MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015666	ACC	2	6	808150	808155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_015666	GAAC	2	8	808156	808163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_015666	CCGT	2	8	808250	808257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_015666	CG	3	6	808262	808267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_015666	TCG	3	9	812463	812471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_015666	CGTC	2	8	812478	812485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_015666	GAA	2	6	812536	812541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_015666	TAT	2	6	812544	812549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015666	ACT	2	6	812559	812564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_015666	GC	3	6	813823	813828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_015666	CGC	2	6	814215	814220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_015666	TCGG	2	8	814230	814237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_015666	CGC	2	6	814242	814247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_015666	CT	3	6	814271	814276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_015666	GCG	2	6	814311	814316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015666	CGA	2	6	814348	814353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_015666	TA	3	6	814413	814418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015666	CGGC	2	8	814794	814801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_015666	CGA	2	6	814809	814814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_015666	CCG	2	6	815798	815803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_015666	GAC	2	6	815852	815857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015666	CGG	2	6	816361	816366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_015666	GCGA	2	8	816699	816706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_015666	GCA	2	6	816730	816735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_015666	CCG	2	6	817295	817300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_015666	CGC	2	6	817309	817314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_015666	CGA	2	6	817321	817326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_015666	TCG	2	6	819150	819155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_015666	CG	3	6	819161	819166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_015666	CCG	2	6	819175	819180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_015666	GCTC	2	8	819202	819209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_015666	CT	3	6	819326	819331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_015666	ACC	2	6	819340	819345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_015666	CTC	2	6	819371	819376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_015666	AT	3	6	819440	819445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_015666	GGC	2	6	821795	821800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_015666	CT	3	6	821821	821826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_015666	ACT	2	6	821831	821836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_015666	CGG	2	6	824654	824659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_015666	GA	3	6	824722	824727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015666	TG	3	6	824754	824759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015666	AC	3	6	824766	824771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_015666	AT	3	6	824772	824777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015666	ATT	2	6	824803	824808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015666	CCA	2	6	825220	825225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_015666	CGG	2	6	825246	825251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_015666	CAC	2	6	825255	825260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_015666	GC	3	6	825282	825287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_015666	TTC	2	6	825313	825318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_015666	GAC	2	6	825351	825356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_015666	C	6	6	825379	825384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2552	NC_015666	CG	3	6	825407	825412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_015666	GAC	2	6	825456	825461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_015666	CGTC	2	8	825469	825476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_015666	GAC	2	6	827819	827824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_015666	GGC	2	6	827840	827845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_015666	CGG	2	6	827851	827856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_015666	CGGTC	2	10	827872	827881	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2559	NC_015666	GAC	2	6	827884	827889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_015666	CGG	2	6	827925	827930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_015666	TC	3	6	830485	830490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_015666	GTC	2	6	830503	830508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_015666	GCG	2	6	830581	830586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_015666	TCT	2	6	832406	832411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_015666	TCG	2	6	832465	832470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_015666	TA	3	6	832565	832570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015666	GCC	2	6	832615	832620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_015666	ACG	2	6	832624	832629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_015666	CG	4	8	832651	832658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_015666	GGTA	2	8	832679	832686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_015666	GCG	2	6	832746	832751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2573	NC_015666	TCG	3	9	833861	833869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_015666	GTC	2	6	833898	833903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_015666	CGT	2	6	833990	833995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2577	NC_015666	CCTGGC	2	12	834059	834070	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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2579	NC_015666	CGGT	2	8	835187	835194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_015666	GC	3	6	835686	835691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_015666	CGAGAC	2	12	835715	835726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_015666	ACGGA	2	10	836151	836160	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2584	NC_015666	GCC	2	6	836190	836195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2589	NC_015666	CGC	2	6	836520	836525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_015666	CGC	2	6	837834	837839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2592	NC_015666	GC	3	6	837856	837861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_015666	AAT	2	6	837916	837921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_015666	GC	3	6	837951	837956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_015666	CGCT	2	8	838023	838030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2598	NC_015666	TCG	2	6	838076	838081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_015666	CGG	2	6	839159	839164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_015666	TG	4	8	839215	839222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_015666	CGG	2	6	840580	840585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_015666	CTG	2	6	840599	840604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_015666	ATC	2	6	840638	840643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_015666	GAC	2	6	840941	840946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_015666	CTGAC	2	10	840955	840964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2606	NC_015666	CGCAC	2	10	841039	841048	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2607	NC_015666	CAG	2	6	841055	841060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_015666	ACCGC	2	10	841076	841085	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2609	NC_015666	CGC	3	9	841124	841132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_015666	GCT	2	6	841215	841220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_015666	CCGG	2	8	841243	841250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_015666	GTC	2	6	841301	841306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015666	ACG	2	6	841334	841339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_015666	TTGC	2	8	841340	841347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_015666	GCT	2	6	843437	843442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2618	NC_015666	GC	3	6	845828	845833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_015666	CGCT	2	8	845843	845850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_015666	TCGG	2	8	845925	845932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2621	NC_015666	GC	3	6	845957	845962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_015666	CGT	2	6	846033	846038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2624	NC_015666	GCG	2	6	847053	847058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_015666	CCGG	2	8	847084	847091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2631	NC_015666	GCT	2	6	849147	849152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_015666	CGGCT	2	10	849162	849171	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2633	NC_015666	GC	3	6	849173	849178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_015666	CCG	2	6	849191	849196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2905	NC_015666	CACC	2	8	928617	928624	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2906	NC_015666	TCGGA	2	10	928662	928671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2938	NC_015666	CTT	2	6	940250	940255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2941	NC_015666	CAG	2	6	940309	940314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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