MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015717	GGGAGA	2	12	60890	60901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015717	ATCGCG	2	12	79532	79543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015717	TGTCGA	2	12	79811	79822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015717	CAAAGG	2	12	111768	111779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015717	ACGTCA	2	12	132692	132703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015717	CGTGCG	2	12	190140	190151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015717	TGTTCC	2	12	218758	218769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015717	AGGTAT	2	12	270752	270763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015717	GCGAGG	2	12	278923	278934	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015717	GCAATT	2	12	280147	280158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015717	CGTTAA	2	12	302061	302072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015717	CGCACG	2	12	454984	454995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015717	TCCGCA	2	12	460531	460542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015717	TTCAGA	2	12	493469	493480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015717	CGTTTG	2	12	541458	541469	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015717	CGGAGA	2	12	656782	656793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015717	GCAAGC	3	18	693152	693169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015717	TTCGCG	2	12	819566	819577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015717	CTTCTC	2	12	829448	829459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015717	CCCCCG	2	12	863832	863843	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_015717	GTCGCC	2	12	883062	883073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015717	TGAAAA	2	12	889290	889301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015717	ACGAGC	2	12	966398	966409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015717	GTTGCT	2	12	978980	978991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015717	CCTGCC	2	12	1004203	1004214	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015717	AATCGG	2	12	1009349	1009360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015717	GCACGC	2	12	1021848	1021859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015717	CGCTTC	2	12	1038770	1038781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015717	TTTCCG	2	12	1089007	1089018	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015717	GCCGAA	2	12	1199493	1199504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015717	CTGTTT	2	12	1275547	1275558	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015717	AAAGGA	2	12	1284430	1284441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015717	CAGTTG	2	12	1308521	1308532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015717	CGGCTC	2	12	1323314	1323325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015717	TTCTTT	2	12	1344710	1344721	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015717	TGCCGA	2	12	1356004	1356015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015717	CAAAAT	2	12	1409211	1409222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015717	CTTTTT	2	12	1422933	1422944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015717	CATCTC	2	12	1435630	1435641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015717	TTTCAT	2	12	1435968	1435979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015717	GATGGG	2	12	1438930	1438941	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015717	GCGATC	2	12	1469299	1469310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015717	TGGGCG	2	12	1478551	1478562	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015717	TATCTT	2	12	1487292	1487303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015717	TCTCCC	2	12	1501121	1501132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015717	GATATG	2	12	1536926	1536937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015717	CGATCC	2	12	1593800	1593811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015717	CCGGAA	2	12	1707468	1707479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015717	ATCTAC	2	12	1708304	1708315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015717	AGTTTG	2	12	1738772	1738783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015717	CGACAA	13	78	1754796	1754873	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015717	TGCGGC	2	12	1818497	1818508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015717	AGCGCC	2	12	1826039	1826050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015717	TGGGGG	2	12	1841190	1841201	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015717	TCCCGA	2	12	1895449	1895460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015717	ACGCGA	2	12	1913693	1913704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015717	GAACAA	2	12	1942874	1942885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015717	TCTTTC	2	12	2000755	2000766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015717	CGCCCA	2	12	2060716	2060727	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015717	AAGAGA	2	12	2133361	2133372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015717	GGAACA	2	12	2187262	2187273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015717	AGCGCC	2	12	2194824	2194835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015717	CCCTCA	2	12	2273251	2273262	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015717	CAAAAA	2	12	2286749	2286760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015717	ACATCC	2	12	2305230	2305241	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015717	GACCCT	2	12	2315974	2315985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015717	GGGCCG	2	12	2316113	2316124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015717	GGCGTT	2	12	2339160	2339171	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015717	AGCTAA	2	12	2347449	2347460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015717	CCGGTT	2	12	2364396	2364407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015717	CGAGGT	2	12	2493510	2493521	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015717	CGGGAA	2	12	2719608	2719619	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015717	GAGCGC	2	12	2780692	2780703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015717	AGAGAA	2	12	2845098	2845109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015717	AGCAGT	2	12	2889273	2889284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015717	GCGACG	2	12	2934469	2934480	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015717	TCAGCA	2	12	3108760	3108771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015717	CGCGAT	2	12	3182412	3182423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015717	ATGACG	2	12	3225586	3225597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015717	ATGCTT	2	12	3240921	3240932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015717	GTTTTC	2	12	3297117	3297128	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015717	AATGGC	2	12	3322844	3322855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015717	GAACCG	2	12	3344383	3344394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015717	CGAACG	2	12	3345529	3345540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015717	ACAGAA	2	12	3365734	3365745	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015717	CCTTCA	2	12	3376338	3376349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015717	TTTGAA	2	12	3391896	3391907	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015717	ATTCCA	2	12	3441576	3441587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015717	GAAGGT	2	12	3494552	3494563	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015717	GACCAG	2	12	3582302	3582313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015717	GCCGAC	2	12	3610177	3610188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015717	GTCTCC	2	12	3690602	3690613	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015717	GTTGCG	2	12	3745997	3746008	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015717	TTTCTG	2	12	3773219	3773230	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015717	CAAAAA	2	12	3813179	3813190	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015717	AAAGAG	2	12	3838742	3838753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015717	GACGCG	2	12	3875258	3875269	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015717	CACAAT	2	12	3875354	3875365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015717	ATTAAG	2	12	3898390	3898401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015717	TCGGCG	2	12	3991992	3992003	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015717	TCCGTC	2	12	4037628	4037639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015717	CGGTGG	2	12	4065940	4065951	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015717	TGCCGC	2	12	4077006	4077017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015717	CGATTG	2	12	4128835	4128846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015717	TGCATC	2	12	4156157	4156168	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015717	GGAACG	2	12	4258004	4258015	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015717	GAATAT	2	12	4309589	4309600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015717	ATTCAA	2	12	4364327	4364338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015717	ACCCTG	2	12	4406607	4406618	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015717	CAGCGG	2	12	4422676	4422687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015717	ATAGCA	2	12	4448793	4448804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015717	GGCCGC	2	12	4457952	4457963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015717	TCGTAT	2	12	4461583	4461594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015717	CAAAGG	2	12	4574712	4574723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015717	GCCGTG	2	12	4587952	4587963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015717	TACGAA	2	12	4603476	4603487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015717	CGCTCA	2	12	4650402	4650413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015717	AGCGAA	2	12	4658805	4658816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015717	GGGCGC	2	12	4662711	4662722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015717	TTTTGG	2	12	4667907	4667918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015717	CCGGCT	2	12	4719884	4719895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015717	GAACGT	2	12	4719899	4719910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015717	ATCCGG	2	12	4745063	4745074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015717	CTCGGC	2	12	4752155	4752166	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.