MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	TGA	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015513	ATT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015513	GTT	2	6	8724	8729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015513	CTT	2	6	9625	9630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015513	AAT	2	6	9655	9660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015513	AAT	2	6	9725	9730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015513	GAC	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015513	GCC	2	6	9867	9872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015513	TCT	2	6	10024	10029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015513	GTT	2	6	16746	16751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015513	AGT	2	6	16773	16778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015513	GTT	2	6	18700	18705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015513	TAG	2	6	18724	18729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015513	AAC	2	6	18742	18747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015513	TGC	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015513	TAA	2	6	28811	28816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015513	ACT	2	6	33196	33201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015513	GGA	2	6	33214	33219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015513	CGA	2	6	33331	33336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015513	ACC	2	6	33411	33416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015513	TCA	2	6	35011	35016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015513	ATT	2	6	38307	38312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015513	CTT	2	6	39347	39352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015513	TTG	2	6	39383	39388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015513	GCA	2	6	39408	39413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015513	TTA	2	6	41104	41109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015513	CTG	2	6	41161	41166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015513	TTA	2	6	42097	42102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015513	GAA	2	6	45589	45594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015513	TAC	2	6	45603	45608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015513	TAT	2	6	47943	47948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015513	GTT	2	6	48012	48017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015513	GCA	2	6	48175	48180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015513	ACA	2	6	48238	48243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015513	ATT	2	6	48247	48252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015513	TCA	2	6	48349	48354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015513	ACC	2	6	48507	48512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015513	GTT	2	6	52107	52112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015513	TAT	2	6	52151	52156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015513	CCG	2	6	53082	53087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015513	ACA	2	6	56261	56266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015513	TGG	2	6	59363	59368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015513	TCC	2	6	59412	59417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015513	TTC	2	6	59432	59437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015513	AAT	2	6	60447	60452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015513	CTC	2	6	60603	60608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015513	AGC	2	6	60639	60644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015513	AAG	2	6	60987	60992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015513	CAA	2	6	61020	61025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015513	GAT	3	9	61057	61065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015513	CCA	2	6	61100	61105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015513	AGT	2	6	61266	61271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015513	CCA	2	6	61370	61375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015513	GAT	2	6	61402	61407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015513	GTA	2	6	61420	61425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015513	CAA	2	6	61474	61479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015513	TAC	3	9	61594	61602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015513	ACC	2	6	61831	61836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015513	TAT	2	6	62021	62026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015513	TGG	2	6	62151	62156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015513	ATA	2	6	62167	62172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015513	CTT	2	6	62431	62436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015513	CTC	2	6	62585	62590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015513	TGC	2	6	64209	64214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015513	ATC	2	6	64503	64508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015513	GTT	2	6	64686	64691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015513	ACC	3	9	64721	64729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015513	TTG	2	6	64794	64799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015513	CTT	2	6	64965	64970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015513	CAG	2	6	65009	65014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015513	AAC	2	6	66210	66215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015513	AAG	2	6	66314	66319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015513	CGA	2	6	66366	66371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015513	TGG	2	6	66395	66400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015513	CGA	2	6	66426	66431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015513	CCG	2	6	66446	66451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015513	AGC	2	6	66477	66482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015513	GCT	2	6	66486	66491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015513	TGG	2	6	66611	66616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015513	CTC	2	6	66636	66641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015513	GCA	2	6	66669	66674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015513	GAG	2	6	66790	66795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015513	AAC	2	6	66854	66859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015513	TCG	2	6	67039	67044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015513	GTG	2	6	67052	67057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015513	ACC	2	6	67061	67066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015513	CCT	2	6	67076	67081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015513	TCC	2	6	67324	67329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015513	ATA	2	6	67553	67558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015513	AAT	2	6	67605	67610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015513	ATT	2	6	67753	67758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015513	TAA	2	6	67810	67815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015513	GAT	2	6	67909	67914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015513	ATT	2	6	68009	68014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015513	CAA	2	6	68697	68702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015513	GAG	2	6	69166	69171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015513	TGT	2	6	69871	69876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015513	ATC	2	6	69916	69921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015513	CCT	2	6	75115	75120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015513	TTG	2	6	77863	77868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015513	TGC	2	6	77939	77944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015513	GGC	2	6	77964	77969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015513	AGT	2	6	77983	77988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015513	TCA	2	6	78059	78064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015513	ACA	2	6	78088	78093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015513	TGA	2	6	78106	78111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015513	GAT	2	6	78132	78137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015513	ACA	2	6	79204	79209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015513	ACC	2	6	79318	79323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015513	TTG	2	6	79327	79332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015513	GAG	2	6	80398	80403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015513	GTT	2	6	80604	80609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015513	GCG	2	6	80622	80627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015513	CTT	2	6	80763	80768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015513	TTG	2	6	83082	83087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015513	GTG	2	6	83173	83178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015513	CCA	2	6	84357	84362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015513	GCA	2	6	87670	87675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015513	TCT	2	6	89878	89883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015513	GCA	2	6	90086	90091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015513	CCA	2	6	90092	90097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015513	TGT	2	6	90218	90223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015513	AGT	2	6	90340	90345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015513	CCA	2	6	90557	90562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015513	GTT	3	9	90575	90583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015513	TAA	2	6	90678	90683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015513	CAG	2	6	90695	90700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015513	GAA	2	6	90763	90768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015513	TGA	2	6	92002	92007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.