MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015944	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015944	CT	3	6	1563	1568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015944	TC	3	6	1589	1594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015944	AT	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015944	CT	3	6	2203	2208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015944	AC	3	6	2290	2295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015944	AT	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015944	TA	3	6	3883	3888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015944	CT	3	6	9445	9450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015944	AC	3	6	9547	9552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015944	AC	3	6	10455	10460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015944	AT	3	6	10539	10544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015944	AC	3	6	10820	10825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015944	GA	3	6	14267	14272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015944	AC	3	6	15431	15436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015944	AC	3	6	15489	15494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015944	AT	3	6	15961	15966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015944	CT	3	6	16835	16840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015944	TA	3	6	18771	18776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015944	TA	3	6	20907	20912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015944	CT	3	6	23723	23728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015944	TA	3	6	23793	23798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015944	TC	3	6	23996	24001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015944	GT	3	6	24174	24179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015944	TA	3	6	24615	24620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015944	AT	3	6	24822	24827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015944	CA	4	8	25186	25193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015944	AT	3	6	25631	25636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015944	CT	3	6	26609	26614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015944	TA	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015944	GT	3	6	29112	29117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015944	TG	3	6	35813	35818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015944	TG	3	6	35864	35869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015944	CG	3	6	36548	36553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015944	TG	3	6	38332	38337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015944	TA	3	6	47166	47171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015944	TC	3	6	50067	50072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015944	TG	3	6	50400	50405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015944	CG	3	6	50684	50689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015944	TA	3	6	50765	50770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015944	CA	3	6	51137	51142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015944	TC	3	6	54487	54492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015944	GT	3	6	56620	56625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015944	AT	3	6	71107	71112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015944	AG	3	6	71726	71731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015944	CT	3	6	72158	72163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015944	AC	3	6	72272	72277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015944	GC	3	6	77809	77814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015944	GA	3	6	80140	80145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015944	TC	3	6	80219	80224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015944	TC	3	6	80804	80809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015944	AT	3	6	80837	80842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015944	TC	3	6	81051	81056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015944	CT	3	6	87547	87552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015944	AC	3	6	95482	95487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015944	AC	3	6	96239	96244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015944	GA	3	6	96267	96272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015944	AT	3	6	96290	96295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015944	GT	3	6	96520	96525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015944	GA	3	6	96685	96690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015944	TA	3	6	96847	96852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015944	AC	4	8	97123	97130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015944	AT	3	6	97375	97380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015944	CA	4	8	101697	101704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015944	CT	3	6	101727	101732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015944	GT	3	6	103086	103091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015944	AC	3	6	103096	103101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015944	TC	3	6	105123	105128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015944	CT	3	6	109672	109677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015944	CA	3	6	112686	112691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015944	GA	3	6	115279	115284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015944	TG	3	6	119620	119625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015944	GC	3	6	126872	126877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015944	AT	3	6	128409	128414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015944	CT	3	6	128426	128431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015944	TC	3	6	138155	138160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015944	AT	3	6	138187	138192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015944	GC	3	6	138211	138216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015944	AC	3	6	138434	138439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015944	GT	3	6	139112	139117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015944	TA	3	6	143294	143299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015944	AT	3	6	143378	143383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015944	AG	4	8	143495	143502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015944	TC	3	6	144741	144746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015944	GT	3	6	150282	150287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015944	TG	3	6	155078	155083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015944	GA	3	6	156387	156392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015944	CA	3	6	157392	157397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015944	AT	3	6	157676	157681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015944	AT	3	6	157701	157706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015944	GA	3	6	159074	159079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015944	AG	3	6	159087	159092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015944	TG	3	6	159113	159118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015944	AT	3	6	159123	159128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015944	TA	3	6	166221	166226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015944	AC	3	6	172050	172055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015944	CT	4	8	180181	180188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015944	AT	3	6	180304	180309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015944	GA	3	6	182844	182849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015944	GA	4	8	182941	182948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015944	TA	3	6	183038	183043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015944	CT	4	8	190095	190102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015944	GT	3	6	190344	190349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015944	TG	3	6	195382	195387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015944	CA	3	6	195425	195430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015944	TC	3	6	198085	198090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015944	CT	3	6	200649	200654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015944	TC	3	6	200700	200705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015944	AG	3	6	200920	200925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015944	TA	3	6	201120	201125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015944	GC	3	6	214780	214785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015944	TG	3	6	214868	214873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015944	AT	3	6	214934	214939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015944	CA	3	6	215722	215727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015944	AG	3	6	219749	219754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015944	GT	3	6	223813	223818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015944	AC	3	6	228561	228566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015944	CG	4	8	228738	228745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015944	CA	3	6	230002	230007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015944	TG	3	6	230470	230475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015944	AC	3	6	230516	230521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015944	GT	3	6	233138	233143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015944	AT	3	6	233411	233416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015944	AT	3	6	244841	244846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015944	AG	3	6	244881	244886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015944	TC	3	6	248808	248813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015944	GC	3	6	249148	249153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015944	AT	3	6	254350	254355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015944	GC	3	6	254368	254373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015944	AG	4	8	255813	255820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015944	TG	3	6	256293	256298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015944	AT	3	6	262155	262160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015944	GT	3	6	262202	262207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015944	TC	4	8	263042	263049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015944	GT	3	6	264142	264147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015944	AT	3	6	265969	265974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015944	GA	3	6	268792	268797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015944	GA	3	6	270318	270323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015944	AC	3	6	273418	273423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015944	TG	3	6	277782	277787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015944	TA	3	6	281148	281153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015944	AT	3	6	281169	281174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015944	CG	3	6	286710	286715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015944	GA	4	8	291714	291721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015944	TG	3	6	292504	292509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015944	CT	3	6	293588	293593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015944	GA	3	6	302184	302189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015944	GT	3	6	304286	304291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015944	GC	3	6	304473	304478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015944	AT	3	6	308361	308366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015944	TA	3	6	309721	309726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015944	CA	4	8	315813	315820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015944	GT	3	6	315977	315982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015944	GT	3	6	317080	317085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015944	AG	3	6	321323	321328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015944	GT	3	6	323331	323336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.