3	6	863580	863585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_017361	CT	3	6	864845	864850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017361	TG	3	6	865916	865921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017361	GC	3	6	866310	866315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017361	TC	3	6	866530	866535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017361	AC	3	6	866542	866547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017361	CG	3	6	866822	866827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017361	CT	3	6	866830	866835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_017361	AT	3	6	871467	871472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017361	AT	3	6	876205	876210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017361	GT	3	6	876698	876703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017361	AT	3	6	898214	898219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017361	GT	3	6	1525241	1525246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017361	TA	3	6	1525348	1525353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017361	CT	3	6	1526138	1526143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
306	NC_017361	CT	3	6	1526463	1526468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
307	NC_017361	CG	3	6	1526821	1526826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
308	NC_017361	CG	3	6	1527305	1527310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
309	NC_017361	AC	3	6	1546127	1546132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
310	NC_017361	CA	3	6	1546174	1546179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_017361	TA	3	6	1549964	1549969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017361	AG	3	6	1559854	1559859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017361	GA	3	6	1566422	1566427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_017361	AG	3	6	1617739	1617744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
320	NC_017361	AG	4	8	1630047	1630054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
321	NC_017361	CA	3	6	1649001	1649006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
322	NC_017361	CT	3	6	1652013	1652018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.