MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 7238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015948	AT	3	6	398942	398947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015948	CCT	2	6	398975	398980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015948	T	6	6	399771	399776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015948	GCG	3	9	399793	399801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015948	A	6	6	399843	399848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015948	GTCC	2	8	400557	400564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015948	ACG	2	6	401016	401021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015948	CGAA	2	8	402333	402340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_015948	GGAG	3	12	402383	402394	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015948	ACC	2	6	402461	402466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_015948	CAA	2	6	402498	402503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015948	CTGC	2	8	402525	402532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015948	CCGGT	2	10	403392	403401	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1014	NC_015948	CGC	2	6	403409	403414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_015948	TCGC	2	8	404134	404141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_015948	GA	3	6	404229	404234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015948	TGT	2	6	404264	404269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015948	CGG	2	6	406881	406886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015948	CTGT	2	8	406930	406937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_015948	GAG	2	6	408652	408657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015948	CAAG	2	8	408727	408734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_015948	GTTTG	2	10	408738	408747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015948	AC	3	6	408750	408755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_015948	CAG	2	6	408759	408764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015948	CA	3	6	408796	408801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_015948	ACC	2	6	409711	409716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_015948	GGGT	2	8	409963	409970	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015948	CCG	2	6	412320	412325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_015948	ACTG	2	8	412360	412367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_015948	TC	3	6	412371	412376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015948	GTCG	2	8	412411	412418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_015948	TTG	2	6	412507	412512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015948	TC	3	6	412531	412536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_015948	AAG	2	6	412586	412591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015948	A	6	6	412629	412634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015948	TTCC	2	8	412683	412690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_015948	TA	3	6	412693	412698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015948	CGG	2	6	412703	412708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015948	GAA	2	6	412715	412720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015948	CTA	2	6	413102	413107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015948	TG	3	6	413112	413117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015948	TCGCG	2	10	414418	414427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1043	NC_015948	GTC	2	6	415312	415317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015948	TCGG	2	8	415346	415353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_015948	GA	3	6	416453	416458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015948	CGCC	2	8	416492	416499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1047	NC_015948	ACG	2	6	416508	416513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015948	GAAA	2	8	416533	416540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015948	CCGA	2	8	417067	417074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015948	GCGT	2	8	418080	418087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_015948	TCG	2	6	418088	418093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015948	TGT	2	6	418794	418799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015948	CT	3	6	418803	418808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015948	ACGG	2	8	418882	418889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_015948	ACT	2	6	418890	418895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015948	AGC	3	9	418902	418910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015948	TGG	2	6	418948	418953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015948	GAAC	2	8	418967	418974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_015948	GC	3	6	418983	418988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015948	ACC	2	6	420355	420360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_015948	AGT	2	6	420367	420372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015948	G	6	6	421121	421126	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015948	TG	3	6	421164	421169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015948	TCG	2	6	422626	422631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015948	GGC	2	6	424465	424470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015948	T	6	6	425843	425848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015948	CG	3	6	425864	425869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015948	GC	3	6	425878	425883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_015948	GCCG	2	8	425918	425925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_015948	GCT	2	6	425931	425936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015948	CCCG	2	8	426074	426081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1072	NC_015948	GCG	2	6	427822	427827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015948	TCC	2	6	427876	427881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015948	C	7	7	427880	427886	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1075	NC_015948	GCT	2	6	428265	428270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015948	GTG	2	6	428293	428298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015948	CCT	2	6	428532	428537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015948	ATT	2	6	428546	428551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015948	GTC	2	6	430415	430420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015948	TCG	2	6	430435	430440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015948	TCA	2	6	430441	430446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015948	CG	4	8	430449	430456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_015948	GCC	2	6	431021	431026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015948	GCC	2	6	431093	431098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_015948	ATCC	2	8	431108	431115	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015948	CGC	2	6	431124	431129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_015948	CAG	2	6	432068	432073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015948	CGGG	2	8	434574	434581	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_015948	ACAA	2	8	434583	434590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_015948	AGG	2	6	434598	434603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015948	CCG	2	6	434634	434639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015948	ACA	2	6	434645	434650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015948	GTCC	2	8	435269	435276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_015948	TC	3	6	435793	435798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_015948	ACGGC	2	10	436162	436171	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_015948	CTGA	2	8	438763	438770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_015948	TCT	2	6	439445	439450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015948	CGG	2	6	439483	439488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015948	TA	4	8	441998	442005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015948	CGAAC	2	10	442023	442032	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1101	NC_015948	GGC	2	6	442887	442892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015948	GGT	2	6	443611	443616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015948	CGA	2	6	443637	443642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015948	TTAT	2	8	443649	443656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015948	GTA	2	6	443674	443679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015948	GCG	2	6	444616	444621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015948	CAA	2	6	444663	444668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015948	GGT	2	6	444744	444749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015948	CAGT	2	8	444767	444774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_015948	CTG	2	6	445055	445060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015948	TTA	2	6	445092	445097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015948	CGG	2	6	445160	445165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015948	CGG	2	6	445468	445473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015948	GTG	2	6	448123	448128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015948	CGC	2	6	448134	448139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015948	ATC	2	6	450146	450151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015948	G	6	6	450177	450182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015948	GCC	2	6	452001	452006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015948	A	7	7	452025	452031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015948	CCG	2	6	454001	454006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_015948	A	7	7	454012	454018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015948	CTCC	2	8	455063	455070	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_015948	GCC	2	6	455135	455140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_015948	CTC	2	6	455153	455158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_015948	CT	3	6	458179	458184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015948	TGT	2	6	458222	458227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015948	CTG	2	6	458371	458376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015948	GA	3	6	459983	459988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015948	ACG	2	6	460027	460032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015948	TG	3	6	460086	460091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015948	TG	3	6	460121	460126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015948	ACT	2	6	460961	460966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015948	GCC	2	6	460967	460972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_015948	GTCT	2	8	463303	463310	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_015948	TCT	2	6	465655	465660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_015948	AATC	2	8	468828	468835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1138	NC_015948	GCC	2	6	469396	469401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1408	NC_015948	GCT	2	6	601834	601839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_015948	TCA	2	6	601896	601901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_015948	GAC	2	6	602736	602741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_015948	TGG	2	6	606860	606865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_015948	GCC	2	6	606974	606979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1440	NC_015948	CGG	2	6	618027	618032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_015948	CGG	2	6	621480	621485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1489	NC_015948	ATC	2	6	641926	641931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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