MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	CA	3	6	4908	4913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017358	CA	3	6	14512	14517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017358	AG	3	6	23261	23266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017358	TA	3	6	24886	24891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017358	AG	3	6	36603	36608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017358	GC	3	6	40247	40252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017358	AG	3	6	40391	40396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017358	CT	3	6	47805	47810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017358	GA	3	6	47885	47890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017358	TC	3	6	56368	56373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017358	AG	3	6	58089	58094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017358	GC	3	6	58364	58369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017358	AG	3	6	58939	58944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017358	GT	3	6	59017	59022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017358	AG	4	8	59424	59431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017358	AG	3	6	63951	63956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017358	AG	3	6	75781	75786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017358	GA	3	6	75842	75847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017358	AG	3	6	84178	84183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017358	AT	3	6	84224	84229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017358	TA	3	6	87506	87511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017358	CT	3	6	88603	88608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017358	GT	3	6	89579	89584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017358	TG	3	6	94459	94464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017358	CT	3	6	103015	103020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017358	AT	3	6	118278	118283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017358	CA	3	6	122879	122884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017358	AG	3	6	123846	123851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017358	TA	3	6	123885	123890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017358	CT	3	6	124852	124857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017358	GC	3	6	125146	125151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017358	GA	3	6	130161	130166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017358	TG	3	6	152221	152226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017358	CT	4	8	155648	155655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017358	AC	3	6	165062	165067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017358	AG	3	6	175751	175756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017358	TA	3	6	176489	176494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017358	TC	3	6	177022	177027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017358	TA	3	6	186583	186588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017358	TA	3	6	200185	200190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017358	GT	3	6	215478	215483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017358	AG	3	6	245226	245231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017358	TA	3	6	249690	249695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017358	CT	3	6	250656	250661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017358	CT	3	6	251499	251504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017358	TG	3	6	251625	251630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017358	AC	3	6	252874	252879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017358	TC	3	6	254930	254935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017358	TG	3	6	255734	255739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017358	CT	3	6	255803	255808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017358	TG	3	6	255809	255814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017358	CT	4	8	256158	256165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017358	CT	3	6	256301	256306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017358	AG	4	8	256486	256493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017358	TC	3	6	256558	256563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017358	TC	5	10	256706	256715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017358	CT	3	6	256780	256785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017358	CA	3	6	263324	263329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017358	TA	3	6	263469	263474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017358	AT	4	8	266331	266338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017358	TA	4	8	266351	266358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017358	TC	4	8	266361	266368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017358	AT	3	6	269632	269637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017358	AG	3	6	276533	276538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017358	TG	3	6	277300	277305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017358	TG	3	6	281625	281630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017358	GT	3	6	289301	289306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017358	GA	3	6	321756	321761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017358	TC	3	6	357472	357477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017358	AG	3	6	357493	357498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017358	AT	3	6	357527	357532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017358	TG	4	8	358292	358299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017358	AG	3	6	358473	358478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017358	AG	3	6	358826	358831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017358	TG	3	6	382897	382902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017358	AG	3	6	389591	389596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017358	CT	3	6	398740	398745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017358	AG	3	6	398771	398776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017358	CT	3	6	416431	416436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017358	TA	5	10	433636	433645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017358	AG	3	6	435391	435396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017358	AG	3	6	436846	436851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017358	AG	3	6	437020	437025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017358	GA	4	8	445420	445427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017358	CT	3	6	449252	449257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017358	AC	3	6	451494	451499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017358	GA	3	6	464170	464175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017358	GA	3	6	466311	466316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017358	TA	3	6	500706	500711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017358	GC	3	6	500798	500803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017358	AT	4	8	515431	515438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017358	AC	3	6	516337	516342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017358	AG	3	6	518734	518739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017358	TA	3	6	528426	528431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017358	TA	3	6	531898	531903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017358	AG	3	6	532173	532178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017358	GC	3	6	532185	532190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017358	GA	3	6	547282	547287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017358	CA	3	6	547826	547831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017358	TG	3	6	553561	553566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017358	AG	3	6	555914	555919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017358	AG	3	6	556354	556359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017358	GT	3	6	556379	556384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017358	CA	3	6	556721	556726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017358	AT	3	6	565393	565398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017358	CT	3	6	572385	572390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017358	AC	3	6	572433	572438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017358	CT	3	6	572706	572711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017358	CT	3	6	572823	572828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017358	TC	3	6	573268	573273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017358	AG	4	8	578712	578719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017358	GA	3	6	580289	580294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017358	AG	3	6	580313	580318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017358	AG	3	6	582457	582462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017358	CT	3	6	582653	582658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017358	GT	3	6	582700	582705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017358	GA	3	6	583357	583362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017358	AT	3	6	589124	589129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017358	TG	3	6	589134	589139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017358	CT	4	8	593395	593402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017358	TG	3	6	594648	594653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017358	AC	4	8	596612	596619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017358	AC	4	8	596634	596641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017358	AG	3	6	600578	600583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017358	AT	3	6	600683	600688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017358	GT	4	8	606936	606943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017358	AC	3	6	607438	607443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017358	TA	3	6	611501	611506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017358	AC	3	6	612931	612936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017358	TA	3	6	616910	616915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017358	TC	3	6	640870	640875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017358	GT	3	6	648291	648296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017358	TC	3	6	648550	648555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017358	AG	3	6	648820	648825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017358	CT	3	6	649313	649318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017358	TG	3	6	649592	649597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017358	AT	3	6	670865	670870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017358	TC	3	6	671449	671454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017358	GC	3	6	678761	678766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017358	CA	3	6	678860	678865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017358	CT	7	14	698657	698670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_017358	TA	3	6	728885	728890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017358	GA	3	6	742722	742727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017358	TC	3	6	742798	742803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017358	TA	3	6	750042	750047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017358	TA	3	6	750094	750099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017358	TA	3	6	750967	750972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017358	GA	3	6	802311	802316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.