MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 1156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	AGG	2	6	1368	1373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017161	GCG	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017161	TCC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017161	CCA	2	6	12314	12319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017161	TCA	2	6	23992	23997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017161	TAT	2	6	24007	24012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017161	GCC	2	6	24047	24052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017161	GTA	2	6	27534	27539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017161	AGG	2	6	27543	27548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017161	ATT	2	6	39623	39628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017161	CCT	2	6	50102	50107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017161	AGG	2	6	50113	50118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017161	AGG	2	6	50150	50155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017161	ACC	2	6	50269	50274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017161	TAC	2	6	54393	54398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017161	CAA	2	6	57508	57513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017161	TCC	2	6	57752	57757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017161	TTA	2	6	57777	57782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017161	CCT	2	6	60636	60641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017161	CCT	2	6	63653	63658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017161	CCT	2	6	64192	64197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017161	AGG	2	6	64581	64586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017161	AAT	2	6	64623	64628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017161	TAT	2	6	69891	69896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017161	AGG	2	6	75836	75841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017161	TAA	2	6	79419	79424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017161	ATG	2	6	79536	79541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017161	AGG	2	6	79613	79618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017161	CCT	2	6	84000	84005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017161	CCT	2	6	84445	84450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017161	ATA	2	6	84470	84475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017161	TCT	2	6	84503	84508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017161	AGG	2	6	98165	98170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017161	TAT	2	6	103215	103220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017161	TTG	2	6	103346	103351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017161	ACC	2	6	115311	115316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017161	AGA	2	6	120257	120262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017161	AGG	2	6	120263	120268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017161	TGT	2	6	125340	125345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017161	TAT	2	6	125346	125351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017161	TTA	2	6	125395	125400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017161	GGA	2	6	127964	127969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017161	TCC	2	6	135561	135566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017161	TAT	2	6	135593	135598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017161	AGG	2	6	135663	135668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017161	TCC	2	6	140748	140753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017161	TTA	2	6	140785	140790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017161	TTA	2	6	142894	142899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017161	TTA	2	6	151096	151101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017161	CCT	2	6	157798	157803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017161	AGG	2	6	162388	162393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017161	CCT	2	6	170344	170349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017161	CCT	2	6	170817	170822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017161	TCT	2	6	170938	170943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017161	AGG	2	6	173987	173992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017161	ATT	2	6	174906	174911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017161	GGA	2	6	181916	181921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017161	GAA	2	6	192498	192503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017161	TCT	2	6	192562	192567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017161	CTT	2	6	192597	192602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017161	CAC	2	6	192642	192647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017161	GGT	2	6	192675	192680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017161	GTT	3	9	192729	192737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017161	AGG	2	6	192956	192961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017161	TAT	2	6	192963	192968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017161	CTC	2	6	193004	193009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017161	ACC	2	6	193134	193139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017161	AAG	2	6	193350	193355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017161	AAG	2	6	193363	193368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017161	CCT	2	6	193454	193459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017161	TAT	2	6	193482	193487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017161	CTG	2	6	193817	193822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017161	GCA	2	6	193874	193879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017161	ACC	2	6	193909	193914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017161	CAG	2	6	194023	194028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017161	GAG	2	6	194041	194046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017161	AGA	2	6	194060	194065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017161	CAC	2	6	194094	194099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017161	CCT	2	6	194111	194116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017161	AGG	2	6	197091	197096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017161	CTT	3	9	199043	199051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017161	TGG	2	6	199075	199080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017161	ACC	2	6	199165	199170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017161	CTC	2	6	199245	199250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017161	ATA	2	6	199383	199388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017161	TAT	2	6	199495	199500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017161	TGC	2	6	201759	201764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017161	TAA	2	6	201791	201796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017161	CCT	2	6	203184	203189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017161	AGG	2	6	203273	203278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017161	ATG	2	6	210197	210202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017161	ATA	2	6	210209	210214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017161	TAA	2	6	210244	210249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017161	CCT	2	6	215480	215485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017161	GTG	2	6	216881	216886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017161	AGG	2	6	216887	216892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017161	TTA	2	6	216925	216930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017161	TAT	2	6	216946	216951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017161	CCT	2	6	219071	219076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017161	CCT	2	6	219376	219381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017161	AAG	2	6	219419	219424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017161	GAT	2	6	219429	219434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017161	ATT	3	9	219447	219455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017161	AAG	2	6	219494	219499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017161	ACC	2	6	219540	219545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017161	TCT	2	6	223877	223882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017161	TGG	2	6	229428	229433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017161	TAT	2	6	234586	234591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017161	TAT	2	6	236261	236266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017161	AGG	2	6	238249	238254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017161	AGG	2	6	240355	240360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017161	GAC	2	6	242557	242562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017161	ATC	2	6	242594	242599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017161	CTG	2	6	242766	242771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017161	CGG	2	6	242973	242978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017161	TGG	2	6	243201	243206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017161	GCG	2	6	243212	243217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017161	TAA	2	6	243426	243431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017161	CTT	2	6	243447	243452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017161	GTA	3	9	243493	243501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017161	CAT	2	6	243504	243509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017161	TAG	2	6	243647	243652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017161	AGA	2	6	243738	243743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017161	AGG	2	6	243915	243920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017161	ACA	2	6	243971	243976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017161	CGG	2	6	244114	244119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017161	AGG	2	6	244167	244172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017161	GCC	2	6	244175	244180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017161	GGT	2	6	244254	244259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017161	GGA	2	6	244286	244291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017161	CTC	2	6	244430	244435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017161	GAG	2	6	244756	244761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017161	CTA	2	6	244782	244787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017161	GTT	2	6	244845	244850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017161	CTA	2	6	244929	244934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017161	ACC	2	6	244941	244946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017161	CCT	2	6	244970	244975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017161	GGC	2	6	245072	245077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_017161	CGG	2	6	245110	245115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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