MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	CATA	2	8	8438	8445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015512	CATG	2	8	8465	8472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015512	TAAA	2	8	38714	38721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015512	TCCA	2	8	39492	39499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015512	GTTG	2	8	42206	42213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015512	GAAA	2	8	42399	42406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015512	ATAA	2	8	49496	49503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015512	TTGG	2	8	50033	50040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015512	AAGG	2	8	50111	50118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015512	CATA	2	8	52830	52837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015512	AAGT	2	8	54499	54506	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015512	AAAC	2	8	54572	54579	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015512	CTTC	2	8	54597	54604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015512	CTTG	2	8	56143	56150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015512	TTGC	2	8	56195	56202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015512	CTCG	2	8	56411	56418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015512	CTGG	2	8	56445	56452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015512	TATG	2	8	57514	57521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015512	ATAC	2	8	57550	57557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015512	CCTA	2	8	57685	57692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015512	CATG	2	8	63723	63730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015512	TCAA	2	8	63803	63810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015512	AAAT	2	8	67049	67056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015512	TGTT	2	8	71059	71066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015512	TGAT	2	8	80186	80193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015512	TTGT	2	8	80464	80471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015512	TTTG	2	8	81374	81381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015512	GCTA	2	8	83560	83567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015512	CTGC	2	8	83774	83781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015512	AATC	2	8	83845	83852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015512	GATT	2	8	84556	84563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015512	TTAA	2	8	85892	85899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015512	TTCG	2	8	86185	86192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015512	GAAT	2	8	87810	87817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015512	CGAG	2	8	91362	91369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015512	CATC	2	8	94966	94973	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015512	TCTT	2	8	96121	96128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015512	ATTT	2	8	97340	97347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015512	AATA	2	8	115921	115928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015512	CAAG	2	8	119777	119784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015512	TTGG	2	8	124203	124210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015512	AGCC	2	8	125874	125881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015512	AATT	2	8	132864	132871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015512	ATTT	2	8	132958	132965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015512	AGGA	2	8	135139	135146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015512	TAAA	2	8	137123	137130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015512	GGTT	2	8	143654	143661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015512	GACA	2	8	143717	143724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.