MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Cuz20 chromosome

Total Repeats: 513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017358	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017358	TAAA	2	8	4690	4697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017358	CAAA	2	8	5391	5398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017358	ATAA	2	8	7484	7491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017358	ATTC	2	8	7687	7694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017358	TTAA	2	8	11503	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017358	AGTT	2	8	14451	14458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017358	ATCA	2	8	20551	20558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017358	CTCC	2	8	20618	20625	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017358	GTAT	2	8	22997	23004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017358	ATTA	2	8	23064	23071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017358	GGTT	2	8	27943	27950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017358	TTGA	2	8	50065	50072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017358	TTTA	2	8	55514	55521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017358	GCGG	2	8	55552	55559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017358	TAAT	2	8	55614	55621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017358	TTGT	2	8	55692	55699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017358	GATC	2	8	56549	56556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017358	TACT	2	8	57236	57243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017358	TTGC	2	8	58263	58270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017358	TTTA	2	8	58462	58469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017358	AAAG	2	8	58902	58909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017358	AACA	2	8	60368	60375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017358	TCTG	2	8	62688	62695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017358	CAAA	2	8	63818	63825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017358	TCAC	2	8	69049	69056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017358	CATG	2	8	70465	70472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017358	CCCA	2	8	73265	73272	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017358	TTAG	2	8	73470	73477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017358	CTTT	2	8	73485	73492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017358	AACT	2	8	73578	73585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017358	GGTG	2	8	83971	83978	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017358	TCCC	2	8	84041	84048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_017358	AAAG	2	8	86381	86388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017358	TTTC	2	8	86651	86658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017358	TTCA	2	8	89537	89544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017358	TTTA	2	8	89566	89573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017358	AATC	2	8	97818	97825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017358	CCAA	2	8	99886	99893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017358	AAAG	2	8	102591	102598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017358	AAGC	2	8	103074	103081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017358	CCGC	2	8	103097	103104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017358	CTTT	2	8	105000	105007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017358	AAAT	2	8	105010	105017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017358	ATTT	2	8	106542	106549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017358	AATT	2	8	106578	106585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017358	TCAT	2	8	111227	111234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017358	TTAG	2	8	118391	118398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017358	AAAG	2	8	121296	121303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017358	AAAG	2	8	121792	121799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017358	GAAG	2	8	121849	121856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017358	AATC	2	8	123023	123030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017358	AAAT	2	8	124802	124809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017358	TTGT	2	8	125566	125573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017358	TCTT	2	8	129789	129796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017358	CAAA	2	8	130129	130136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017358	TAAG	2	8	133690	133697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017358	TTTG	2	8	143345	143352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017358	ATTT	2	8	152158	152165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017358	TCAA	2	8	153569	153576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017358	CTTG	2	8	153908	153915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017358	TTTA	2	8	167574	167581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017358	GCGT	2	8	167598	167605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017358	GATT	2	8	170638	170645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017358	CATT	2	8	175845	175852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017358	TCTT	2	8	176268	176275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017358	CTTG	2	8	177446	177453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017358	TCGT	2	8	177506	177513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017358	TGCA	2	8	177750	177757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017358	GCTT	2	8	186542	186549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017358	GCGT	2	8	186596	186603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017358	CTTT	2	8	193900	193907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017358	ATTA	2	8	193933	193940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017358	AAAC	2	8	200168	200175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017358	TTGA	2	8	200332	200339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017358	TCAT	2	8	201398	201405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017358	TAAG	2	8	217213	217220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017358	TTAG	2	8	220385	220392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017358	CTTT	2	8	220400	220407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017358	CTAG	2	8	220434	220441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017358	CCAT	2	8	247386	247393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017358	TTGC	2	8	250494	250501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017358	ATTC	2	8	250945	250952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017358	TCTT	2	8	251183	251190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017358	TAGC	2	8	251386	251393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017358	GTTC	2	8	251434	251441	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017358	TTCT	2	8	251447	251454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017358	TCAA	2	8	251724	251731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017358	TTGA	2	8	252668	252675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017358	TCTT	2	8	252686	252693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017358	TTTA	2	8	253201	253208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017358	TTGA	2	8	253543	253550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017358	TGAT	2	8	253739	253746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017358	CGTT	2	8	254267	254274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017358	ATTT	2	8	254431	254438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017358	CCAT	2	8	254951	254958	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017358	ACCC	2	8	255486	255493	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_017358	GCTT	2	8	256615	256622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017358	AATA	2	8	256792	256799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017358	TTCT	2	8	256935	256942	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017358	TTCT	2	8	257196	257203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017358	ATCA	2	8	257389	257396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017358	CTTT	2	8	257459	257466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017358	TTGT	2	8	257657	257664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017358	TAAA	2	8	257691	257698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017358	CTTT	2	8	257718	257725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017358	TCAA	2	8	262710	262717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017358	TAAA	2	8	262730	262737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017358	ATAA	2	8	263715	263722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017358	TAAA	2	8	263752	263759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017358	TTAT	2	8	266305	266312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017358	TTTA	2	8	266586	266593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017358	ATCA	2	8	276600	276607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017358	ATCC	2	8	276809	276816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017358	AAAG	2	8	276866	276873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017358	ATTG	2	8	277178	277185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017358	TATT	2	8	278320	278327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017358	CGCT	2	8	284230	284237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017358	ATTT	2	8	284239	284246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017358	AAAT	2	8	284519	284526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017358	TGAT	2	8	284585	284592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017358	GAAA	2	8	287993	288000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017358	TTAT	2	8	289338	289345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017358	TTTA	2	8	290900	290907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017358	TCAA	2	8	296623	296630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017358	TAAA	2	8	309186	309193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017358	TAAT	2	8	311812	311819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017358	AAAG	2	8	311857	311864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017358	GCTT	2	8	321636	321643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017358	TGAT	2	8	321681	321688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017358	AGGG	2	8	321909	321916	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017358	ACGA	2	8	321981	321988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017358	GAAA	2	8	357769	357776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017358	ATGA	2	8	358188	358195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017358	GCCA	2	8	358398	358405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017358	AACA	2	8	365175	365182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017358	TCAG	2	8	373526	373533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017358	TGAG	2	8	383011	383018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017358	TTGG	2	8	385726	385733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017358	TTGG	2	8	388171	388178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017358	AAAT	2	8	394312	394319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017358	CAAG	2	8	397800	397807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017358	CAAT	2	8	402563	402570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017358	TGAA	2	8	406865	406872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017358	CTAA	2	8	406873	406880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017358	AGGA	2	8	416299	416306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017358	CATG	3	12	416561	416572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017358	TAAA	2	8	417454	417461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017358	TTAA	2	8	428950	428957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017358	TAAA	2	8	428961	428968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017358	AAAT	2	8	433485	433492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017358	AGAA	2	8	436920	436927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017358	TCAA	2	8	1489736	1489743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_017358	CTCG	2	8	1560160	1560167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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