MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 4068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	T	6	6	21	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017354	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017354	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017354	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017354	ATGC	2	8	4319	4326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017354	TGG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017354	GTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017354	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017354	GGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017354	A	7	7	4617	4623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017354	T	8	8	4637	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017354	AAT	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017354	A	6	6	4818	4823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017354	ATT	2	6	4852	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017354	T	6	6	4870	4875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017354	A	6	6	4880	4885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017354	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017354	TGT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017354	TTTTA	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017354	TC	3	6	4999	5004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017354	A	6	6	5032	5037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017354	T	7	7	5042	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017354	ACTA	2	8	5084	5091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017354	A	6	6	5096	5101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017354	AGT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017354	AAAAAG	2	12	5181	5192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017354	C	6	6	5199	5204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017354	A	7	7	5218	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017354	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017354	TGT	2	6	7552	7557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017354	A	15	15	7561	7575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017354	G	6	6	7613	7618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017354	TTG	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017354	TAA	3	9	9378	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017354	ATAA	2	8	9769	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017354	ATT	2	6	9878	9883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017354	T	6	6	9955	9960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017354	ATTC	2	8	9972	9979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017354	GAA	2	6	10007	10012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017354	TTG	2	6	11563	11568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017354	GCTC	2	8	11612	11619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017354	A	6	6	11630	11635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017354	A	6	6	11646	11651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017354	T	6	6	12760	12765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017354	T	6	6	12825	12830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017354	AGG	2	6	12831	12836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017354	GCTTT	2	10	13689	13698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017354	T	6	6	13696	13701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017354	T	7	7	13757	13763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017354	ATA	2	6	13767	13772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017354	TTAA	2	8	13786	13793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017354	AGTT	2	8	16733	16740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017354	CA	3	6	16795	16800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017354	CTG	2	6	16816	16821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017354	ACG	2	6	16881	16886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017354	A	7	7	16950	16956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017354	A	6	6	18390	18395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017354	AAACAC	2	12	18430	18441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017354	ATCA	2	8	22845	22852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017354	T	8	8	22913	22920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017354	TTG	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017354	TTTCTT	2	12	23126	23137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017354	A	6	6	23176	23181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017354	A	6	6	23218	23223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017354	T	6	6	25337	25342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017354	CTT	2	6	25349	25354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017354	GATT	2	8	25362	25369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017354	ATTA	2	8	25458	25465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017354	A	15	15	25483	25497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017354	GTT	2	6	25558	25563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017354	TTTGTT	2	12	26053	26064	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017354	AATC	2	8	26120	26127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017354	CAAT	2	8	26153	26160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017354	ATT	2	6	26215	26220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017354	TC	3	6	29575	29580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017354	AAATT	2	10	30287	30296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017354	T	6	6	30317	30322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017354	AAT	2	6	30340	30345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017354	ATT	2	6	30420	30425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017354	ATT	2	6	30481	30486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017354	ATA	2	6	30577	30582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017354	T	6	6	30653	30658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	AGCG	2	8	31140	31147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017354	T	6	6	31174	31179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017354	T	7	7	31233	31239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017354	TTTG	2	8	35796	35803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017354	AGA	2	6	35845	35850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017354	TTAC	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017354	TA	3	6	35889	35894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017354	AG	3	6	35984	35989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017354	TTA	2	6	42050	42055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017354	TTA	2	6	46592	46597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017354	TGT	2	6	50196	50201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017354	TGA	2	6	50241	50246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017354	AAT	2	6	50298	50303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	AAC	2	6	52319	52324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017354	AAT	2	6	52336	52341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017354	G	6	6	52355	52360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017354	AAC	2	6	52369	52374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017354	TGT	2	6	52535	52540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017354	TGAA	2	8	52562	52569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	TAGA	2	8	52590	52597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017354	TTCT	2	8	52633	52640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017354	GTG	2	6	52655	52660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017354	TAA	2	6	56616	56621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017354	TTTA	2	8	56644	56651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017354	TAAA	2	8	56680	56687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017354	TTGT	2	8	60657	60664	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017354	T	6	6	60866	60871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017354	TTCA	2	8	60892	60899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017354	T	6	6	63953	63958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017354	AAAT	2	8	64096	64103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017354	TTTA	2	8	69261	69268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017354	TAA	2	6	69322	69327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017354	GTT	2	6	69344	69349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017354	ATT	2	6	69369	69374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017354	T	7	7	69383	69389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017354	ATT	2	6	69400	69405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017354	T	6	6	69433	69438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017354	A	6	6	69470	69475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017354	TTAAA	2	10	69532	69541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017354	ACAAA	2	10	69549	69558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017354	G	7	7	69802	69808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017354	ATA	2	6	69809	69814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017354	T	6	6	69853	69858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017354	AGCG	2	8	70573	70580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017354	AAC	2	6	70930	70935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017354	TAG	2	6	71006	71011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017354	A	6	6	71057	71062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017354	A	6	6	71077	71082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017354	AGA	2	6	71091	71096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017354	AAT	2	6	71146	71151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017354	CTT	2	6	71156	71161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017354	TGA	2	6	71175	71180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017354	A	6	6	71240	71245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017354	GATGTG	2	12	71269	71280	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017354	AAAG	2	8	71408	71415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017354	AGA	2	6	71461	71466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017354	TGCT	2	8	71579	71586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017354	CT	3	6	71585	71590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017354	TGG	2	6	71593	71598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017354	TAG	2	6	71643	71648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017354	T	7	7	71788	71794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017354	TAC	2	6	71914	71919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017354	CAA	2	6	71934	71939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017354	TATCC	2	10	71972	71981	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017354	A	6	6	72008	72013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017354	AG	4	8	72016	72023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017354	A	7	7	72039	72045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017354	A	6	6	72074	72079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017354	AGCG	2	8	72108	72115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017354	TTA	2	6	72189	72194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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