MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	TC	3	6	4999	5004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017354	CA	3	6	16795	16800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017354	TC	3	6	29575	29580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017354	TA	3	6	35889	35894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017354	AG	3	6	35984	35989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017354	CT	3	6	71585	71590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017354	AG	4	8	72016	72023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017354	GC	3	6	72466	72471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017354	GA	3	6	75880	75885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017354	AC	3	6	75907	75912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017354	AG	3	6	76774	76779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017354	TA	3	6	76988	76993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017354	GA	3	6	77020	77025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017354	GC	3	6	77049	77054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017354	AG	3	6	77423	77428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017354	AG	3	6	78119	78124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017354	GA	3	6	78723	78728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017354	AG	3	6	82673	82678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017354	TA	5	10	88990	88999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	GT	3	6	89280	89285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017354	AT	3	6	95733	95738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017354	AG	3	6	95764	95769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017354	AG	3	6	95791	95796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017354	AG	3	6	104058	104063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017354	AT	3	6	104104	104109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017354	TA	3	6	107389	107394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017354	GT	3	6	109493	109498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017354	AT	3	6	114409	114414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017354	CA	3	6	142463	142468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017354	AG	3	6	143429	143434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017354	CT	3	6	144434	144439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017354	TC	3	6	175206	175211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017354	AC	3	6	184451	184456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017354	GT	4	8	186997	187004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017354	AG	3	6	187173	187178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017354	GA	3	6	193268	193273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017354	AG	3	6	198241	198246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017354	AG	3	6	198419	198424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017354	AG	3	6	198470	198475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017354	GC	3	6	198479	198484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017354	CT	9	18	219535	219552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017354	GC	3	6	221213	221218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017354	AT	3	6	224095	224100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	CG	3	6	225670	225675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017354	CT	3	6	225893	225898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017354	GA	3	6	226847	226852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017354	AC	3	6	226961	226966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017354	AG	3	6	230972	230977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017354	TG	3	6	236055	236060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017354	GT	3	6	243734	243739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017354	AG	3	6	249665	249670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017354	AC	3	6	250080	250085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017354	GA	3	6	276489	276494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017354	TC	3	6	281388	281393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017354	AG	3	6	313591	313596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017354	TA	3	6	335653	335658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017354	AG	3	6	342007	342012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017354	AG	3	6	350743	350748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017354	TC	4	8	352585	352592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017354	AG	3	6	352872	352877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017354	AC	3	6	368980	368985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017354	AT	3	6	387905	387910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017354	AG	3	6	389589	389594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017354	AG	3	6	391045	391050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017354	GA	4	8	399143	399150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017354	GA	3	6	415399	415404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017354	AT	3	6	439320	439325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017354	GA	3	6	439387	439392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017354	TA	3	6	452112	452117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017354	GC	3	6	452204	452209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017354	AT	3	6	466650	466655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017354	AT	3	6	468901	468906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017354	TA	3	6	477054	477059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017354	CT	3	6	477228	477233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017354	TC	3	6	480466	480471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017354	AT	3	6	491773	491778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	AG	3	6	529257	529262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	CT	3	6	530176	530181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017354	TG	3	6	556231	556236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017354	CA	3	6	567988	567993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017354	GA	3	6	570322	570327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017354	GA	3	6	572989	572994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	GT	3	6	575162	575167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017354	CT	3	6	587295	587300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017354	TG	3	6	588377	588382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017354	CT	3	6	589438	589443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017354	CT	3	6	589465	589470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017354	GC	3	6	589550	589555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017354	CT	4	8	589744	589751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017354	AT	3	6	594116	594121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017354	TC	3	6	599694	599699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017354	TC	3	6	600032	600037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017354	TC	3	6	600050	600055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017354	CT	3	6	600804	600809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017354	AG	3	6	633176	633181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	AG	3	6	633352	633357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017354	AG	3	6	635230	635235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017354	CT	3	6	640630	640635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017354	CT	3	6	655804	655809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017354	GT	3	6	673322	673327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017354	TA	3	6	682240	682245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	TG	3	6	698482	698487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017354	TA	3	6	717915	717920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017354	TC	4	8	718041	718048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017354	TA	3	6	733093	733098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017354	CT	4	8	745543	745550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017354	TG	3	6	771037	771042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017354	AT	3	6	788390	788395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017354	GA	3	6	790148	790153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017354	TC	3	6	790270	790275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017354	TA	7	14	790926	790939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017354	CT	3	6	791019	791024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017354	CT	3	6	791635	791640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017354	TA	3	6	819550	819555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017354	TG	3	6	823646	823651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017354	CT	3	6	823748	823753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017354	CT	3	6	824469	824474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017354	TG	4	8	834961	834968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017354	GT	3	6	834985	834990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017354	AC	3	6	835313	835318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017354	AG	3	6	836385	836390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017354	AG	3	6	847030	847035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017354	TC	3	6	847341	847346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017354	CT	3	6	848195	848200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017354	CA	3	6	848493	848498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017354	CT	3	6	849367	849372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017354	TC	4	8	850942	850949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017354	AT	4	8	851156	851163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017354	AT	3	6	860993	860998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017354	TG	3	6	867179	867184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017354	AG	3	6	876864	876869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017354	GC	3	6	876964	876969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017354	TG	3	6	883133	883138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017354	TC	5	10	883194	883203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017354	CT	3	6	884075	884080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017354	TC	3	6	900145	900150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017354	CG	3	6	900224	900229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017354	AC	3	6	906577	906582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017354	TC	3	6	906607	906612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017354	TG	3	6	907330	907335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017354	CT	3	6	907867	907872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017354	TG	3	6	908873	908878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017354	TC	3	6	909487	909492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017354	CT	3	6	913091	913096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017354	GC	3	6	920613	920618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017354	CA	3	6	923087	923092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017354	CG	3	6	926240	926245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017354	AT	3	6	937931	937936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017354	AT	3	6	938121	938126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017354	GT	3	6	940305	940310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017354	AC	3	6	962455	962460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017354	GC	3	6	965003	965008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017354	AG	3	6	973648	973653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.