MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 7198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014920	T	7	7	1131909	1131915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014920	ATC	2	6	1133620	1133625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_014920	GACGG	2	10	1133683	1133692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4004	NC_014920	CAA	2	6	1133763	1133768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_014920	GAT	2	6	1133847	1133852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014920	GTTG	2	8	1133853	1133860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014920	ATC	2	6	1133899	1133904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_014920	ATT	2	6	1133917	1133922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014920	TA	3	6	1134007	1134012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014920	T	6	6	1134016	1134021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014920	T	6	6	1134026	1134031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014920	TAG	3	9	1134043	1134051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014920	GCC	2	6	1134056	1134061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_014920	TAA	2	6	1134079	1134084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014920	T	7	7	1134091	1134097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014920	AAT	2	6	1134108	1134113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014920	ATT	2	6	1134165	1134170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014920	TTG	2	6	1134193	1134198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014920	TGT	2	6	1134206	1134211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014920	A	8	8	1137032	1137039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014920	GAA	2	6	1137049	1137054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014920	ATT	2	6	1137058	1137063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014920	TAAA	2	8	1137080	1137087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014920	CAA	3	9	1137140	1137148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_014920	AAT	2	6	1137154	1137159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014920	T	7	7	1137200	1137206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014920	ATA	3	9	1141956	1141964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014920	T	6	6	1142088	1142093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014920	TGAA	2	8	1142112	1142119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014920	AT	3	6	1142121	1142126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014920	TAA	3	9	1142146	1142154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014920	ACA	2	6	1142184	1142189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_014920	A	6	6	1146107	1146112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014920	TTA	2	6	1146150	1146155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014920	AAT	2	6	1146177	1146182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014920	TTTA	2	8	1146237	1146244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_014920	TTAAT	2	10	1146285	1146294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014920	ATT	2	6	1146312	1146317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_014920	T	6	6	1147048	1147053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014920	A	6	6	1147065	1147070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014920	GAA	2	6	1147104	1147109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014920	T	6	6	1148802	1148807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014920	AAC	3	9	1148828	1148836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_014920	CTT	2	6	1150075	1150080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_014920	AC	3	6	1150099	1150104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_014920	T	6	6	1150118	1150123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014920	T	6	6	1151975	1151980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014920	AG	3	6	1152010	1152015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014920	AAT	2	6	1152083	1152088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014920	GTG	2	6	1157047	1157052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014920	TAT	2	6	1157053	1157058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014920	AACAA	2	10	1157073	1157082	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_014920	A	6	6	1157092	1157097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014920	AACTT	2	10	1157117	1157126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_014920	ATG	2	6	1157133	1157138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014920	AT	3	6	1157499	1157504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014920	TAA	2	6	1157510	1157515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014920	GATTA	2	10	1157542	1157551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014920	TTAT	2	8	1157562	1157569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014920	TAA	2	6	1158514	1158519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014920	CTTTT	2	10	1158550	1158559	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4062	NC_014920	TAAT	2	8	1160435	1160442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014920	A	6	6	1160464	1160469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014920	T	6	6	1160519	1160524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014920	CAG	2	6	1160555	1160560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4067	NC_014920	TTG	2	6	1160654	1160659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014920	TAAG	2	8	1160697	1160704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014920	CTTTTA	2	12	1160726	1160737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4070	NC_014920	TTTG	2	8	1160744	1160751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014920	GAAA	2	8	1160769	1160776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014920	TTC	2	6	1160812	1160817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_014920	TTG	2	6	1160860	1160865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_014920	TCA	2	6	1160884	1160889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_014920	AT	3	6	1160934	1160939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014920	T	8	8	1160953	1160960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014920	AATGA	2	10	1161001	1161010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014920	AAT	2	6	1161029	1161034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014920	GAC	2	6	1161064	1161069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4083	NC_014920	TAAA	2	8	1161081	1161088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014920	GCA	2	6	1161102	1161107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4086	NC_014920	TAA	2	6	1162295	1162300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014920	TTA	2	6	1162386	1162391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014920	CTA	2	6	1162402	1162407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_014920	ATA	2	6	1162421	1162426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_014920	TCC	2	6	1167670	1167675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_014920	C	7	7	1167685	1167691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4093	NC_014920	TAT	2	6	1167705	1167710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014920	TTAT	2	8	1167718	1167725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014920	AAT	2	6	1167744	1167749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014920	GAT	2	6	1167825	1167830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014920	TGGC	2	8	1168013	1168020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_014920	TGA	2	6	1168091	1168096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014920	CAAA	2	8	1168136	1168143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_014920	GTG	2	6	1168164	1168169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014920	GTG	2	6	1168221	1168226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014920	TAA	2	6	1168235	1168240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014920	CGG	2	6	1168273	1168278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_014920	TGA	2	6	1168301	