MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 10066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	CAT	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015510	AAT	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015510	TGT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015510	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015510	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015510	ACC	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015510	CCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015510	ATG	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015510	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015510	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015510	CTC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015510	GCT	2	6	12835	12840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015510	AAT	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015510	TTA	2	6	18267	18272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015510	AAT	2	6	18317	18322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015510	AGT	2	6	20205	20210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015510	GCG	2	6	20380	20385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015510	CAT	2	6	20407	20412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015510	CAG	2	6	21448	21453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015510	TGC	2	6	21593	21598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015510	GAT	2	6	23177	23182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015510	GAT	2	6	23189	23194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015510	TGA	2	6	28715	28720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015510	AGT	2	6	28726	28731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015510	CTT	2	6	30497	30502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015510	CCG	2	6	30550	30555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015510	AAT	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015510	TTC	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015510	GCG	2	6	30854	30859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015510	TCA	2	6	33192	33197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015510	AGC	2	6	34664	34669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015510	ATC	2	6	34743	34748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015510	AGG	2	6	35196	35201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015510	ATT	2	6	35255	35260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015510	AAC	2	6	35280	35285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015510	TGA	2	6	36485	36490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015510	TGA	2	6	36516	36521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015510	TGA	2	6	36537	36542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015510	TGA	2	6	36557	36562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015510	TGG	2	6	37544	37549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015510	GTT	2	6	37660	37665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015510	ATC	2	6	38326	38331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015510	TTA	2	6	40131	40136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015510	TGC	2	6	40152	40157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015510	TGA	2	6	40220	40225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015510	GTT	2	6	40324	40329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015510	TGA	2	6	41212	41217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015510	GAA	2	6	41289	41294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015510	GAA	2	6	42965	42970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015510	GAA	2	6	43058	43063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015510	GGT	2	6	43089	43094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015510	TTC	2	6	43101	43106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015510	ATG	2	6	46153	46158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015510	ACG	2	6	46199	46204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015510	AAT	2	6	47288	47293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015510	ATT	2	6	48591	48596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015510	TAA	2	6	49741	49746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015510	GCA	2	6	51732	51737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015510	GTA	2	6	52804	52809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015510	AAT	2	6	53626	53631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015510	AGT	2	6	59130	59135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015510	GGT	2	6	59142	59147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015510	ATA	2	6	59177	59182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015510	CTA	2	6	59203	59208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015510	ATT	2	6	63354	63359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015510	TTA	2	6	63468	63473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015510	GCT	2	6	63516	63521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015510	GCC	2	6	66062	66067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015510	GCA	2	6	67147	67152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015510	TAA	2	6	67198	67203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015510	TAC	2	6	67420	67425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015510	TCA	2	6	68201	68206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015510	TTA	2	6	68981	68986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015510	CAA	2	6	69104	69109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015510	TAA	2	6	69118	69123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015510	TAC	2	6	70319	70324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015510	TTA	2	6	72076	72081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015510	ATT	2	6	72202	72207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015510	GAA	2	6	72246	72251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015510	GAA	2	6	72273	72278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015510	TAT	2	6	72324	72329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015510	GCA	2	6	72429	72434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015510	CAT	2	6	72473	72478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015510	CGA	2	6	72557	72562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015510	GTG	2	6	72568	72573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015510	GGA	2	6	72644	72649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015510	CGG	2	6	72659	72664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015510	TTA	2	6	72869	72874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015510	ATT	2	6	72894	72899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015510	CAA	2	6	73022	73027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015510	TGT	2	6	75106	75111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015510	CAG	2	6	76850	76855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015510	CCG	2	6	76866	76871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015510	AGA	2	6	78624	78629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015510	ATT	2	6	79294	79299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015510	ATT	2	6	79349	79354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015510	AAT	2	6	80885	80890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015510	GCT	2	6	80931	80936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015510	CAC	2	6	84020	84025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015510	AAG	2	6	86129	86134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015510	TAA	2	6	86160	86165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015510	TTC	2	6	87264	87269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015510	TAT	2	6	95589	95594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015510	GAA	2	6	98092	98097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015510	TAA	2	6	98104	98109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015510	TGC	2	6	98899	98904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015510	ATT	2	6	99778	99783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015510	AGG	2	6	101657	101662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015510	CCT	2	6	101741	101746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015510	GGT	2	6	103821	103826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015510	CAC	2	6	103842	103847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015510	ATG	2	6	107761	107766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015510	TAC	2	6	107782	107787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015510	GGA	2	6	107802	107807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015510	AAT	2	6	107986	107991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015510	GCT	2	6	110835	110840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015510	CAC	2	6	110848	110853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015510	GAC	2	6	110859	110864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015510	ACG	2	6	110868	110873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015510	CGT	2	6	110902	110907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015510	CGT	2	6	110935	110940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015510	GTC	2	6	110941	110946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015510	CGT	2	6	110951	110956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015510	GTC	2	6	110957	110962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015510	GTG	2	6	110963	110968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015510	GCT	2	6	112317	112322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015510	CCG	2	6	112432	112437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015510	ATT	2	6	112475	112480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015510	ATT	2	6	116555	116560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015510	TCA	2	6	118570	118575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015510	GAG	2	6	119835	119840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015510	CCT	2	6	119911	119916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015510	GAA	2	6	127311	127316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015510	TCA	2	6	127403	127408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015510	ATG	2	6	128530	128535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015510	ATT	2	6	128589	128594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015510	GTT	2	6	128596	128601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015510	ACT	2	6	130144	130149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015510	CGG	2	6	133092	133097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015510	GCA	2	6	133580	133585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015510	CCA	2	6	133659	133664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015510	AGG	2	6	133845	133850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015510	ATT	2	6	133852	133857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015510	GTT	2	6	168649	168654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_015510	ACG	2	6	248202	248207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_015510	ACG	2	6	248226	248231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_015510	TCG	2	6	248293	248298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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