MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	CGG	2	6	112	117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015511	CCT	2	6	135	140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015511	CTG	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015511	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015511	AAC	3	9	504	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015511	GAG	2	6	544	549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015511	AGG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015511	TGT	2	6	3869	3874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015511	TGG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015511	ATC	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015511	GCG	2	6	4030	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015511	GAT	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015511	CAC	2	6	4056	4061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015511	GTG	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015511	TGC	2	6	5782	5787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015511	TGT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015511	TAC	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015511	ACA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015511	CAC	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015511	ATC	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015511	TTA	2	6	8011	8016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015511	AAC	2	6	8066	8071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015511	TGG	2	6	8140	8145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015511	CAA	3	9	8510	8518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015511	TAA	2	6	8739	8744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015511	GCA	2	6	8838	8843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015511	TTG	2	6	9704	9709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015511	CAA	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015511	CAA	2	6	9767	9772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015511	AAG	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015511	TGG	2	6	11061	11066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015511	TGG	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015511	TTC	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015511	TAC	2	6	20111	20116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015511	GTT	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015511	ACT	2	6	25220	25225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015511	CTA	2	6	25238	25243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015511	TGA	2	6	25296	25301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015511	GTT	2	6	34099	34104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015511	AGC	2	6	34323	34328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015511	TAG	2	6	34373	34378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015511	GTT	2	6	35099	35104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015511	ATT	2	6	35119	35124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015511	ACA	2	6	35203	35208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015511	GAA	2	6	35953	35958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015511	GAG	2	6	35963	35968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015511	ACA	2	6	36198	36203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015511	AGG	2	6	36287	36292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015511	TGC	2	6	36321	36326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015511	TGG	2	6	36337	36342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015511	CTT	2	6	36356	36361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015511	TCA	2	6	39494	39499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015511	ATT	2	6	47014	47019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015511	CAA	2	6	47027	47032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015511	ATT	2	6	47109	47114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015511	TAA	2	6	47145	47150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015511	CCA	2	6	47177	47182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015511	AGC	2	6	47183	47188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015511	AGA	2	6	49484	49489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015511	CCT	3	9	51223	51231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015511	CAG	2	6	51286	51291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015511	ATT	2	6	52909	52914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015511	GCA	2	6	52957	52962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015511	TAT	2	6	56313	56318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015511	CCA	2	6	56455	56460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015511	ATT	2	6	56489	56494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015511	GCC	2	6	58562	58567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015511	TCT	2	6	58665	58670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015511	AGG	2	6	58690	58695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015511	CAC	2	6	60296	60301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015511	TTC	2	6	60326	60331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015511	GAG	2	6	62232	62237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015511	GAG	2	6	62250	62255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015511	CAA	2	6	62863	62868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015511	GCT	2	6	63520	63525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015511	GCC	2	6	63585	63590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015511	TGG	3	9	63867	63875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015511	TGC	2	6	68670	68675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015511	GCA	2	6	68722	68727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015511	TTG	2	6	68915	68920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015511	CAA	2	6	68922	68927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015511	AAC	2	6	68959	68964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015511	AGT	2	6	69346	69351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015511	AGC	2	6	69580	69585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015511	GAG	2	6	69674	69679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015511	CAC	2	6	70057	70062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015511	TGC	2	6	70163	70168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015511	AGC	3	9	70173	70181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015511	GTC	2	6	71091	71096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015511	GGC	2	6	71117	71122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015511	ATT	2	6	74000	74005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015511	CTG	2	6	74050	74055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015511	GCG	2	6	74076	74081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015511	CCA	2	6	74113	74118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015511	TTA	2	6	74210	74215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015511	ACC	2	6	74299	74304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015511	GTA	2	6	74357	74362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015511	AGT	2	6	74394	74399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015511	AGT	2	6	76593	76598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015511	TAA	2	6	76616	76621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015511	ACT	2	6	76664	76669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015511	AGT	2	6	76684	76689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015511	TTA	2	6	76693	76698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015511	CAT	2	6	76816	76821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015511	ATT	2	6	76845	76850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015511	TGT	2	6	77452	77457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015511	AGT	2	6	83166	83171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015511	TGG	2	6	83177	83182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015511	TGC	2	6	83183	83188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015511	AAT	2	6	85291	85296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015511	AAC	2	6	88241	88246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015511	GCA	2	6	88286	88291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015511	TTG	2	6	88882	88887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015511	ATG	2	6	88907	88912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015511	TTA	2	6	89861	89866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015511	TAG	2	6	92407	92412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015511	TGA	2	6	92438	92443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015511	ACT	2	6	96824	96829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015511	CAG	2	6	96858	96863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015511	ATA	2	6	98611	98616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015511	GCC	2	6	99245	99250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015511	AAG	2	6	110233	110238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015511	TGT	2	6	110246	110251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015511	TGC	2	6	110264	110269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015511	AAC	2	6	115617	115622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015511	TAT	2	6	115647	115652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015511	GTT	2	6	116589	116594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015511	AAC	2	6	117011	117016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015511	TGG	2	6	117824	117829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015511	GTT	4	12	117935	117946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015511	GGT	2	6	118021	118026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015511	GTT	2	6	118121	118126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015511	GTT	2	6	118243	118248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015511	GTT	2	6	118298	118303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015511	TGA	2	6	118381	118386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015511	TGG	2	6	118441	118446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015511	TAT	2	6	118495	118500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015511	TTA	2	6	118516	118521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015511	GGA	2	6	118538	118543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015511	ATG	2	6	118559	118564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_015511	TGG	2	6	118766	118771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015511	GTT	2	6	118880	118885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015511	GTT	2	6	118902	118907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015511	GAG	2	6	118947	118952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015511	GGA	2	6	128346	128351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015511	AGG	2	6	128488	128493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_015511	ACC	2	6	128606	128611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_015511	GAA	2	6	128737	128742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015511	TAA	3	9	128881	128889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.