MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 1969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1004	NC_017161	CAG	2	6	909334	909339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017161	TAT	2	6	909376	909381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017161	T	7	7	909418	909424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017161	TA	3	6	909474	909479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017161	TTATAA	2	12	911045	911056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017161	AT	3	6	915761	915766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017161	GAAT	2	8	915772	915779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017161	GGA	2	6	915788	915793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1013	NC_017161	CCT	2	6	927079	927084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_017161	AAT	2	6	927102	927107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017161	ATG	2	6	927108	927113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017161	A	6	6	927139	927144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017161	TA	3	6	927156	927161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017161	AAG	2	6	927207	927212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017161	TAT	2	6	927274	927279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017161	AATT	2	8	927280	927287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1023	NC_017161	C	6	6	928533	928538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1024	NC_017161	GC	3	6	928545	928550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1033	NC_017161	CTT	2	6	932295	932300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_017161	GCA	2	6	944690	944695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_017161	ACC	2	6	976394	976399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017161	TCCC	2	8	976416	976423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1107	NC_017161	CCT	2	6	984557	984562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1120	NC_017161	TA	3	6	985940	985945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017161	GAA	2	6	986010	986015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_017161	AT	3	6	986074	986079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_017161	AGA	2	6	999354	999359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017161	ATATC	2	10	999410	999419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1403	NC_017161	TAA	2	6	1124637	1124642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_017161	TGG	2	6	1124650	1124655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_017161	GAT	2	6	1124663	1124668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_017161	TAA	2	6	1124704	1124709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_017161	AAGC	2	8	1124718	1124725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1408	NC_017161	TAA	2	6	1124770	1124775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_017161	GTA	2	6	1124822	1124827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_017161	TAT	2	6	1124840	1124845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_017161	ATG	2	6	1133094	1133099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_017161	TAT	2	6	1164237	1164242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_017161	TAT	2	6	1191875	1191880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_017161	TGT	2	6	1191886	1191891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_017161	TA	3	6	1191897	1191902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_017161	AGCT	2	8	1196688	1196695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1431	NC_017161	AG	3	6	1196855	1196860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1435	NC_017161	AG	3	6	1200571	1200576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_017161	AAG	2	6	1200594	1200599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_017161	CTT	2	6	1200775	1200780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_017161	TGG	2	6	1200887	1200892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_017161	CCT	2	6	1204655	1204660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1464	NC_017161	GAA	2	6	1206142	1206147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_017161	CCTG	2	8	1206153	1206160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1466	NC_017161	CTT	2	6	1206166	1206171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1467	NC_017161	GTA	2	6	1206208	1206213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1470	NC_017161	GCTG	2	8	1206288	1206295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1471	NC_017161	TAC	2	6	1206321	1206326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1472	NC_017161	CTTTGC	2	12	1206333	1206344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1476	NC_017161	CTT	2	6	1206432	1206437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1482	NC_017161	TATAA	2	10	1209106	1209115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_017161	CTC	2	6	1213666	1213671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1489	NC_017161	AATAT	2	10	1213691	1213700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_017161	CAGTA	2	10	1213810	1213819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1491	NC_017161	TGT	2	6	1213903	1213908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1498	NC_017161	AACA	2	8	1216629	1216636	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_017161	TAT	2	6	1216738	1216743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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