MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 4116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017355	ACG	2	6	1535542	1535547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017355	CCA	2	6	1535575	1535580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_017355	AGC	2	6	1535732	1535737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017355	AGAA	2	8	1535765	1535772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017355	AAC	2	6	1535835	1535840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017355	GAA	2	6	1535889	1535894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017355	TGA	2	6	1535948	1535953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017355	CAA	2	6	1535976	1535981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017355	TTA	2	6	1536019	1536024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017355	ATTTGT	2	12	1536043	1536054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017355	TAA	2	6	1536094	1536099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017355	GGA	2	6	1536123	1536128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017355	AACG	2	8	1536131	1536138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_017355	A	6	6	1536167	1536172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017355	TTA	2	6	1536183	1536188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017355	TAG	3	9	1536262	1536270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017355	TAA	2	6	1536287	1536292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017355	CT	3	6	1536348	1536353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_017355	CGA	2	6	1536383	1536388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017355	ATT	2	6	1536393	1536398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017355	A	6	6	1536402	1536407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017355	AG	3	6	1536455	1536460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017355	AG	3	6	1536530	1536535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017355	AGAGCA	2	12	1536560	1536571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4025	NC_017355	A	6	6	1536590	1536595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017355	CGAG	2	8	1536608	1536615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_017355	AG	3	6	1536720	1536725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017355	TCC	2	6	1538712	1538717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017355	TTC	2	6	1538739	1538744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017355	TG	3	6	1538771	1538776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017355	TGTCTT	2	12	1538787	1538798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4032	NC_017355	A	6	6	1538874	1538879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017355	TAA	2	6	1538893	1538898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017355	TAAA	2	8	1551550	1551557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017355	AGC	2	6	1551577	1551582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017355	A	9	9	1551609	1551617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017355	AG	3	6	1555714	1555719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017355	TGT	2	6	1555722	1555727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017355	T	6	6	1555782	1555787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017355	A	8	8	1558402	1558409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017355	G	8	8	1558410	1558417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017355	TGG	2	6	1558446	1558451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017355	GTT	2	6	1558452	1558457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017355	TTA	2	6	1558599	1558604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017355	T	6	6	1559294	1559299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017355	TGGTA	2	10	1559436	1559445	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017355	GTG	2	6	1559479	1559484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017355	AGCT	2	8	1559511	1559518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_017355	AAAC	2	8	1559520	1559527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_017355	TCA	2	6	1559575	1559580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017355	CAA	2	6	1559606	1559611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017355	TAA	2	6	1559636	1559641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017355	CCAA	2	8	1559646	1559653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_017355	T	6	6	1559693	1559698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017355	ATGG	2	8	1559715	1559722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017355	TTGTT	2	10	1560002	1560011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017355	ATC	2	6	1560033	1560038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017355	TG	3	6	1560073	1560078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017355	ATA	2	6	1560088	1560093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017355	TAG	2	6	1560101	1560106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017355	TGA	2	6	1560154	1560159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017355	AGG	2	6	1560227	1560232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017355	AG	3	6	1560280	1560285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017355	TGA	2	6	1560334	1560339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017355	T	6	6	1560418	1560423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017355	TGC	2	6	1560439	1560444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017355	CAA	2	6	1562534	1562539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017355	TC	3	6	1562545	1562550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_017355	CCT	2	6	1562931	1562936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_017355	T	6	6	1562944	1562949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017355	TAC	2	6	1563009	1563014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017355	TAC	2	6	1563028	1563033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017355	TTG	2	6	1563040	1563045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017355	T	6	6	1563984	1563989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017355	A	6	6	1564155	1564160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017355	GAA	2	6	1566482	1566487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017355	A	6	6	1566552	1566557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017355	T	6	6	1566567	1566572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017355	ATA	2	6	1567750	1567755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017355	CAA	2	6	1567787	1567792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_017355	CTTTT	2	10	1568469	1568478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_017355	T	6	6	1568519	1568524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017355	AATT	2	8	1568535	1568542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017355	T	8	8	1568541	1568548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017355	T	6	6	1568558	1568563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017355	TG	3	6	1569435	1569440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017355	TAAAAA	2	12	1571582	1571593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017355	A	8	8	1571615	1571622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017355	AG	3	6	1571638	1571643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017355	TTC	2	6	1573739	1573744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017355	T	7	7	1573760	1573766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017355	TCA	2	6	1573837	1573842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017355	TAA	2	6	1575977	1575982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017355	AAT	2	6	1576030	1576035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017355	TTTA	2	8	1576839	1576846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017355	AAT	2	6	1576883	1576888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017355	CAA	2	6	1579469	1579474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017355	TTTTG	2	10	1582707	1582716	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017355	TAT	2	6	1582719	1582724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017355	CAA	2	6	1584552	1584557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017355	ACC	2	6	1584578	1584583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017355	ATA	2	6	1585641	1585646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017355	A	6	6	1585699	1585704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017355	AAC	2	6	1585716	1585721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017355	TTA	2	6	1585769	1585774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017355	TAAAA	2	10	1586755	1586764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017355	T	6	6	1586798	1586803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017355	GGATA	2	10	1586908	1586917	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017355	ATT	2	6	1586939	1586944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017355	T	6	6	1586947	1586952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017355	TGA	2	6	1586979	1586984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017355	CCT	2	6	1587016	1587021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_017355	TTAAA	2	10	1587188	1587197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017355	A	8	8	1587252	1587259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017355	ATT	2	6	1588024	1588029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017355	T	6	6	1588249	1588254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.