MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AAATGA	2	12	1137	1148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	GCTGTC	2	12	36232	36243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015955	CATACC	2	12	39492	39503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015955	ACCAGA	2	12	57980	57991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015955	GCTGTC	2	12	80312	80323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015955	GCTGTC	2	12	91923	91934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015955	GTTGTC	2	12	92231	92242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015955	TGAACG	2	12	98790	98801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015955	CAGAAG	2	12	99514	99525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015955	GCTGTC	2	12	100500	100511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015955	TCAGTA	2	12	111134	111145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015955	GCTGTC	2	12	111250	111261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015955	GTCTGA	2	12	144184	144195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015955	GTTTCA	2	12	161065	161076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015955	AGTTTC	2	12	189579	189590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015955	GTCACA	2	12	189662	189673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015955	CGACGC	2	12	193960	193971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015955	TGGAAC	2	12	217862	217873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015955	TAGTGG	2	12	218110	218121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015955	GAAGAG	2	12	221301	221312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015955	GCTGTC	2	12	233917	233928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015955	GGTCCT	2	12	235405	235416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015955	GCTGTC	2	12	237888	237899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015955	CTACTT	2	12	312250	312261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015955	ATCGAA	2	12	316024	316035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015955	TAAGAT	2	12	336619	336630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015955	ACTCAA	2	12	360105	360116	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015955	GCTGTC	2	12	365351	365362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015955	GCTGTC	2	12	366911	366922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015955	GCTGTC	2	12	370570	370581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015955	GGCTCG	2	12	389138	389149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015955	TCATCT	2	12	390155	390166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015955	GACACC	2	12	469496	469507	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015955	GGACGC	2	12	487590	487601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015955	CCGTTC	2	12	513146	513157	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015955	GGCTAA	2	12	514381	514392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015955	CCGTGA	2	12	528030	528041	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015955	TCGGTA	2	12	528725	528736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015955	TTGGAG	2	12	528919	528930	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015955	ATATCG	2	12	566331	566342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015955	GCTGTC	2	12	604642	604653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015955	GCTGTC	2	12	613219	613230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015955	GCTGTC	2	12	615509	615520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015955	GGGAGA	2	12	630800	630811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015955	CGGGGG	2	12	635885	635896	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015955	CGGGGG	2	12	636165	636176	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015955	CGTTCA	2	12	637261	637272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015955	GAGCTG	2	12	644681	644692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015955	CCAGCG	2	12	644896	644907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015955	GGCGTC	2	12	650502	650513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015955	GCTGTC	2	12	692009	692020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015955	GGGGAA	2	12	702499	702510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.