MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 1191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015944	CA	3	6	157392	157397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015944	CGA	2	6	157405	157410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015944	ACTG	2	8	157508	157515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_015944	CTG	2	6	157545	157550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015944	CAG	2	6	157572	157577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015944	ACA	2	6	157630	157635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015944	AT	3	6	157676	157681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015944	AT	3	6	157701	157706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015944	TCCA	2	8	157745	157752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015944	GAC	2	6	157823	157828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015944	GCA	2	6	157829	157834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015944	ACT	2	6	157842	157847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015944	GA	3	6	159074	159079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015944	AG	3	6	159087	159092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015944	TG	3	6	159113	159118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015944	AT	3	6	159123	159128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015944	CTG	2	6	159179	159184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015944	ATG	3	9	159273	159281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015944	GCAG	2	8	162036	162043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_015944	TTAT	2	8	162074	162081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015944	GAC	2	6	162161	162166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015944	A	6	6	164972	164977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015944	CGGGG	2	10	164988	164997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
524	NC_015944	TAA	2	6	166099	166104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015944	A	6	6	166103	166108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015944	GTTT	2	8	166154	166161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015944	AGA	2	6	166179	166184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015944	CCT	2	6	166188	166193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015944	GTC	2	6	166208	166213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015944	TA	3	6	166221	166226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015944	TGC	2	6	166294	166299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015944	ACT	2	6	168961	168966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015944	CCG	2	6	170442	170447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_015944	TAA	2	6	170462	170467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015944	CCT	2	6	170469	170474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_015944	GAG	2	6	170556	170561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015944	AGCC	2	8	170562	170569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
538	NC_015944	GTT	2	6	170585	170590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015944	GTC	2	6	170596	170601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015944	CTG	2	6	170604	170609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015944	ACAG	2	8	170710	170717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_015944	TTA	2	6	170723	170728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015944	CTA	2	6	170731	170736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015944	TCTG	2	8	171947	171954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_015944	GGAGT	2	10	171983	171992	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015944	CGC	2	6	171998	172003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_015944	AGT	2	6	172004	172009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015944	AC	3	6	172050	172055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015944	GTA	2	6	172061	172066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015944	AGT	2	6	172388	172393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015944	TCGG	2	8	172403	172410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_015944	CCAC	2	8	172411	172418	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
553	NC_015944	TAAC	2	8	172455	172462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_015944	TCC	2	6	172532	172537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015944	TAT	3	9	172627	172635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015944	TCC	2	6	172701	172706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_015944	GAG	2	6	172707	172712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015944	ATC	2	6	172804	172809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015944	AGT	2	6	175900	175905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015944	AAC	2	6	178506	178511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015944	CAAA	2	8	178571	178578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_015944	TAA	2	6	180128	180133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015944	GTT	2	6	180136	180141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015944	CT	4	8	180181	180188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_015944	TAC	2	6	180189	180194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015944	GAG	2	6	180276	180281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015944	CCT	3	9	180288	180296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015944	AT	3	6	180304	180309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015944	GGT	2	6	180383	180388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015944	C	6	6	181201	181206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
571	NC_015944	TTA	2	6	181225	181230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015944	CTA	2	6	181339	181344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015944	ATT	2	6	181345	181350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015944	CGGA	2	8	181381	181388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015944	GA	3	6	182844	182849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015944	GA	4	8	182941	182948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015944	TAA	2	6	182962	182967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015944	GTA	2	6	182995	183000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015944	TA	3	6	183038	183043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015944	GAT	2	6	183086	183091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015944	GGT	2	6	183145	183150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015944	TGT	2	6	184230	184235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015944	ATG	2	6	184286	184291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015944	GCG	2	6	184320	184325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015944	GTT	2	6	185507	185512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015944	GAC	2	6	186728	186733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015944	CT	4	8	190095	190102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015944	CCGG	2	8	190171	190178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_015944	GTTA	2	8	190225	190232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015944	GAC	2	6	190248	190253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015944	ATC	2	6	190285	190290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015944	GT	3	6	190344	190349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015944	AACC	2	8	191136	191143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_015944	GAC	2	6	191152	191157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015944	ACT	2	6	195360	195365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015944	TG	3	6	195382	195387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015944	CA	3	6	195425	195430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_015944	TGT	2	6	197400	197405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015944	C	6	6	197409	197414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
600	NC_015944	TTG	2	6	198068	198073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015944	TC	3	6	198085	198090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_015944	CAC	2	6	198091	198096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_015944	AGC	2	6	198099	198104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015944	CTT	2	6	198109	198114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015944	AGA	2	6	198121	198126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015944	TCAC	2	8	198129	198136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015944	TATAA	2	10	198162	198171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015944	CTC	2	6	198246	198251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_015944	TTC	2	6	198258	198263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015944	CTC	2	6	198367	198372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_015944	CGA	2	6	198392	198397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015944	ACA	2	6	200352	200357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015944	TCG	2	6	200379	200384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015944	CGC	2	6	200391	200396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_015944	CTT	2	6	200415	200420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015944	CTGATA	2	12	200433	200444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_015944	AGC	2	6	200562	200567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015944	CT	3	6	200649	200654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_015944	TC	3	6	200700	200705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_015944	GCG	2	6	200761	200766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015944	ACGTC	2	10	200771	200780	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
622	NC_015944	GGA	2	6	200853	200858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015944	GAC	3	9	200910	200918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015944	AG	3	6	200920	200925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015944	ACGG	2	8	200944	200951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_015944	T	7	7	200972	200978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015944	GCT	2	6	201068	201073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015944	AAC	2	6	201083	201088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015944	CGG	2	6	201099	201104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015944	TA	3	6	201120	201125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015944	CGC	2	6	201129	201134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015944	GCC	2	6	205619	205624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015944	CAG	2	6	206130	206135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015944	CGGC	2	8	206139	206146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_015944	CGT	2	6	206756	206761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015944	TCG	2	6	206766	206771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015944	CGT	2	6	208608	208613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015944	AAT	2	6	208614	208619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015944	CAT	2	6	208685	208690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_015944	GCC	2	6	264285	264290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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915	NC_015944	GGT	2	6	317580	317585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_015944	CAG	2	6	321263	321268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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924	NC_015944	CA	3	6	322211	322216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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928	NC_015944	T	6	6	323378	323383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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933	NC_015944	GT	3	6	324890	324895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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937	NC_015944	TG	3	6	326344	326349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
938	NC_015944	GT	3	6	326363	326368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
939	NC_015944	AGG	2	6	326391	326396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_015944	GTT	2	6	332768	332773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_015944	GTA	3	9	334193	334201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
953	NC_015944	AT	3	6	334240	334245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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959	NC_015944	CATA	2	8	338786	338793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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