MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	AAAC	2	8	58	65	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014810	CAAA	2	8	766	773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014810	CAGG	2	8	958	965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014810	TTGT	2	8	3465	3472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014810	TTAG	2	8	8997	9004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014810	AACT	2	8	15462	15469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014810	AAAG	2	8	15919	15926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014810	CAAT	2	8	15997	16004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014810	GGGT	2	8	16474	16481	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014810	ATCC	2	8	18329	18336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014810	TAGA	2	8	19436	19443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014810	CTTT	2	8	19881	19888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014810	CTTG	2	8	20640	20647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014810	GAAA	2	8	33823	33830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014810	GGAT	2	8	34422	34429	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014810	TGCG	2	8	35387	35394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014810	CTAT	2	8	35510	35517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014810	CATT	2	8	35747	35754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014810	TTGT	2	8	35853	35860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014810	CCCA	2	8	35942	35949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014810	ATAG	2	8	36737	36744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014810	TGGC	2	8	36883	36890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014810	AAGC	2	8	39245	39252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014810	GTGA	2	8	52519	52526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014810	TTTA	2	8	61073	61080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014810	TGTT	2	8	61264	61271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014810	TAGA	2	8	63401	63408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014810	GCCC	2	8	63735	63742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_014810	TTTA	2	8	70969	70976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014810	GGAA	2	8	74594	74601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014810	AGTT	2	8	96101	96108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014810	ATTT	2	8	100959	100966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014810	AGGA	2	8	107210	107217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014810	TTGT	2	8	117189	117196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014810	ACCC	2	8	117356	117363	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014810	AAAC	2	8	118187	118194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014810	TACT	2	8	120183	120190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014810	TGAG	2	8	121072	121079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014810	AGTT	2	8	121316	121323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014810	CTTT	2	8	121412	121419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014810	GGGA	2	8	122949	122956	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014810	AGCT	2	8	123245	123252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014810	CTTT	2	8	123604	123611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014810	GATT	2	8	123728	123735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014810	CACC	2	8	123740	123747	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014810	GTTT	2	8	123900	123907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014810	TCGC	2	8	124476	124483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014810	TTGT	2	8	124711	124718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014810	CAAG	2	8	131619	131626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014810	CTGC	2	8	131660	131667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014810	AAAG	2	8	135758	135765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014810	CATT	2	8	193352	193359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014810	AGCG	2	8	198304	198311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014810	GGAC	2	8	226546	226553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014810	TTGG	2	8	227108	227115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014810	TTGA	2	8	249841	249848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014810	TAAA	2	8	249871	249878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014810	ACCA	2	8	284958	284965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014810	TGCA	2	8	291431	291438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014810	TAGA	2	8	298272	298279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014810	CTTT	2	8	298715	298722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014810	TAAT	2	8	304585	304592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014810	ATTC	2	8	308606	308613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014810	TTTA	2	8	312337	312344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014810	TTTC	2	8	322418	322425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014810	TAGA	2	8	361707	361714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014810	TGAG	2	8	375336	375343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014810	ATTT	2	8	376394	376401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014810	ACAA	2	8	413255	413262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014810	GGAT	2	8	413495	413502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014810	GAGC	2	8	420559	420566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014810	GTGC	2	8	420574	420581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014810	GAAT	2	8	425686	425693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014810	ATAC	2	8	444235	444242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014810	AGCA	2	8	481671	481678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014810	AAGC	2	8	528043	528050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014810	TTGT	2	8	528255	528262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014810	GATA	2	8	528276	528283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014810	GAGC	2	8	552876	552883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014810	GGTG	2	8	561203	561210	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014810	ATTA	2	8	561511	561518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014810	CATG	2	8	566552	566559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014810	TCGC	2	8	568342	568349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014810	TTGT	2	8	568577	568584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014810	AAGC	2	8	581548	581555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014810	AGGT	2	8	583439	583446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014810	GATG	2	8	583593	583600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014810	CTGC	2	8	583940	583947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014810	AGGC	2	8	584351	