MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015666	CGT	2	6	173109	173114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015666	GTA	2	6	173125	173130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015666	CGGC	2	8	173150	173157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_015666	TCG	2	6	173180	173185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015666	CGA	2	6	173193	173198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015666	GTC	2	6	173245	173250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015666	GTT	2	6	173365	173370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015666	TCGA	2	8	173376	173383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015666	CG	3	6	173396	173401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015666	CGG	2	6	173424	173429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015666	ACTC	2	8	173458	173465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_015666	GAC	2	6	173467	173472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015666	AAG	2	6	173497	173502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015666	CCG	2	6	173532	173537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015666	ACG	2	6	173591	173596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015666	CGA	2	6	173733	173738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015666	GAG	2	6	173749	173754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015666	TC	4	8	175710	175717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_015666	GGA	2	6	175735	175740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015666	CGT	2	6	175756	175761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015666	CGC	2	6	175768	175773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015666	CGC	2	6	175810	175815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015666	GAG	2	6	175839	175844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015666	ACG	2	6	175880	175885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015666	GATC	2	8	177430	177437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_015666	CT	3	6	177439	177444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015666	GA	3	6	177448	177453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015666	CCG	2	6	177738	177743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015666	GGC	3	9	177748	177756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015666	CT	3	6	177783	177788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015666	GTC	2	6	177847	177852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015666	TCGG	2	8	179134	179141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_015666	TAGA	2	8	180284	180291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015666	A	6	6	180493	180498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015666	GCT	2	6	181358	181363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015666	CCCG	2	8	181458	181465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
537	NC_015666	GCG	2	6	181548	181553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015666	GTGA	2	8	181639	181646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015666	GAC	2	6	181665	181670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015666	CGG	2	6	181682	181687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015666	CTC	2	6	181692	181697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_015666	CGG	2	6	181751	181756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015666	CCG	2	6	181764	181769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_015666	CG	3	6	181768	181773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015666	CCG	2	6	183876	183881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_015666	CA	3	6	183953	183958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_015666	TGCG	2	8	184021	184028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015666	GAGC	2	8	184043	184050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_015666	CGCGTC	2	12	184058	184069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015666	CG	3	6	184118	184123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015666	GC	3	6	184167	184172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015666	CA	3	6	184212	184217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015666	CGAA	2	8	185174	185181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_015666	GCC	2	6	185452	185457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015666	GGC	2	6	185498	185503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015666	GCA	2	6	185953	185958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015666	CCG	2	6	185974	185979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_015666	CG	3	6	186003	186008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015666	CGA	2	6	186016	186021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015666	TAA	2	6	186307	186312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015666	GAAC	2	8	186319	186326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_015666	GAA	2	6	186426	186431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015666	TCCC	2	8	186446	186453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
564	NC_015666	AT	3	6	186455	186460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015666	GTCG	2	8	186486	186493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_015666	GCG	2	6	186762	186767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015666	TGCT	2	8	186788	186795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_015666	CAGT	2	8	186796	186803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_015666	CGAC	2	8	186840	186847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_015666	CGTC	2	8	186887	186894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
571	NC_015666	GCC	2	6	187771	187776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_015666	CTCG	2	8	187777	187784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_015666	CCG	3	9	187789	187797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015666	AAG	2	6	187834	187839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015666	CGA	2	6	188732	188737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015666	CGT	2	6	188993	188998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015666	CTC	2	6	189040	189045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_015666	ACT	2	6	189061	189066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015666	GTC	2	6	189076	189081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015666	GCGG	2	8	190175	190182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015666	CGC	2	6	190213	190218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_015666	GGCT	2	8	190229	190236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
583	NC_015666	CGG	2	6	190244	190249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015666	CGG	2	6	190282	190287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015666	GTC	3	9	190316	190324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015666	CGC	2	6	190370	190375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015666	ACCGC	2	10	190389	190398	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
588	NC_015666	CGA	2	6	190401	190406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015666	GC	3	6	192696	192701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_015666	CGG	2	6	192711	192716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015666	CGT	2	6	192759	192764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015666	CGT	2	6	192769	192774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015666	GCG	2	6	192778	192783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015666	CGCTCG	2	12	192785	192796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015666	CG	3	6	192820	192825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_015666	CGACGG	2	12	192848	192859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015666	CGT	2	6	192932	192937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015666	GCA	2	6	192944	192949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015666	CCG	2	6	192960	192965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_015666	TCGG	2	8	192968	192975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_015666	GTC	2	6	194451	194456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015666	CAG	2	6	194459	194464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015666	AGA	2	6	194503	194508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015666	GTGTGG	2	12	195139	195150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015666	GCTT	2	8	195161	195168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_015666	GCC	2	6	195268	195273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_015666	GAAAC	2	10	195312	195321	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
608	NC_015666	TCG	2	6	195699	195704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015666	GGC	2	6	195708	195713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015666	CGG	2	6	195763	195768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015666	AGC	2	6	195781	195786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015666	ATCG	2	8	196779	196786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
613	NC_015666	TCG	2	6	196802	196807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015666	TC	3	6	197646	197651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_015666	TGGT	2	8	197659	197666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015666	GCC	3	9	197728	197736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015666	CGTG	2	8	198252	198259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015666	CGTA	2	8	198313	198320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_015666	TCGA	2	8	198352	198359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_015666	GGCA	2	8	198572	198579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_015666	CGC	2	6	198598	198603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_015666	CGT	2	6	198634	198639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015666	ACGA	2	8	198640	198647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_015666	CGG	3	9	198676	198684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015666	TCCC	2	8	198723	198730	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
626	NC_015666	CCG	2	6	198836	198841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015666	GAC	2	6	198847	198852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015666	CA	3	6	200507	200512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_015666	CGCGA	2	10	200537	200546	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
630	NC_015666	CCG	2	6	201455	201460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015666	TCG	3	9	202604	202612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015666	TCCG	2	8	202646	202653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015666	ACGA	2	8	202723	202730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_015666	TCA	2	6	202765	202770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015666	GAG	2	6	202777	202782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015666	CGGG	2	8	202851	202858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015666	AGAC	2	8	202874	202881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_015666	TGG	2	6	202883	202888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015666	GAG	2	6	202923	202928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015666	TTC	2	6	205323	205328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_015666	GGT	2	6	205495	205500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015666	CGA	3	9	207828	207836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_015666	CGAT	2	8	207869	207876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
644	NC_015666	ACC	2	6	209231	209236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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646	NC_015666	GAC	2	6	209275	209280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_015666	CGGA	2	8	210210	210217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
652	NC_015666	CGG	2	6	210219	210224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_015666	CGG	2	6	212717	212722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_015666	CG	3	6	212723	212728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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674	NC_015666	CTTA	2	8	213849	213856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
675	NC_015666	ATC	2	6	213891	213896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_015666	CAT	2	6	214411	214416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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712	NC_015666	CG	4	8	224037	224044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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756	NC_015666	CG	4	8	243844	243851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
757	NC_015666	TCC	2	6	243902	243907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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759	NC_015666	AGAA	2	8	243993	244000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_015666	GAG	2	6	244025	244030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
762	NC_015666	ACG	2	6	244034	244039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_015666	CCG	2	6	244086	244091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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768	NC_015666	TGG	2	6	247922	247927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
769	NC_015666	GCG	2	6	247952	247957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_015666	CT	3	6	247976	247981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
771	NC_015666	CCGC	2	8	247997	248004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
772	NC_015666	TCG	2	6	248007	248012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_015666	GCG	2	6	248029	248034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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