MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 5268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015964	TAAAAA	2	12	225185	225196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015964	AG	3	6	225197	225202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015964	TC	3	6	225217	225222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_015964	AAT	2	6	226280	226285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015964	T	6	6	226325	226330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015964	AC	4	8	226341	226348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015964	TTC	2	6	226432	226437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015964	CGAA	2	8	226450	226457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015964	T	7	7	226521	226527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015964	ATT	2	6	228081	228086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015964	T	6	6	228085	228090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015964	CTT	2	6	228110	228115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015964	A	7	7	228436	228442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015964	T	6	6	232787	232792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015964	A	6	6	237701	237706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015964	ATC	2	6	237715	237720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015964	A	6	6	237726	237731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015964	GTTC	2	8	237735	237742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015964	TG	3	6	238097	238102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015964	ATT	2	6	238131	238136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015964	TTC	2	6	240985	240990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015964	AAT	2	6	240998	241003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015964	TAA	2	6	241022	241027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015964	A	6	6	241042	241047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015964	A	6	6	241069	241074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015964	ATTT	2	8	241125	241132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015964	AAG	2	6	241134	241139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015964	ATGA	2	8	241173	241180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015964	ACAA	2	8	241233	241240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015964	A	6	6	241239	241244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015964	CTTTT	2	10	241264	241273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_015964	A	7	7	242987	242993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015964	ATA	2	6	243026	243031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015964	A	6	6	243063	243068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015964	TAAA	2	8	243107	243114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015964	AGAAA	2	10	243180	243189	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015964	A	8	8	243197	243204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015964	TTG	2	6	243481	243486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015964	GGT	2	6	243548	243553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_015964	A	6	6	243562	243567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015964	AT	4	8	243667	243674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015964	TTC	2	6	245370	245375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015964	TTC	2	6	245380	245385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015964	TTA	2	6	246421	246426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015964	TGT	2	6	248204	248209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015964	TCTA	2	8	248260	248267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015964	CT	3	6	248270	248275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015964	T	6	6	248306	248311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015964	A	6	6	250176	250181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015964	GCC	2	6	250196	250201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015964	GAA	2	6	251227	251232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015964	T	6	6	251623	251628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015964	AAT	2	6	252746	252751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015964	ATTT	2	8	252772	252779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015964	TTTA	2	8	252790	252797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015964	AG	3	6	253138	253143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015964	TCA	2	6	253144	253149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015964	AAT	2	6	253151	253156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015964	AAAT	2	8	253181	253188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015964	ACT	2	6	253295	253300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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563	NC_015964	AAT	2	6	254292	254297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015964	TA	3	6	254309	254314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015964	T	6	6	254347	254352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015964	ATTTT	2	10	256460	256469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015964	ATT	2	6	257001	257006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015964	TTC	2	6	257007	257012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015964	T	6	6	257104	257109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015964	GTT	2	6	260286	260291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015964	T	6	6	260290	260295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015964	T	7	7	261209	261215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015964	TGA	2	6	261226	261231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_015964	TCAT	2	8	261324	261331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_015964	ATG	2	6	261336	261341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015964	TCA	2	6	261350	261355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_015964	TAA	2	6	263425	263430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015964	GCGTA	2	10	263466	263475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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583	NC_015964	ATT	2	6	264318	264323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015964	ATT	2	6	264358	264363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015964	CATA	2	8	264364	264371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_015964	TTAAT	2	10	264397	264406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_015964	TAA	2	6	284880	284885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015964	ATAA	2	8	284903	284910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_015964	AATT	2	8	284955	284962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015964	AT	3	6	284963	284968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015964	TA	3	6	286414	286419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015964	T	6	6	286463	286468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015964	ATTT	2	8	286475	286482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015964	ACT	2	6	286573	286578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_015964	TAA	2	6	286634	286639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015964	A	7	7	288527	288533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015964	TTTTA	2	10	288554	288563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_015964	ATA	2	6	289499	289504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015964	A	6	6	289544	289549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015964	ATT	2	6	292435	292440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015964	TA	3	6	292467	292472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015964	A	6	6	292481	292486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015964	CT	3	6	293621	293626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_015964	TA	3	6	293635	293640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015964	CTC	2	6	293643	293648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015964	TA	3	6	294940	294945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015964	TGT	2	6	295391	295396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015964	ACA	2	6	297712	297717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015964	A	6	6	297717	297722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015964	AAAG	2	8	299087	299094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015964	GTT	2	6	300238	300243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015964	CTAAA	2	10	301729	301738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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618	NC_015964	ATA	2	6	303444	303449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_015964	A	6	6	303491	303496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015964	TC	3	6	304034	304039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015964	A	6	6	304879	304884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015964	T	6	6	307277	307282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015964	A	6	6	307290	307295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015964	TAT	2	6	308197	308202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015964	TAC	2	6	308209	308214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015964	CT	3	6	308249	308254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_015964	A	7	7	308290	308296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015964	AT	3	6	308301	308306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015964	A	7	7	308339	308345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015964	TTA	2	6	308751	308756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015964	A	6	6	308873	308878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015964	AATA	2	8	309898	309905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015964	A	7	7	310351	310357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015964	T	6	6	310378	310383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015964	GAT	2	6	311852	311857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015964	AAC	2	6	311870	311875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015964	TTC	2	6	313314	313319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_015964	TCT	2	6	313320	313325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015964	A	7	7	313330	313336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015964	GACAA	2	10	313399	313408	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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643	NC_015964	ATC	2	6	313461	313466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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