MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 2351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015964	TAT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015964	ATA	2	6	1175	1180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015964	GTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015964	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015964	ATC	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015964	GTG	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015964	TTC	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015964	CGG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015964	CAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015964	TGC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015964	GCT	2	6	6199	6204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015964	GAG	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015964	AGT	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015964	ATT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015964	TTA	2	6	8590	8595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015964	GTG	2	6	8614	8619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015964	AAG	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015964	TTG	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015964	GAA	2	6	8779	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015964	ATC	2	6	8919	8924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015964	GGC	2	6	8926	8931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015964	TTG	2	6	8987	8992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015964	TTG	2	6	9001	9006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015964	ATT	2	6	9860	9865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015964	GGT	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015964	ATC	2	6	10018	10023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015964	GAC	2	6	10248	10253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015964	TTG	2	6	10436	10441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015964	GTT	2	6	10442	10447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015964	ATT	2	6	11304	11309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015964	ATG	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015964	TCA	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015964	TAA	2	6	13035	13040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015964	TAT	2	6	15307	15312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015964	ATA	2	6	15536	15541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015964	TAA	2	6	16245	16250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015964	TCT	2	6	19764	19769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015964	ATC	2	6	19832	19837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015964	CAT	2	6	19856	19861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015964	GCC	2	6	19875	19880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015964	AGA	2	6	20006	20011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015964	TTG	2	6	20072	20077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015964	AAC	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015964	TGC	2	6	20196	20201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015964	TCT	3	9	20229	20237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015964	AAG	2	6	20250	20255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015964	CAT	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015964	CCA	2	6	20325	20330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015964	AAT	2	6	20333	20338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015964	TAA	2	6	20348	20353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015964	ATT	2	6	20390	20395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015964	TTG	2	6	20414	20419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015964	AAT	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015964	GTT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015964	TCT	2	6	20559	20564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015964	CAA	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015964	CCA	2	6	20608	20613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015964	ATA	2	6	20628	20633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015964	ATT	2	6	20649	20654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015964	TAA	2	6	20779	20784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015964	ATA	2	6	20799	20804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015964	TTG	2	6	20808	20813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015964	CGT	2	6	20815	20820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015964	TGG	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015964	CTT	2	6	20895	20900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015964	AAT	2	6	20903	20908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015964	TGA	2	6	21005	21010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015964	TCA	2	6	21706	21711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015964	ATG	2	6	25226	25231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015964	AAT	2	6	26717	26722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015964	ACT	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015964	TGT	2	6	26778	26783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015964	ATT	2	6	31058	31063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015964	CTC	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015964	TTA	2	6	33943	33948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015964	GAT	2	6	33960	33965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015964	CAA	2	6	33982	33987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015964	CTT	2	6	34079	34084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015964	ACC	2	6	35165	35170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015964	ATT	2	6	35184	35189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015964	ATT	2	6	35218	35223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015964	ATT	2	6	35244	35249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015964	AGT	2	6	38819	38824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015964	ATT	2	6	42796	42801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015964	TCT	2	6	45830	45835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015964	TGA	2	6	45902	45907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015964	ATT	2	6	47809	47814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015964	ACA	2	6	52881	52886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015964	AAT	2	6	52961	52966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015964	TCT	2	6	52975	52980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015964	AGA	2	6	53052	53057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015964	ATT	2	6	53070	53075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015964	TCC	2	6	58803	58808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015964	TCT	2	6	61545	61550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015964	GTG	2	6	64083	64088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015964	CCA	2	6	64159	64164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015964	TAT	2	6	64291	64296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015964	TTA	2	6	66488	66493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015964	AAC	2	6	67814	67819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015964	CAT	2	6	67919	67924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015964	TGA	2	6	68640	68645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015964	ATT	2	6	68830	68835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015964	ATT	2	6	68840	68845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015964	TTC	2	6	70894	70899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015964	TAT	2	6	70917	70922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015964	CAA	2	6	74877	74882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015964	TAA	2	6	75048	75053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015964	ACT	3	9	75226	75234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015964	ATT	2	6	75312	75317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015964	CTT	2	6	79256	79261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015964	GAA	2	6	79386	79391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015964	GCA	2	6	85423	85428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015964	ATA	2	6	88509	88514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015964	TTA	2	6	88652	88657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015964	TTA	2	6	92133	92138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015964	TAA	2	6	92158	92163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015964	CCT	2	6	97203	97208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015964	GAA	2	6	97260	97265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015964	AAT	2	6	101740	101745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015964	TCA	2	6	101947	101952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015964	GAA	2	6	102005	102010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015964	CTT	2	6	102084	102089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015964	GAA	2	6	102113	102118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015964	ATT	2	6	102166	102171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015964	AAG	2	6	106676	106681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015964	TCC	2	6	106695	106700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015964	TAA	2	6	107831	107836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015964	ATT	2	6	107904	107909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015964	TGA	2	6	109184	109189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015964	TCA	2	6	109196	109201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015964	TAG	2	6	112070	112075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015964	TAA	2	6	114018	114023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015964	TAA	2	6	119811	119816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015964	TAT	2	6	123999	124004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015964	CAA	2	6	128219	128224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015964	AAT	2	6	129413	129418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015964	AAT	2	6	132768	132773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015964	TGA	2	6	132840	132845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015964	TAT	2	6	132893	132898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015964	AAT	2	6	132973	132978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015964	GCA	2	6	133094	133099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015964	AAT	2	6	133120	133125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015964	ATT	2	6	134054	134059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_015964	ATT	2	6	292435	292440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_015964	ACA	2	6	297712	297717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_015964	TAT	2	6	308197	308202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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