MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Sat464 chromosome

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017359	GCTTT	2	10	11396	11405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017359	TAGGG	2	10	20680	20689	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017359	ATACC	2	10	23017	23026	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017359	ATTAT	2	10	53149	53158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017359	TTAAA	2	10	53203	53212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017359	ACAAA	2	10	53232	53241	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017359	TTTTA	2	10	63739	63748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017359	TTACA	2	10	65624	65633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017359	AAAAC	2	10	69199	69208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017359	AGATA	2	10	79854	79863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017359	TAAAA	2	10	79923	79932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017359	GGCTT	2	10	84319	84328	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017359	AATTT	2	10	89022	89031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017359	CAAAA	2	10	95702	95711	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017359	TTAAT	2	10	104570	104579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017359	CAATC	2	10	113828	113837	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017359	ATAGT	2	10	138949	138958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017359	CAAAT	2	10	145674	145683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017359	AACAA	2	10	152930	152939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017359	TTTAA	2	10	169991	170000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017359	AGAGG	2	10	176647	176656	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017359	TTTGA	2	10	191903	191912	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017359	TTGTT	2	10	193436	193445	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017359	AAACA	2	10	194477	194486	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017359	AAGCG	2	10	211868	211877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017359	AAAAC	2	10	212271	212280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017359	AACAG	2	10	213702	213711	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017359	TAAAA	2	10	225837	225846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017359	AAATT	2	10	236661	236670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017359	CAATC	2	10	245718	245727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017359	AAATA	2	10	264407	264416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017359	GTTTT	2	10	270021	270030	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017359	AAGTT	2	10	320127	320136	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017359	AAAAC	2	10	349879	349888	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017359	AAAGG	2	10	409474	409483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017359	TTAAT	2	10	411085	411094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017359	ACCTT	2	10	415889	415898	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017359	ATAAA	2	10	421290	421299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017359	AAAAT	2	10	421324	421333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017359	GTTTT	2	10	429364	429373	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017359	TAACA	2	10	442215	442224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017359	AATAA	2	10	443604	443613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017359	TAAAA	2	10	443698	443707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017359	AAAAT	2	10	448346	448355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017359	TATCC	2	10	458611	458620	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017359	AAAAT	2	10	467239	467248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017359	TTAAA	2	10	471960	471969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017359	TAAAA	2	10	491167	491176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017359	TAAAA	2	10	497136	497145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017359	TTTAA	2	10	513382	513391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017359	ACAAA	2	10	556007	556016	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017359	ATAAA	2	10	561884	561893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017359	TGAGA	2	10	561919	561928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017359	TAAAA	2	10	571108	571117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017359	AAAGA	2	10	589138	589147	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017359	TTTAA	2	10	630926	630935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017359	TAGAA	2	10	646884	646893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017359	GTTTT	2	10	657425	657434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017359	TTAAT	2	10	660609	660618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017359	AAACA	2	10	665294	665303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017359	CTTTT	2	10	666441	666450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017359	TAAAA	2	10	672580	672589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017359	GGTTT	2	10	674972	674981	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017359	ATTAA	2	10	710336	710345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017359	AAATT	2	10	733990	733999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017359	CCTTA	2	10	764967	764976	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017359	TCGTT	2	10	786563	786572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017359	TTTAA	2	10	804707	804716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017359	AACTT	2	10	807107	807116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017359	AAGAA	2	10	811018	811027	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017359	TTGTT	2	10	816015	816024	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017359	TTAAA	2	10	816126	816135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017359	TTAAT	2	10	839516	839525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017359	TTTTA	2	10	841390	841399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017359	ATTTT	2	10	841583	841592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017359	AGCCT	2	10	846867	846876	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017359	AGTTA	2	10	855170	855179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017359	AAACT	2	10	859700	859709	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017359	TATAA	2	10	866042	866051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017359	AAAAG	2	10	879019	879028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017359	ATTGG	2	10	881321	881330	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017359	TAAAA	2	10	887837	887846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017359	GCGTG	2	10	895894	895903	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017359	GCGTG	2	10	896166	896175	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017359	TCAAG	2	10	918958	918967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017359	TTTAG	2	10	930494	930503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017359	CTTAA	2	10	931346	931355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017359	ATTCA	2	10	931474	931483	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017359	TGGGT	2	10	960831	960840	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017359	CCGCT	2	10	962133	962142	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017359	ATTTT	2	10	983916	983925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017359	TTCAA	2	10	985424	985433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017359	CTCAT	2	10	985654	985663	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017359	TCACT	2	10	987132	