MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 1969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017161	GTT	2	6	398178	398183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017161	CCA	2	6	398316	398321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017161	CTG	2	6	398467	398472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017161	ACC	2	6	398588	398593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_017161	CCA	2	6	398619	398624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017161	CAG	2	6	398662	398667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017161	T	6	6	398679	398684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017161	TCT	3	9	398766	398774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017161	GGAT	2	8	398918	398925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017161	AAG	2	6	398940	398945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017161	CTA	2	6	398985	398990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017161	TTA	2	6	399087	399092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017161	GTC	2	6	399143	399148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017161	TG	3	6	399160	399165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017161	GAA	2	6	399185	399190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017161	CTG	2	6	399194	399199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017161	TGG	2	6	399304	399309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017161	TCC	2	6	399351	399356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017161	CTTT	2	8	399385	399392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017161	TGAT	2	8	399429	399436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017161	ACC	3	9	399491	399499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_017161	TCC	2	6	399572	399577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_017161	TCT	2	6	399615	399620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017161	CAG	2	6	399652	399657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017161	TG	3	6	399667	399672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017161	AGA	2	6	399715	399720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017161	CTT	2	6	399742	399747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017161	AG	3	6	399777	399782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017161	AGG	2	6	399839	399844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017161	AGG	2	6	399861	399866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017161	TCT	2	6	399992	399997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017161	GTA	2	6	400033	400038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017161	CT	4	8	400094	400101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017161	CAA	2	6	400125	400130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017161	AAG	2	6	400883	400888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017161	CTTTTG	2	12	405296	405307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
537	NC_017161	T	7	7	407572	407578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017161	AGT	2	6	407622	407627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017161	ATT	2	6	422740	422745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017161	TTA	2	6	423633	423638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017161	TAT	2	6	426516	426521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017161	AGG	3	9	426536	426544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017161	AG	3	6	433021	433026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017161	CCT	2	6	434772	434777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_017161	AGG	2	6	434791	434796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017161	AAGG	2	8	436790	436797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017161	AG	3	6	436800	436805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017161	CCTT	2	8	436826	436833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017161	CTT	2	6	436906	436911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017161	CA	3	6	436920	436925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_017161	A	6	6	436927	436932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017161	CTA	2	6	436936	436941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017161	AC	3	6	436956	436961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017161	G	6	6	436988	436993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017161	ATATT	2	10	437267	437276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017161	AGG	2	6	442040	442045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017161	CCT	2	6	452483	452488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_017161	CCT	2	6	454889	454894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017161	AATG	2	8	455925	455932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017161	AACG	2	8	455977	455984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_017161	CTT	2	6	456924	456929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017161	CCT	2	6	456938	456943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017161	AGT	2	6	457005	457010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017161	GGTT	2	8	463381	463388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017161	AT	3	6	463390	463395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017161	AGG	2	6	463401	463406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017161	ATA	2	6	466841	466846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017161	TCC	2	6	466851	466856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_017161	ATT	2	6	467958	467963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017161	TTC	2	6	467972	467977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017161	TTA	2	6	467996	468001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017161	A	6	6	469159	469164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017161	CCT	2	6	473412	473417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_017161	TAT	2	6	473424	473429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017161	A	7	7	477441	477447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017161	CCCT	2	8	482607	482614	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
577	NC_017161	CCT	2	6	482955	482960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_017161	TCC	2	6	484993	484998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_017161	ATT	2	6	486100	486105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017161	TTC	2	6	486114	486119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017161	TTA	2	6	486138	486143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017161	GTA	2	6	486155	486160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017161	T	6	6	488077	488082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017161	CATTC	2	10	488083	488092	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
585	NC_017161	CCT	2	6	488093	488098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017161	CCT	2	6	492109	492114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_017161	CCCT	2	8	492155	492162	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
588	NC_017161	TAA	3	9	492188	492196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017161	TAA	2	6	492230	492235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017161	AGG	2	6	492241	492246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017161	AGG	2	6	494616	494621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017161	AT	3	6	495270	495275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017161	TAT	2	6	495287	495292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017161	TTC	2	6	495293	495298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017161	TAT	3	9	501729	501737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_017161	C	6	6	502069	502074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
599	NC_017161	TAAT	2	8	502091	502098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017161	AGG	2	6	502103	502108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017161	AAC	2	6	502198	502203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017161	CTT	2	6	502273	502278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017161	TTGC	2	8	502294	502301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_017161	TTC	2	6	502308	502313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017161	T	6	6	502372	502377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017161	GTT	2	6	502482	502487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017161	TCC	2	6	502513	502518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_017161	TC	4	8	502531	502538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017161	GTT	2	6	502545	502550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017161	TGT	2	6	502697	502702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017161	ATA	2	6	502710	502715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017161	ACC	2	6	502725	502730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_017161	A	6	6	502794	502799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017161	TCT	2	6	502825	502830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017161	CTC	2	6	502869	502874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_017161	ATG	2	6	502927	502932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017161	TCT	2	6	502970	502975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017161	TTC	2	6	503152	503157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017161	CTT	2	6	503169	503174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017161	GT	3	6	503200	503205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017161	GTA	2	6	503223	503228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017161	TCA	2	6	503230	503235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017161	AAG	2	6	503264	503269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017161	GTC	2	6	503277	503282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017161	CAC	2	6	503295	503300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017161	GCA	2	6	503327	503332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017161	GTA	2	6	503340	503345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017161	TCT	2	6	503353	503358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017161	ATT	2	6	503406	503411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017161	T	6	6	503410	503415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017161	TTG	2	6	503433	503438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017161	TC	4	8	503560	503567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017161	TTGT	2	8	503571	503578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017161	T	8	8	505985	505992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017161	G	6	6	506002	506007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017161	CCT	2	6	506035	506040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_017161	CCT	2	6	506422	506427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017161	AT	3	6	506445	506450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017161	GTCAA	2	10	506468	506477	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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