MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	TA	3	6	3750	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017161	TA	3	6	11960	11965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017161	AG	3	6	12007	12012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017161	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017161	TA	3	6	38948	38953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017161	CT	3	6	50263	50268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017161	TA	3	6	57484	57489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017161	TA	3	6	57781	57786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017161	TA	3	6	60670	60675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017161	CA	3	6	64254	64259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017161	AT	4	8	74360	74367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017161	AT	3	6	75800	75805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017161	AT	3	6	78466	78471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017161	TC	3	6	85781	85786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017161	AT	3	6	92632	92637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017161	TA	3	6	96415	96420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017161	TA	3	6	96423	96428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017161	TA	3	6	142898	142903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017161	TC	3	6	174216	174221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017161	AG	3	6	192486	192491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017161	AG	3	6	193124	193129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017161	GC	3	6	193577	193582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017161	CT	3	6	193771	193776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017161	AC	3	6	194098	194103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017161	AC	3	6	197005	197010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017161	CA	4	8	199232	199239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017161	AT	3	6	199458	199463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017161	GT	3	6	229369	229374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017161	AG	3	6	229542	229547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017161	AT	3	6	238195	238200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017161	GA	3	6	242891	242896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017161	GA	3	6	246693	246698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017161	GT	3	6	246901	246906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017161	AT	3	6	248530	248535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017161	CT	3	6	249953	249958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017161	TA	3	6	268774	268779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017161	TC	3	6	268894	268899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017161	CT	3	6	269256	269261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017161	GT	3	6	277666	277671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017161	AG	4	8	282441	282448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017161	TG	3	6	294550	294555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017161	GT	3	6	295897	295902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017161	AT	3	6	307377	307382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017161	GA	3	6	321234	321239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017161	AG	3	6	321266	321271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017161	CT	3	6	321409	321414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017161	TC	3	6	321490	321495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017161	CT	3	6	321780	321785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017161	CT	3	6	322216	322221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017161	CT	3	6	322333	322338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017161	AG	3	6	328332	328337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017161	AT	3	6	336910	336915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017161	AT	3	6	338259	338264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017161	CT	4	8	353046	353053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017161	TC	3	6	353101	353106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017161	TA	5	10	353254	353263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017161	TA	3	6	369118	369123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017161	GA	4	8	383872	383879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017161	AG	4	8	384084	384091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017161	TC	3	6	385458	385463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017161	AT	3	6	391001	391006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017161	TA	4	8	397046	397053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017161	GA	4	8	397687	397694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017161	TG	3	6	399160	399165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017161	TG	3	6	399667	399672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017161	AG	3	6	399777	399782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017161	CT	4	8	400094	400101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017161	AG	3	6	433021	433026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017161	AG	3	6	436800	436805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017161	CA	3	6	436920	436925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017161	AC	3	6	436956	436961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017161	AT	3	6	463390	463395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017161	AT	3	6	495270	495275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017161	TC	4	8	502531	502538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017161	GT	3	6	503200	503205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017161	TC	4	8	503560	503567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017161	AT	3	6	506445	506450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017161	CA	3	6	507669	507674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017161	AT	3	6	507713	507718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017161	TA	4	8	517951	517958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017161	GA	3	6	522634	522639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017161	AT	3	6	546932	546937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017161	CT	3	6	579627	579632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017161	CT	3	6	579651	579656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017161	AT	3	6	582019	582024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017161	CT	3	6	587854	587859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017161	TA	3	6	590178	590183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017161	AG	3	6	590433	590438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017161	CT	4	8	590440	590447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017161	TA	3	6	627126	627131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017161	TC	3	6	643147	643152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017161	AG	3	6	685320	685325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017161	GA	3	6	685448	685453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017161	AG	3	6	685880	685885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017161	CA	3	6	686126	686131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017161	AT	4	8	697365	697372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017161	AT	3	6	711103	711108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017161	CT	3	6	718504	718509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017161	AT	3	6	727603	727608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017161	TA	3	6	756493	756498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017161	TA	3	6	757091	757096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017161	GA	3	6	761966	761971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017161	TA	3	6	765118	765123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017161	TC	3	6	778219	778224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017161	TA	3	6	779527	779532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017161	TA	3	6	803419	803424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017161	AG	3	6	803513	803518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017161	AG	3	6	809681	809686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017161	CT	3	6	809974	809979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017161	AT	3	6	809984	809989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017161	TA	3	6	810533	810538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017161	AT	3	6	821056	821061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017161	AC	3	6	843431	843436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017161	AG	3	6	845224	845229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017161	TA	3	6	845345	845350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017161	GA	3	6	849431	849436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017161	AG	3	6	852178	852183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017161	AC	3	6	889269	889274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017161	CT	3	6	889292	889297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017161	TG	3	6	889334	889339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017161	CT	3	6	894093	894098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017161	AT	3	6	901412	901417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_017161	CT	3	6	909214	909219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017161	GT	3	6	909305	909310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017161	TA	3	6	909474	909479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017161	AT	3	6	915761	915766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017161	TA	3	6	927156	927161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017161	AT	3	6	932347	932352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017161	AT	4	8	932477	932484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017161	CT	3	6	942450	942455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017161	TA	3	6	942526	942531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017161	CT	3	6	943993	943998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017161	TC	3	6	944333	944338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017161	CT	3	6	944608	944613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017161	TA	3	6	958088	958093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017161	AT	3	6	959693	959698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017161	AT	3	6	962477	962482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017161	AT	3	6	962506	962511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_017161	AT	3	6	986074	986079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017161	TC	3	6	995981	995986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.