1168306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014920	ATC	2	6	1168317	1168322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_014920	CTT	2	6	1168346	1168351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_014920	AGATG	2	10	1168353	1168362	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014920	CTT	2	6	1168368	1168373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_014920	TGA	2	6	1168409	1168414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_014920	GT	3	6	1168519	1168524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014920	TGA	2	6	1168532	1168537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014920	CAA	2	6	1168594	1168599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_014920	AAG	2	6	1168629	1168634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014920	GTG	2	6	1168662	1168667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014920	AAAC	2	8	1168697	1168704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_014920	TTC	2	6	1168769	1168774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_014920	GGC	2	6	1168793	1168798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_014920	GAA	2	6	1168832	1168837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014920	GAT	2	6	1168946	1168951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014920	GTG	2	6	1168952	1168957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014920	TGA	2	6	1168966	1168971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014920	CAA	2	6	1169012	1169017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_014920	AAG	2	6	1169203	1169208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_014920	TTAA	2	8	1169226	1169233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014920	AC	3	6	1169285	1169290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_014920	A	6	6	1169293	1169298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014920	TTA	2	6	1169313	1169318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014920	TCTG	2	8	1169379	1169386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_014920	CACC	2	8	1169399	1169406	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4131	NC_014920	TGA	2	6	1169438	1169443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014920	GA	4	8	1169484	1169491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014920	TGA	2	6	1169492	1169497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_014920	TA	3	6	1201325	1201330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_014920	AATAC	2	10	1201331	1201340	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4269	NC_014920	T	7	7	1201348	1201354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_014920	T	6	6	1201394	1201399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_014920	AGA	2	6	1201400	1201405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_014920	T	6	6	1205072	1205077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_014920	A	6	6	1205078	1205083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_014920	ATT	2	6	1205092	1205097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4275	NC_014920	GCTC	2	8	1205148	1205155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4278	NC_014920	TGAA	2	8	1210642	1210649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_014920	C	6	6	1212793	1212798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4283	NC_014920	T	6	6	1213982	1213987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_014920	T	7	7	1214007	1214013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_014920	GTGCG	2	10	1215657	1215666	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4293	NC_014920	T	6	6	1215883	1215888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4299	NC_014920	T	6	6	1216045	1216050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4301	NC_014920	T	6	6	1216119	1216124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4302	NC_014920	A	6	6	1216151	1216156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_014920	T	6	6	1217311	1217316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4306	NC_014920	TC	4	8	1219790	1219797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4315	NC_014920	T	7	7	1221959	1221965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4341	NC_014920	T	6	6	1232588	1232593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4342	NC_014920	AGTA	2	8	1232645	1232652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4352	NC_014920	CAA	2	6	1240086	1240091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4371	NC_014920	ATTT	2	8	1240856	1240863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4380	NC_014920	ATG	2	6	1241182	1241187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_014920	AGCT	2	8	1241189	1241196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4382	NC_014920	TTG	2	6	1241198	1241203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_014920	GTG	2	6	1241335	1241340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_014920	ATC	2	6	1241554	1241559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_014920	ATA	2	6	1243485	1243490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_014920	A	6	6	1243497	1243502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_014920	ATAA	2	8	1245191	1245198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_014920	AT	3	6	1245205	1245210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_014920	AATC	2	8	1245249	1245256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4395	NC_014920	GCAAG	2	10	1245309	1245318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4396	NC_014920	GAC	2	6	1245328	1245333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_014920	AAT	2	6	1248724	1248729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_014920	A	6	6	1248753	1248758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_014920	TCA	2	6	1248787	1248792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_014920	A	6	6	1248803	1248808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_014920	ACT	2	6	1248871	1248876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4403	NC_014920	CAA	2	6	1248880	1248885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_014920	GAT	2	6	1248886	1248891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_014920	GAT	2	6	1248894	1248899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_014920	GAT	2	6	1248902	1248907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_014920	GAT	2	6	1248910	1248915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_014920	GAT	2	6	1248918	1248923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_014920	GAT	2	6	1248926	1248931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4411	NC_014920	GAT	2	6	1248942	1248947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_014920	GAT	2	6	1248950	1248955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4423	NC_014920	A	6	6	1249086	1249091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4428	NC_014920	AAT	2	6	1251843	1251848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4429	NC_014920	TTA	2	6	1252286	1252291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4432	NC_014920	TAA	2	6	1253709	1253714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_014920	TCA	2	6	1253846	1253851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4434	NC_014920	CAT	2	6	1253891	1253896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4437	NC_014920	TTG	2	6	1254261	1254266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4441	NC_014920	GCA	2	6	1254456	1254461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4442	NC_014920	TGCC	2	8	1254511	1254518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4443	NC_014920	ACGC	2	8	1254541	1254548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4444	NC_014920	GGCACC	2	12	1254575	1254586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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4452	NC_014920	TCA	2	6	1255063	1255068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4453	NC_014920	GGC	2	6	1255073	1255078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4463	NC_014920	A	8	8	1260120	1260127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4500	NC_014920	TGCT	2	8	1263505	1263512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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