MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015955	CGT	2	6	637107	637112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_015955	TCA	2	6	637171	637176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_015955	TCCG	2	8	637192	637199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_015955	CGTTCA	2	12	637261	637272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_015955	TTC	2	6	637365	637370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_015955	TCC	2	6	637428	637433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_015955	AAC	2	6	637506	637511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_015955	CTT	2	6	637550	637555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_015955	CTG	2	6	637565	637570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_015955	ATG	2	6	637622	637627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015955	GAGAT	2	10	637655	637664	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015955	GCG	2	6	637771	637776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_015955	TCA	2	6	637903	637908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_015955	GTT	2	6	637951	637956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015955	TCG	2	6	637979	637984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015955	TCG	2	6	637991	637996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_015955	GTA	2	6	638037	638042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015955	TTC	2	6	638069	638074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_015955	CGG	2	6	638092	638097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_015955	AGCGT	2	10	638121	638130	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2521	NC_015955	GAC	2	6	638165	638170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015955	TCT	2	6	638200	638205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_015955	TCG	2	6	638307	638312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_015955	TCG	2	6	638355	638360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_015955	ACG	2	6	638432	638437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_015955	CGT	2	6	638472	638477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_015955	CGT	2	6	638482	638487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_015955	TAA	2	6	638519	638524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_015955	TCC	2	6	638593	638598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_015955	ACC	2	6	638630	638635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_015955	TGAT	2	8	638681	638688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_015955	TGC	2	6	638726	638731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_015955	TCGC	2	8	638757	638764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_015955	CGT	2	6	638774	638779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_015955	CCG	2	6	638788	638793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_015955	CCT	2	6	638851	638856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_015955	CTC	2	6	638888	638893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_015955	ACG	2	6	638908	638913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_015955	CGA	2	6	638982	638987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_015955	TTG	2	6	639035	639040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015955	AG	3	6	639079	639084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015955	GCT	2	6	639098	639103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_015955	GTG	2	6	639140	639145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015955	CTGGA	2	10	639168	639177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2545	NC_015955	GA	3	6	639194	639199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_015955	ACT	2	6	642413	642418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_015955	GT	3	6	642476	642481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015955	GTC	2	6	642514	642519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_015955	CGG	2	6	642536	642541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_015955	GT	3	6	642602	642607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_015955	GAG	2	6	642639	642644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_015955	TG	3	6	642648	642653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_015955	CCA	2	6	642704	642709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_015955	GCCG	2	8	642742	642749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_015955	AATG	2	8	642848	642855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_015955	ACT	2	6	643162	643167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_015955	TAA	2	6	643208	643213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_015955	AAT	2	6	643230	643235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_015955	CTC	2	6	643301	643306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_015955	AGCC	2	8	643525	643532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_015955	CGC	2	6	643914	643919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_015955	TTCG	2	8	644553	644560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_015955	CTG	2	6	644584	644589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_015955	GAGCTG	2	12	644681	644692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2565	NC_015955	AGC	2	6	644703	644708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_015955	GGGT	2	8	644721	644728	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015955	TCG	2	6	644748	644753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_015955	TCG	2	6	644769	644774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_015955	CGG	2	6	644782	644787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_015955	CGA	2	6	644794	644799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_015955	GC	3	6	644803	644808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_015955	TCT	2	6	644842	644847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_015955	CGT	2	6	644848	644853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_015955	GGC	2	6	644854	644859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_015955	CCAGCG	2	12	644896	644907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_015955	GCCG	2	8	644924	644931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_015955	GC	3	6	644974	644979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2578	NC_015955	GAA	2	6	645017	645022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015955	GCT	2	6	645035	645040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_015955	AGC	2	6	645120	645125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_015955	GCTC	2	8	645172	645179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_015955	AGC	2	6	645180	645185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_015955	GAG	2	6	645204	645209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_015955	CGT	2	6	645262	645267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_015955	GCGT	2	8	645313	645320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2586	NC_015955	ACC	2	6	645390	645395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2587	NC_015955	GTC	2	6	645401	645406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_015955	GTG	3	9	645423	645431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015955	GCT	2	6	645481	645486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_015955	G	6	6	645561	645566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_015955	CGT	2	6	645589	645594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_015955	CG	3	6	645618	645623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_015955	GCC	2	6	645627	645632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_015955	GCT	2	6	645634	645639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_015955	GA	3	6	645766	645771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_015955	TCGG	2	8	645806	645813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_015955	ACG	2	6	645826	645831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_015955	TCGC	2	8	645837	645844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_015955	GTC	2	6	645857	645862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_015955	GCG	2	6	645880	645885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_015955	CG	3	6	645894	645899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_015955	TCGG	2	8	645914	645921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_015955	CGA	2	6	645922	645927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_015955	TCA	2	6	645928	645933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_015955	CCT	2	6	645979	645984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_015955	GT	3	6	646059	646064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_015955	AG	3	6	647267	647272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_015955	TAG	2	6	647293	647298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_015955	AGT	2	6	647316	647321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015955	ACC	2	6	647342	647347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_015955	TGGG	2	8	647374	647381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_015955	TCG	2	6	647387	647392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015955	G	6	6	647396	647401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015955	CGTG	2	8	647403	647410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_015955	ACCG	2	8	647431	647438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_015955	CGC	2	6	647490	647495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_015955	ACC	2	6	647501	647506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_015955	AC	3	6	647618	647623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_015955	CCCT	2	8	647646	647653	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2620	NC_015955	GTCCC	2	10	647683	647692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2621	NC_015955	CGAT	2	8	647702	647709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2622	NC_015955	GAAC	2	8	647716	647723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_015955	GGC	2	6	647733	647738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_015955	TGGT	2	8	647765	647772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_015955	CGGC	2	8	647902	647909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_015955	TAAC	2	8	647960	647967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2627	NC_015955	AAGC	2	8	647977	647984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2628	NC_015955	ACA	2	6	648002	648007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_015955	AGG	2	6	648009	648014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_015955	ACC	2	6	648015	648020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_015955	ATG	2	6	648114	648119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_015955	TGC	2	6	648125	648130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_015955	TAA	2	6	648131	648136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_015955	TAC	2	6	648140	648145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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