MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	TC	3	6	1319	1324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015658	AC	3	6	1531	1536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015658	CG	3	6	2242	2247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015658	TC	3	6	2355	2360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015658	CT	3	6	2531	2536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015658	CT	3	6	2546	2551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015658	CT	3	6	2557	2562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015658	TG	3	6	2642	2647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015658	AT	3	6	2674	2679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015658	TA	3	6	3243	3248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015658	AG	3	6	4102	4107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015658	GT	3	6	4207	4212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015658	AG	3	6	4769	4774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015658	CT	3	6	6458	6463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015658	TC	3	6	6785	6790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015658	AG	3	6	6908	6913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015658	TA	3	6	9261	9266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015658	TA	3	6	9455	9460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015658	TG	3	6	9622	9627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015658	AC	3	6	10988	10993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015658	CA	3	6	13688	13693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015658	AT	3	6	13967	13972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015658	TC	3	6	14773	14778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015658	TC	3	6	14912	14917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015658	TC	3	6	15150	15155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015658	TC	3	6	15267	15272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015658	TC	3	6	16036	16041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015658	TC	3	6	18962	18967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015658	TG	3	6	18974	18979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015658	CG	3	6	19016	19021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015658	CT	3	6	26724	26729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015658	TG	3	6	26747	26752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015658	CT	3	6	30511	30516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015658	AC	3	6	33892	33897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015658	TC	3	6	33924	33929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015658	TG	3	6	40671	40676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015658	CT	3	6	47013	47018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015658	TA	3	6	47069	47074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015658	TC	4	8	47144	47151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015658	TA	3	6	50829	50834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015658	TC	3	6	53278	53283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015658	AT	3	6	57610	57615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015658	CG	3	6	62182	62187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015658	AT	3	6	65637	65642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015658	TA	3	6	65773	65778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015658	AT	3	6	69526	69531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015658	CG	3	6	80311	80316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015658	CA	3	6	80326	80331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015658	GA	3	6	82837	82842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015658	TC	3	6	86226	86231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015658	CA	3	6	92031	92036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015658	TG	3	6	92041	92046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015658	CA	3	6	93151	93156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015658	CG	3	6	93184	93189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015658	TC	3	6	96714	96719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015658	TA	4	8	96741	96748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015658	TC	3	6	98782	98787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015658	CA	3	6	99693	99698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015658	GC	3	6	99805	99810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015658	CT	3	6	104304	104309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015658	TA	3	6	105761	105766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015658	CG	3	6	116284	116289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015658	AC	3	6	117866	117871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015658	GA	3	6	119901	119906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015658	CA	3	6	120994	120999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015658	CA	3	6	121301	121306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015658	TA	3	6	122913	122918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015658	CA	4	8	124545	124552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015658	GC	3	6	127993	127998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015658	TC	3	6	130944	130949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015658	AT	3	6	132999	133004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015658	AG	3	6	133644	133649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015658	TC	3	6	135030	135035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015658	TC	3	6	136316	136321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015658	CG	3	6	139222	139227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015658	TC	3	6	144390	144395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015658	AG	3	6	144406	144411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015658	AC	3	6	144429	144434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015658	CG	3	6	149099	149104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015658	AT	3	6	153530	153535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015658	AT	4	8	162107	162114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015658	TA	3	6	169144	169149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015658	GA	3	6	169179	169184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015658	AT	3	6	171342	171347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015658	GA	3	6	175519	175524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015658	AT	3	6	181341	181346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015658	AG	3	6	201798	201803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015658	AT	3	6	201935	201940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015658	AT	3	6	203075	203080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015658	TA	3	6	208266	208271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015658	AG	4	8	210880	210887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015658	TC	3	6	213201	213206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015658	TA	3	6	220345	220350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015658	TA	3	6	222664	222669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015658	TA	3	6	222671	222676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015658	GA	3	6	227239	227244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015658	TC	3	6	227373	227378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015658	TA	3	6	227506	227511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015658	CG	3	6	234079	234084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015658	CA	3	6	234102	234107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015658	AT	3	6	238077	238082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015658	CT	3	6	238126	238131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015658	TA	3	6	238265	238270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015658	GT	3	6	241089	241094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015658	TG	3	6	243264	243269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015658	CG	3	6	243445	243450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015658	TG	3	6	252110	252115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015658	TG	3	6	252158	252163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015658	CA	3	6	252171	252176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015658	GT	3	6	257681	257686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015658	AC	3	6	258075	258080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015658	CG	3	6	260443	260448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015658	TA	4	8	260449	260456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015658	AT	3	6	263268	263273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015658	CT	3	6	268782	268787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015658	GC	3	6	270812	270817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015658	GC	3	6	272940	272945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015658	AC	3	6	276636	276641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015658	CG	3	6	278100	278105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015658	AC	3	6	282548	282553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015658	GC	3	6	285438	285443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015658	AT	3	6	285584	285589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015658	CT	3	6	288902	288907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015658	GA	3	6	289182	289187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015658	GA	3	6	289446	289451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015658	GC	4	8	289525	289532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015658	TG	3	6	294186	294191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015658	TG	3	6	294376	294381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015658	GT	3	6	294406	294411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015658	GA	3	6	294568	294573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015658	CA	3	6	298200	298205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015658	CT	3	6	300594	300599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015658	TG	4	8	300642	300649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015658	GT	3	6	303516	303521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015658	GA	3	6	304799	304804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015658	TC	3	6	311688	311693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015658	TA	3	6	315317	315322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015658	AG	4	8	316331	316338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015658	TC	3	6	321327	321332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015658	CT	3	6	322683	322688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015658	CG	3	6	323841	323846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015658	AG	3	6	324003	324008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015658	AC	3	6	324067	324072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015658	CG	3	6	324126	324131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015658	AT	3	6	330387	330392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015658	CG	3	6	334083	334088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015658	CG	3	6	343037	343042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015658	GA	3	6	348095	348100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015658	CA	5	10	348830	348839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015658	GA	4	8	358326	358333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015658	CG	3	6	359425	359430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015658	AG	3	6	359524	359529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015658	AC	3	6	359559	359564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015658	TA	3	6	359704	359709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015658	GA	3	6	361579	361584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.