MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 1738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017354	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017354	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017354	TGG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017354	GTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017354	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017354	GGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017354	AAT	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017354	ATT	2	6	4852	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017354	TGT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017354	AGT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017354	TGT	2	6	7552	7557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017354	TTG	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017354	TAA	3	9	9378	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017354	ATT	2	6	9878	9883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017354	GAA	2	6	10007	10012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017354	TTG	2	6	11563	11568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017354	AGG	2	6	12831	12836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017354	ATA	2	6	13767	13772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	CTG	2	6	16816	16821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017354	ACG	2	6	16881	16886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017354	TTG	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017354	CTT	2	6	25349	25354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017354	GTT	2	6	25558	25563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017354	ATT	2	6	26215	26220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017354	AAT	2	6	30340	30345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017354	ATT	2	6	30420	30425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017354	ATT	2	6	30481	30486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017354	ATA	2	6	30577	30582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017354	AGA	2	6	35845	35850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017354	TTA	2	6	42050	42055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017354	TTA	2	6	46592	46597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017354	TGT	2	6	50196	50201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017354	TGA	2	6	50241	50246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017354	AAT	2	6	50298	50303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017354	AAC	2	6	52319	52324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017354	AAT	2	6	52336	52341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017354	AAC	2	6	52369	52374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017354	TGT	2	6	52535	52540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017354	GTG	2	6	52655	52660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017354	TAA	2	6	56616	56621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017354	TAA	2	6	69322	69327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017354	GTT	2	6	69344	69349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	ATT	2	6	69369	69374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017354	ATT	2	6	69400	69405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017354	ATA	2	6	69809	69814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017354	AAC	2	6	70930	70935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017354	TAG	2	6	71006	71011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017354	AGA	2	6	71091	71096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017354	AAT	2	6	71146	71151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017354	CTT	2	6	71156	71161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017354	TGA	2	6	71175	71180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017354	AGA	2	6	71461	71466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017354	TGG	2	6	71593	71598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017354	TAG	2	6	71643	71648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017354	TAC	2	6	71914	71919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017354	CAA	2	6	71934	71939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017354	TTA	2	6	72189	72194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017354	CAG	2	6	72291	72296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017354	ATT	2	6	72336	72341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017354	AGA	2	6	72546	72551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017354	AGA	2	6	72627	72632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017354	CTT	2	6	72705	72710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017354	TCT	2	6	72718	72723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017354	AGG	2	6	72777	72782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017354	GAT	2	6	72871	72876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017354	AGA	2	6	72909	72914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017354	AGA	2	6	73279	73284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017354	GAA	2	6	73289	73294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017354	TGC	2	6	73310	73315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017354	AGC	2	6	73779	73784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017354	ACC	2	6	73819	73824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017354	AAG	2	6	73867	73872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017354	GCG	2	6	73921	73926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017354	TGA	2	6	73943	73948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017354	ACA	2	6	73970	73975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017354	TTA	3	9	75890	75898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	AGA	2	6	76005	76010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017354	TGG	2	6	76094	76099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017354	GAA	2	6	76202	76207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017354	TAT	2	6	76238	76243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017354	TTG	2	6	76721	76726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	GAC	2	6	76736	76741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017354	ATC	2	6	76793	76798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017354	CGC	2	6	76857	76862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017354	AGA	2	6	77188	77193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017354	TAT	2	6	77361	77366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017354	AGA	2	6	77447	77452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017354	CTA	2	6	77569	77574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017354	TAT	2	6	77817	77822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017354	CGA	2	6	77893	77898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017354	GTG	2	6	78066	78071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017354	TGA	2	6	78074	78079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017354	AGA	2	6	78273	78278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017354	AAT	2	6	78295	78300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	GAT	2	6	78301	78306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017354	CAA	3	9	78342	78350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017354	TGA	2	6	78399	78404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017354	TCA	2	6	78416	78421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017354	AAG	2	6	78548	78553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017354	TGG	2	6	78611	78616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	CAA	2	6	78681	78686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017354	TCT	2	6	78695	78700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017354	TGA	2	6	78732	78737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017354	CAC	2	6	78747	78752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017354	TGA	2	6	78817	78822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017354	CAT	2	6	78920	78925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017354	GTT	2	6	78980	78985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017354	AAC	2	6	78987	78992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017354	ACA	2	6	82555	82560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017354	TTG	2	6	82582	82587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017354	ATT	3	9	85262	85270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017354	TGG	2	6	85400	85405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017354	CTT	2	6	87677	87682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017354	AAT	2	6	87690	87695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017354	TTG	2	6	87734	87739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017354	ACC	2	6	88886	88891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017354	AGG	2	6	89314	89319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017354	ACC	2	6	89354	89359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017354	CAA	2	6	89410	89415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017354	TAG	2	6	89556	89561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017354	GCA	2	6	89605	89610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017354	AAT	2	6	89659	89664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017354	CAA	4	12	89722	89733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017354	AAG	2	6	89762	89767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017354	CTA	2	6	89789	89794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017354	CAC	2	6	89802	89807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017354	ACT	2	6	89812	89817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017354	TGA	2	6	89964	89969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017354	AAC	2	6	89970	89975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017354	CAG	2	6	89993	89998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017354	AGA	2	6	90083	90088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017354	CCA	2	6	90109	90114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017354	GAA	2	6	90124	90129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017354	TAA	2	6	90177	90182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017354	TCT	2	6	91251	91256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017354	CTG	2	6	91278	91283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017354	TGT	2	6	91311	91316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017354	GGT	2	6	93514	93519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017354	ATT	2	6	95727	95732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017354	TAA	2	6	95754	95759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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