MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	GACAT	2	10	4091	4100	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015511	AATTC	2	10	5888	5897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015511	CGCCT	2	10	7889	7898	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_015511	CTTTT	2	10	8130	8139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015511	TCGCA	2	10	34272	34281	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015511	TACTG	2	10	35891	35900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015511	TTTAA	2	10	46986	46995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015511	ACAAA	2	10	47038	47047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015511	TCAAA	2	10	47724	47733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015511	AATAA	2	10	48105	48114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015511	ATTCC	2	10	52931	52940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015511	GTTTT	2	10	56391	56400	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015511	ATTTT	2	10	58310	58319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015511	CCCTA	2	10	58440	58449	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015511	GAATG	2	10	61956	61965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015511	CTTTT	2	10	62780	62789	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015511	CCGAC	2	10	70229	70238	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015511	GGGAG	2	10	70241	70250	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015511	TTTCA	2	10	74266	74275	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015511	TTGAA	2	10	118100	118109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015511	TGCGG	2	10	118643	118652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015511	TTGAG	2	10	118855	118864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015511	TTTGA	2	10	119033	119042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015511	CCCGT	2	10	119091	119100	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015511	CTTTT	2	10	121619	121628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015511	ATTTT	2	10	123797	123806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015511	GCTGC	2	10	128587	128596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015511	GTATT	2	10	131391	131400	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015511	GCTTT	2	10	153420	153429	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015511	TGTGC	2	10	153466	153475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015511	AGGGC	2	10	160185	160194	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015511	TTTTG	2	10	163820	163829	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.