MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	GAG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015512	AAT	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015512	GAA	2	6	213	218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015512	AAC	2	6	617	622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015512	ATT	2	6	644	649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015512	CGG	2	6	7745	7750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015512	GTT	2	6	7764	7769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015512	CAG	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015512	TGA	2	6	7943	7948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015512	AGA	2	6	7954	7959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015512	TAA	2	6	8487	8492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015512	TAG	3	9	8507	8515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015512	CAG	2	6	15518	15523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015512	GAC	2	6	24089	24094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015512	TAT	2	6	30925	30930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015512	CCG	2	6	31638	31643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015512	CTG	2	6	32348	32353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015512	CTG	3	9	32398	32406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015512	TAA	2	6	32460	32465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015512	TAA	2	6	32490	32495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015512	GTT	2	6	35691	35696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015512	AGG	2	6	35768	35773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015512	GCA	2	6	36436	36441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015512	GCT	2	6	38342	38347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015512	TCC	2	6	38367	38372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015512	GGA	3	9	38395	38403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015512	CGG	2	6	38413	38418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015512	GGT	2	6	38420	38425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015512	AGC	2	6	38428	38433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015512	GCA	2	6	38458	38463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015512	CCA	2	6	38536	38541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015512	CTT	2	6	38588	38593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015512	CGG	2	6	38599	38604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015512	GCG	2	6	38638	38643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015512	TGA	2	6	39465	39470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015512	CCA	2	6	39596	39601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015512	TTG	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015512	GTC	2	6	39698	39703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015512	CTG	2	6	42233	42238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015512	CAG	2	6	42246	42251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015512	ATC	2	6	42273	42278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015512	CTG	2	6	42420	42425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015512	TCT	2	6	42478	42483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015512	AAT	2	6	42578	42583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015512	AAC	3	9	42585	42593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015512	GAG	2	6	42625	42630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015512	GGT	2	6	43406	43411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015512	AGG	2	6	43413	43418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015512	ACC	2	6	43419	43424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015512	GGT	2	6	43428	43433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015512	TGT	2	6	46054	46059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015512	TGG	2	6	46062	46067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015512	ATA	2	6	49354	49359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015512	ATT	2	6	49360	49365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015512	CGG	2	6	49387	49392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015512	TGT	2	6	49504	49509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015512	GCA	2	6	49520	49525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015512	CAC	2	6	49580	49585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015512	ACG	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015512	ACG	2	6	49600	49605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015512	ACG	2	6	49622	49627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015512	TCA	2	6	49753	49758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015512	TGC	2	6	49762	49767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015512	TTC	2	6	49787	49792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015512	ACA	2	6	49897	49902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015512	GCA	2	6	49994	49999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015512	TAT	2	6	50078	50083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015512	CAA	2	6	50205	50210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015512	AGT	2	6	50278	50283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015512	TGT	2	6	50289	50294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015512	CAA	2	6	51938	51943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015512	ACC	2	6	51949	51954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015512	TAA	2	6	53478	53483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015512	TTA	2	6	53508	53513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015512	CTA	2	6	53591	53596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015512	CGG	2	6	53975	53980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015512	GAT	2	6	53992	53997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015512	CAC	2	6	54000	54005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015512	CCG	2	6	54087	54092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015512	ACA	2	6	54457	54462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015512	CTA	2	6	54556	54561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015512	CTC	2	6	54652	54657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015512	GGC	2	6	54730	54735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015512	TAA	2	6	54813	54818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015512	CGC	2	6	54847	54852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015512	CAA	2	6	54883	54888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015512	GCA	2	6	56390	56395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015512	TGC	2	6	56424	56429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015512	ATT	2	6	57460	57465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015512	TGT	2	6	63690	63695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015512	ATC	2	6	63698	63703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015512	AAC	2	6	63897	63902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015512	GAC	2	6	65768	65773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015512	CAC	2	6	65847	65852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015512	CTT	2	6	65907	65912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015512	TTA	2	6	66169	66174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015512	CAT	2	6	66416	66421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015512	AAT	2	6	66433	66438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015512	TCA	2	6	66681	66686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015512	ATT	3	9	66820	66828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015512	CAC	2	6	66872	66877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015512	AAC	2	6	66883	66888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015512	CAA	2	6	67019	67024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015512	AAC	2	6	67138	67143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015512	CAA	2	6	67187	67192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015512	TAT	2	6	70631	70636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015512	AGT	2	6	71005	71010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015512	TAT	2	6	80253	80258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015512	ATT	2	6	80261	80266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015512	GCA	2	6	80295	80300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015512	TTC	2	6	80446	80451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015512	CAT	2	6	80452	80457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015512	CTT	2	6	80643	80648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015512	TTC	2	6	80904	80909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015512	CTT	2	6	80973	80978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015512	CAC	2	6	81087	81092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015512	TAT	2	6	81429	81434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015512	AAT	2	6	81528	81533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015512	CAA	2	6	81653	81658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015512	AGC	2	6	81708	81713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015512	TCG	2	6	83584	83589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015512	CTA	2	6	83652	83657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015512	GAT	2	6	83707	83712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015512	CAT	2	6	83760	83765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015512	AAT	2	6	83864	83869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015512	TGC	2	6	84887	84892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015512	GCC	2	6	84916	84921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015512	CCG	2	6	86090	86095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015512	GCC	2	6	86143	86148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015512	TCT	2	6	86246	86251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015512	CAC	2	6	87885	87890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015512	TTC	2	6	87915	87920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015512	TGT	2	6	88186	88191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015512	CGG	2	6	88219	88224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015512	GCA	3	9	88315	88323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015512	GAG	2	6	89819	89824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015512	GAG	2	6	89837	89842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015512	CAA	2	6	90450	90455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015512	GCT	2	6	91107	91112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015512	GCC	2	6	91172	91177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.