MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 4101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017360	CTT	2	6	203019	203024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017360	CTT	2	6	203034	203039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017360	T	6	6	203059	203064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017360	TAAAA	3	15	203072	203086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017360	GAT	2	6	203193	203198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017360	ATT	2	6	203263	203268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017360	T	6	6	203271	203276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017360	CCT	2	6	203328	203333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017360	T	7	7	203411	203417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017360	GTT	2	6	203428	203433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017360	TGC	2	6	203472	203477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017360	TTAAA	2	10	203501	203510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017360	A	7	7	203565	203571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017360	ATT	2	6	204336	204341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017360	TTA	2	6	204362	204367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017360	T	6	6	204524	204529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017360	AAT	2	6	204555	204560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017360	T	6	6	204574	204579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017360	ATT	2	6	207051	207056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017360	GGT	2	6	208678	208683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017360	TAT	2	6	208726	208731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017360	TGG	2	6	208770	208775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017360	ATGC	2	8	208867	208874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_017360	TGG	2	6	208883	208888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017360	GTG	2	6	208999	209004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017360	ACC	2	6	209031	209036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017360	GGT	2	6	209044	209049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017360	A	7	7	209165	209171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017360	T	8	8	209185	209192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017360	AAT	2	6	209206	209211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017360	TAA	2	6	209275	209280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017360	TGT	2	6	209334	209339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017360	A	6	6	209365	209370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017360	ATT	2	6	209399	209404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017360	T	7	7	209417	209423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017360	A	6	6	209428	209433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017360	A	6	6	209444	209449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017360	TGT	2	6	209483	209488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017360	TTTTA	2	10	209507	209516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017360	TC	3	6	209552	209557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017360	C	6	6	209579	209584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_017360	A	6	6	209585	209590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017360	T	7	7	209595	209601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017360	ACTA	2	8	209637	209644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_017360	A	6	6	209649	209654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017360	AGT	2	6	209718	209723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017360	AAAAAG	2	12	209734	209745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017360	C	6	6	209752	209757	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
549	NC_017360	A	7	7	209771	209777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017360	T	7	7	212101	212107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017360	T	7	7	212125	212131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017360	ATTTT	2	10	212176	212185	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017360	AAGAA	2	10	212237	212246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017360	TAA	3	9	213912	213920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017360	ATAA	2	8	214303	214310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017360	ATA	2	6	214392	214397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017360	ATT	2	6	214412	214417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017360	CAA	2	6	214480	214485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017360	T	6	6	214489	214494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017360	ATTC	2	8	214506	214513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_017360	GAA	2	6	214541	214546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017360	A	6	6	217332	217337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017360	T	6	6	217359	217364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017360	AGG	2	6	217365	217370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017360	GCTTT	2	10	218223	218232	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_017360	T	6	6	218230	218235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017360	AC	3	6	218253	218258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_017360	T	7	7	218291	218297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017360	ATA	2	6	218301	218306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017360	TTAA	2	8	218320	218327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017360	AGTT	2	8	221266	221273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017360	CA	3	6	221327	221332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017360	CTG	2	6	221348	221353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017360	A	6	6	222922	222927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017360	AAACAC	2	12	222962	222973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017360	AATC	2	8	227370	227377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_017360	TTTCTT	2	12	227593	227604	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
578	NC_017360	A	6	6	227643	227648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017360	A	6	6	227685	227690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017360	GTT	2	6	230028	230033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017360	AAATC	2	10	230499	230508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_017360	TTTGTT	2	12	230524	230535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017360	AAC	2	6	230682	230687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017360	ATT	2	6	230704	230709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017360	CAT	2	6	230713	230718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017360	TC	3	6	234061	234066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017360	AAATT	2	10	234773	234782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017360	TTA	2	6	234957	234962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017360	ATT	2	6	234970	234975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017360	CAT	2	6	234988	234993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017360	ATA	2	6	235056	235061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017360	T	7	7	235725	235731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017360	CCT	2	6	243175	243180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017360	CTT	2	6	243194	243199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017360	CTT	2	6	243221	243226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017360	ATC	2	6	243228	243233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017360	CAC	2	6	243246	243251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_017360	A	6	6	243261	243266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017360	T	6	6	243320	243325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017360	TCA	2	6	243388	243393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017360	CAC	2	6	243471	243476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017360	GTC	2	6	243618	243623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017360	A	6	6	243635	243640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017360	TCA	2	6	243660	243665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017360	TGCT	2	8	243667	243674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_017360	T	6	6	243726	243731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017360	ATAA	2	8	243806	243813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017360	AT	4	8	243913	243920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017360	AAT	2	6	243934	243939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017360	TTA	2	6	243990	243995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017360	AAT	2	6	244066	244071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017360	A	6	6	244116	244121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017360	T	6	6	244257	244262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017360	AG	3	6	244263	244268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017360	TCT	3	9	244341	244349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017360	TTTA	2	8	244472	244479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017360	ATC	2	6	244646	244651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017360	CAAA	2	8	244681	244688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_017360	AAT	2	6	244738	244743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017360	T	7	7	244778	244784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017360	CTT	2	6	244789	244794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017360	TTTG	2	8	244845	244852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017360	CTG	2	6	244863	244868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017360	ATT	2	6	244943	244948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017360	GAA	2	6	244965	244970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017360	ATA	2	6	245038	245043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017360	T	6	6	245077	245082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017360	AAAT	2	8	245144	245151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017360	TTC	2	6	245206	245211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017360	GTT	3	9	245221	245229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017360	T	6	6	245266	245271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017360	ATA	2	6	245278	245283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017360	TTGT	2	8	245356	245363	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017360	TTCG	2	8	245416	245423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
635	NC_017360	TAA	2	6	245433	245438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017360	TAT	2	6	245463	245468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017360	A	7	7	245508	245514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017360	T	6	6	245517	245522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017360	GAT	2	6	245530	245535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017360	T	7	7	245602	245608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017360	TAA	2	6	245660	245665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_017360	T	6	6	248621	248626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_017360	T	6	6	248636	248641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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