987141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017359	TACTT	2	10	987433	987442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017359	TAAAT	2	10	987827	987836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017359	TTAAA	2	10	987860	987869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017359	TTTGA	2	10	988369	988378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017359	AGCGA	2	10	991639	991648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017359	AACGA	2	10	991739	991748	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017359	ATTTA	2	10	992325	992334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017359	CAACA	2	10	993030	993039	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017359	TAGGT	2	10	993882	993891	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017359	AAAAT	2	10	1013907	1013916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017359	AATTG	2	10	1031304	1031313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017359	ATAAA	2	10	1035365	1035374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017359	TAAAA	2	10	1046317	1046326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017359	TGAAA	2	10	1060644	1060653	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017359	AAATC	2	10	1076034	1076043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017359	AAAAC	2	10	1080878	1080887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017359	ATTTT	2	10	1091006	1091015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017359	TTCAT	2	10	1092404	1092413	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017359	AAGAA	2	10	1107366	1107375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017359	TCTTA	2	10	1107414	1107423	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017359	GATTT	2	10	1110856	1110865	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017359	AATTT	2	10	1110892	1110901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017359	CACGA	2	10	1112226	1112235	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017359	TTACC	2	10	1113024	1113033	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017359	TTAAA	2	10	1121453	1121462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017359	AAAAG	2	10	1123044	1123053	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017359	GATTT	2	10	1129891	1129900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017359	AAAGC	2	10	1136141	1136150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017359	ATTTA	2	10	1144147	1144156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017359	TTAAT	2	10	1146909	1146918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017359	TATTT	2	10	1146945	1146954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017359	ATTTT	2	10	1149371	1149380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017359	AAATC	2	10	1152795	1152804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017359	AAACT	2	10	1162277	1162286	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017359	ACTTT	2	10	1165820	1165829	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017359	CTAGA	2	10	1179709	1179718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017359	CCTCC	2	10	1181950	1181959	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
132	NC_017359	AACAA	2	10	1209055	1209064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017359	ACAAA	2	10	1209216	1209225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017359	AAAAG	2	10	1218824	1218833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017359	TAAAT	2	10	1221009	1221018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017359	AGCCA	2	10	1221305	1221314	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017359	AATCA	2	10	1228497	1228506	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017359	TTTCA	2	10	1228689	1228698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017359	AATTG	2	10	1229346	1229355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017359	AAACT	2	10	1229669	1229678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017359	AAACA	2	10	1230026	1230035	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017359	CGCGC	2	10	1231854	1231863	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_017359	TGCTT	2	10	1234632	1234641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017359	CATGC	2	10	1234828	1234837	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017359	TAAGC	2	10	1252811	1252820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017359	TCTCA	2	10	1252896	1252905	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017359	AGTGA	2	10	1261854	1261863	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017359	TATAT	2	10	1278446	1278455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017359	TTATT	2	10	1279054	1279063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017359	AATAA	2	10	1279447	1279456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017359	ACAAA	2	10	1298165	1298174	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017359	GCATG	2	10	1298527	1298536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017359	AATTT	2	10	1337291	1337300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017359	ATTTT	2	10	1349420	1349429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017359	TTCAA	2	10	1350928	1350937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017359	CTCAT	2	10	1351158	1351167	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_017359	TCACT	2	10	1352636	1352645	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017359	TACTT	2	10	1352937	1352946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_017359	TAAAT	2	10	1353331	1353340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017359	TTAAA	2	10	1353364	1353373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017359	TTTGA	2	10	1354266	1354275	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017359	CAAAC	2	10	1361495	1361504	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017359	AAAGT	2	10	1361775	1361784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017359	GCTCT	2	10	1361971	1361980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_017359	TTTGC	2	10	1375738	1375747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017359	CACGA	2	10	1382995	1383004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_017359	TTACC	2	10	1383793	1383802	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_017359	ATAAA	2	10	1434916	1434925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017359	TTATT	2	10	1439958	1439967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017359	TAATA	2	10	1452785	1452794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017359	TATTT	2	10	1455505	1455514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017359	AGTTT	2	10	1459760	1459769	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017359	GATAA	2	10	1473009	1473018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017359	GCTTG	2	10	1474882	1474891	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017359	TTTGC	2	10	1481697	1481706	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_017359	TATAA	2	10	1486202	1486211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017359	GAAAA	2	10	1495552	1495561	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017359	GAAAA	2	10	1496674	1496683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017359	ATATT	2	10	1502314	1502323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017359	AATCA	2	10	1505057	1505066	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_017359	TTTTC	2	10	1509688	1509697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017359	CTTTT	2	10	1540761	1540770	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017359	TTTTG	2	10	1553973	1553982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017359	ATAAA	2	10	1554068	1554077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017359	GATAA	2	10	1558984	1558993	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017359	TTAAA	2	10	1559263	1559272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.