MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 4561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017361	TAAAAA	2	12	168712	168723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017361	TTA	2	6	168742	168747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017361	A	6	6	168779	168784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017361	ATTT	2	8	168791	168798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017361	TTCT	2	8	168799	168806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_017361	A	6	6	168809	168814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017361	GAT	2	6	168853	168858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017361	GCTA	2	8	168914	168921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_017361	A	6	6	168924	168929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017361	A	6	6	168944	168949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017361	A	8	8	168951	168958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017361	ATCA	2	8	168991	168998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017361	AG	3	6	169002	169007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017361	AATG	2	8	169011	169018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017361	TTTGT	2	10	169026	169035	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017361	TAG	2	6	169054	169059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017361	AGGCGA	2	12	169063	169074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_017361	AAT	2	6	169147	169152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017361	AAG	2	6	169188	169193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017361	TC	3	6	170002	170007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_017361	CTT	2	6	175918	175923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017361	CAA	2	6	178204	178209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017361	T	6	6	178823	178828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017361	AGCG	2	8	178857	178864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_017361	ATA	2	6	178865	178870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017361	ATT	2	6	178915	178920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017361	TTA	2	6	179004	179009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017361	TAAA	2	8	179091	179098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017361	T	6	6	179108	179113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017361	TAA	2	6	179115	179120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017361	TCA	2	6	179162	179167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017361	AAAC	2	8	179168	179175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017361	TTA	2	6	182166	182171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017361	T	8	8	182199	182206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017361	TTA	2	6	182215	182220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017361	GA	3	6	182297	182302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017361	AAAG	2	8	182312	182319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017361	TC	3	6	187289	187294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017361	AACG	2	8	187341	187348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_017361	TA	3	6	188028	188033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017361	AAT	2	6	188122	188127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017361	ATC	2	6	188291	188296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017361	CAA	2	6	188309	188314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017361	AAG	2	6	188368	188373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017361	GTG	2	6	188432	188437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017361	ACA	2	6	188452	188457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017361	ATCA	2	8	188480	188487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_017361	T	6	6	188543	188548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017361	A	6	6	188573	188578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017361	AAT	2	6	188581	188586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017361	AAC	2	6	190653	190658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017361	A	6	6	194337	194342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017361	TTCAA	2	10	194350	194359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
554	NC_017361	CTA	2	6	194390	194395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017361	A	7	7	194437	194443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017361	T	6	6	194478	194483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017361	TAA	2	6	194498	194503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017361	ACC	2	6	194513	194518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017361	ACGA	2	8	197137	197144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017361	TAA	2	6	197150	197155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017361	A	6	6	198348	198353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017361	CAA	2	6	198366	198371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017361	CAA	2	6	199414	199419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017361	ATT	2	6	201836	201841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017361	TAAAG	2	10	201844	201853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017361	GAT	2	6	201858	201863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017361	ATTA	2	8	201870	201877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017361	AT	3	6	201898	201903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017361	TAT	3	9	201901	201909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017361	GAT	2	6	201963	201968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017361	ATG	2	6	201982	201987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017361	TA	4	8	202028	202035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017361	TCT	2	6	202055	202060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017361	TA	3	6	202065	202070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017361	ATT	2	6	202080	202085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017361	ATA	2	6	202089	202094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017361	CTTT	2	8	202123	202130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017361	ATAA	2	8	202142	202149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017361	TAT	2	6	202155	202160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017361	TAT	2	6	202185	202190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017361	T	6	6	202190	202195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017361	ACT	2	6	202196	202201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017361	TAG	2	6	202240	202245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017361	A	6	6	202256	202261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017361	TCAA	2	8	202271	202278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017361	T	6	6	202325	202330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017361	AAG	2	6	202342	202347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017361	AAAC	2	8	202360	202367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_017361	TA	4	8	202406	202413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017361	ACC	2	6	202424	202429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_017361	TAT	2	6	202880	202885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017361	AT	3	6	202897	202902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017361	T	6	6	202905	202910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017361	TTG	2	6	202917	202922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017361	T	6	6	206077	206082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017361	TAC	2	6	206084	206089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017361	AAACA	2	10	206154	206163	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
598	NC_017361	AAG	2	6	207354	207359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017361	T	14	14	208616	208629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017361	ATA	2	6	208666	208671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017361	A	6	6	208684	208689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017361	T	7	7	210082	210088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017361	ATT	2	6	212073	212078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017361	T	6	6	212131	212136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017361	AT	3	6	212949	212954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017361	TTA	2	6	212958	212963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017361	A	7	7	212963	212969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017361	TATAAT	2	12	212980	212991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017361	GTTT	2	8	213142	213149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017361	CCA	2	6	213166	213171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017361	A	7	7	213215	213221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017361	TTA	2	6	213228	213233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017361	TAA	2	6	213282	213287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017361	TTGGT	2	10	213315	213324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017361	GGCGTT	2	12	213337	213348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
616	NC_017361	AAAAAC	2	12	213349	213360	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_017361	ATTTT	2	10	216447	216456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017361	A	6	6	216474	216479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017361	A	6	6	218179	218184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017361	GTA	2	6	220092	220097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017361	TTTG	2	8	220107	220114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017361	ATT	2	6	220127	220132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017361	ATCC	2	8	220466	220473	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_017361	ACTTTA	2	12	220475	220486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
625	NC_017361	TTA	2	6	221319	221324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017361	TTAA	2	8	221328	221335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017361	T	7	7	221914	221920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017361	ATT	2	6	221924	221929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017361	TTA	2	6	221933	221938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017361	ATGC	2	8	221963	221970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017361	AAT	2	6	221992	221997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017361	ATTT	2	8	222020	222027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017361	TTA	2	6	222032	222037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017361	G	6	6	222543	222548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017361	T	6	6	222570	222575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017361	TAA	2	6	223850	223855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017361	GAGC	2	8	224878	224885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
638	NC_017361	TAA	2	6	224888	224893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017361	GTT	2	6	224926	224931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017361	GAT	3	9	224984	224992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017361	TG	3	6	225319	225324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017361	A	6	6	226763	226768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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