584358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014810	GTTT	2	8	584387	584394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014810	CATC	2	8	585212	585219	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014810	AATA	2	8	586427	586434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014810	CTTT	2	8	603694	603701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014810	TTTA	2	8	621791	621798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014810	GATA	2	8	638927	638934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014810	GCTT	2	8	641012	641019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014810	AGGG	2	8	644864	644871	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014810	CACC	2	8	644934	644941	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014810	AAAC	3	12	660938	660949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014810	CAAG	2	8	661221	661228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014810	CTTG	2	8	663199	663206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014810	AGAA	2	8	683586	683593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014810	CCCA	2	8	697208	697215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_014810	TATC	2	8	697345	697352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014810	CAAA	2	8	697372	697379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014810	ATCA	2	8	698330	698337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014810	CTAC	2	8	699583	699590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014810	GCTT	2	8	699689	699696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014810	TAAG	2	8	699825	699832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014810	AGAA	2	8	699909	699916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014810	ATCC	2	8	700078	700085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014810	CCTC	2	8	700244	700251	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_014810	TGTT	2	8	700472	700479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014810	AATG	2	8	700757	700764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014810	TGCA	2	8	701096	701103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014810	CCCA	2	8	701521	701528	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014810	TATC	2	8	701658	701665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014810	CAAA	2	8	701685	701692	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014810	ATCA	2	8	702643	702650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014810	CAAA	2	8	703456	703463	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014810	AAGA	2	8	703698	703705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014810	TGGA	2	8	704720	704727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014810	CTAG	2	8	704827	704834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014810	TATT	2	8	705102	705109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014810	CGAT	2	8	705188	705195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014810	ATTT	2	8	748368	748375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014810	GCAC	2	8	762928	762935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014810	CATG	2	8	763250	763257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014810	TAAT	2	8	776856	776863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014810	GTTA	2	8	782949	782956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014810	AAAC	2	8	791766	791773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014810	AGCT	2	8	791831	791838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014810	CTAA	2	8	804632	804639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014810	AACT	2	8	830169	830176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014810	TAAA	2	8	830276	830283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014810	TAGC	2	8	830733	830740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014810	GCTC	2	8	830787	830794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014810	TTTA	2	8	836463	836470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014810	GATT	2	8	837025	837032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014810	AAAC	2	8	840298	840305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014810	CTTT	2	8	848991	848998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014810	TTGT	2	8	849079	849086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014810	TAAA	2	8	854141	854148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014810	AACT	2	8	885909	885916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014810	TAGC	2	8	897703	897710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014810	GAAA	2	8	923424	923431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014810	CTAA	2	8	940781	940788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014810	AATA	2	8	954669	954676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014810	ACGG	2	8	969757	969764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014810	GCAA	2	8	999692	999699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014810	AGGC	2	8	1017584	1017591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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293	NC_014810	GCAC	2	8	1647750	1647757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_014810	GGAT	2	8	1648026	1648033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014810	AAAT	2	8	1649151	1649158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014810	AAAG	2	8	1651154	1651161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
297	NC_014810	TTCA	2	8	1651254	1651261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
298	NC_014810	ATCT	2	8	1654149	1654156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
299	NC_014810	GAGG	2	8	1654215	1654222	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014810	GATG	2	8	1654322	1654329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014810	CTTT	2	8	1654446	1654453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
302	NC_014810	ATCA	2	8	1654666	1654673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
303	NC_014810	ACTC	2	8	1655094	1655101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
304	NC_014810	CCTT	2	8	1655106	1655113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
305	NC_014810	CGCA	2	8	1655415	1655422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
306	NC_014810	TGAT	2	8	1655842	1655849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
307	NC_014810	GCTT	3	12	1655941	1655952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
308	NC_014810	TTTA	2	8	1658944	1658951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_014810	GATG	2	8	1668389	1668396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_014810	AGGG	2	8	1671708	1671715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
311	NC_014810	GCCA	2	8	1671935	1671942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
312	NC_014810	CCCT	2	8	1672022	1672029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
313	NC_014810	AGCT	2	8	1672159	1672166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
314	NC_014810	GCAG	2	8	1672295	1672302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
315	NC_014810	GCAT	2	8	1672591	1672598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.