MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 908 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017357	ATTATA	2	12	9290	9301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017357	AAACAC	2	12	17861	17872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017357	ACTTAG	2	12	43556	43567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017357	AGAAAA	2	12	59122	59133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017357	TACAAA	2	12	92780	92791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017357	GATAAC	2	12	111261	111272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017357	ATGATA	2	12	126612	126623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017357	GTTTTA	2	12	130005	130016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017357	TTGTTT	2	12	151605	151616	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017357	TTTCAC	2	12	162617	162628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017357	TAAAAA	2	12	166527	166538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017357	GGCGTT	2	12	211728	211739	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017357	AAAAAC	2	12	211740	211751	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017357	TAATTA	2	12	218831	218842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017357	ACTTTA	2	12	218878	218889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017357	ATTAAA	2	12	225205	225216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017357	ATTTTA	2	12	246448	246459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017357	AAATTA	2	12	246483	246494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017357	AAATTC	2	12	261541	261552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017357	GTTTGC	2	12	313330	313341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017357	TAGAAA	2	12	323539	323550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017357	TTTCTT	2	12	327818	327829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017357	GTTTTT	2	12	355800	355811	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017357	TTTTAT	2	12	370634	370645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017357	AAAATA	2	12	427913	427924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017357	AAATTT	2	12	463555	463566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017357	TATTTT	2	12	465301	465312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017357	TAAAAA	2	12	469959	469970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017357	TTTTAA	2	12	488101	488112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017357	TTGTAA	2	12	510505	510516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017357	ATTTAA	2	12	516804	516815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017357	TGTTAT	2	12	517660	517671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017357	TTTAAA	2	12	535829	535840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017357	TGGGCA	2	12	538497	538508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017357	AGCTAA	2	12	542684	542695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017357	ATTTTA	2	12	569320	569331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017357	AAAAAT	2	12	684953	684964	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017357	AGCGCA	2	12	693696	693707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017357	AAATTA	2	12	720874	720885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017357	TAAGGG	2	12	739378	739389	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017357	GAATTT	2	12	739630	739641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017357	TAGAAT	2	12	778146	778157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017357	ATTATA	2	12	807874	807885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017357	AAAATA	2	12	879845	879856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017357	TGCATT	2	12	884645	884656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017357	TGCATT	2	12	886494	886505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017357	ATTATA	2	12	908074	908085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017357	ATTGAA	2	12	915577	915588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017357	ATAAAA	2	12	925403	925414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017357	TTTGAA	2	12	982524	982535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017357	AATTAA	2	12	1032167	1032178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017357	ATCATA	2	12	1113609	1113620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017357	TAAAAA	2	12	1131694	1131705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017357	GCATTT	2	12	1135823	1135834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017357	TAAAAT	2	12	1137323	1137334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017357	TTTTAA	2	12	1142103	1142114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017357	ATTGGT	2	12	1146739	1146750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017357	ATCCTT	2	12	1161288	1161299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017357	GCGCAT	2	12	1161307	1161318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017357	TTGTAT	2	12	1163709	1163720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017357	AAACTT	2	12	1202884	1202895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017357	TTTTCT	2	12	1222714	1222725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017357	ATTTTT	2	12	1230660	1230671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017357	TACGCT	2	12	1232708	1232719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017357	AGAAAA	2	12	1248922	1248933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017357	TTTTTA	2	12	1260426	1260437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017357	CATACT	2	12	1291267	1291278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017357	AATTAC	2	12	1294909	1294920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017357	GTTTTA	2	12	1341977	1341988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017357	TTTCTT	2	12	1342025	1342036	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017357	CTTTAA	2	12	1344251	1344262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017357	AGCGGG	2	12	1353886	1353897	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017357	GTTTTA	2	12	1364063	1364074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017357	TAAAAA	2	12	1364852	1364863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017357	TAAATA	2	12	1526718	1526729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017357	TAGCGA	2	12	1547718	1547729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.