MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	AC	3	6	2308	2313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014735	TC	3	6	2526	2531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014735	CA	3	6	2600	2605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014735	AG	3	6	3916	3921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014735	AT	3	6	9519	9524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014735	AG	3	6	13970	13975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014735	TG	3	6	17015	17020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014735	TC	3	6	17635	17640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014735	CA	3	6	19509	19514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014735	TC	3	6	19677	19682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014735	AT	3	6	20035	20040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014735	GA	3	6	20330	20335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014735	GT	3	6	21056	21061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014735	TC	3	6	24108	24113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014735	AC	3	6	24148	24153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014735	GT	3	6	25549	25554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014735	TC	4	8	25633	25640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014735	AC	3	6	25716	25721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014735	GA	3	6	27722	27727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014735	CA	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014735	AG	3	6	31542	31547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014735	GA	3	6	31675	31680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014735	TC	3	6	31744	31749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014735	TA	3	6	45678	45683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014735	AT	3	6	46651	46656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014735	GA	3	6	46772	46777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014735	AG	3	6	50150	50155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014735	CA	3	6	51241	51246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014735	AT	3	6	51451	51456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014735	CG	4	8	51549	51556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014735	TC	3	6	53763	53768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014735	AG	3	6	55572	55577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014735	AG	3	6	60974	60979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014735	CA	3	6	61117	61122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014735	GA	3	6	61148	61153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014735	TA	3	6	61307	61312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014735	AG	3	6	61404	61409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014735	TA	3	6	65003	65008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014735	CA	3	6	66294	66299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014735	TA	3	6	66328	66333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014735	TA	3	6	68605	68610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014735	GA	3	6	77837	77842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014735	AG	3	6	77956	77961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014735	CA	3	6	77965	77970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014735	AT	3	6	77972	77977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014735	GA	3	6	87936	87941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014735	AT	3	6	88117	88122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014735	AG	3	6	88353	88358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014735	GA	3	6	88454	88459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014735	CA	3	6	88588	88593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014735	GA	3	6	88799	88804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014735	AT	3	6	88805	88810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014735	AT	3	6	88921	88926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014735	AC	3	6	89529	89534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014735	AG	3	6	95077	95082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014735	GC	3	6	96580	96585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014735	GT	3	6	96633	96638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014735	AT	3	6	107166	107171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014735	TA	3	6	107176	107181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014735	GC	3	6	107383	107388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014735	TG	3	6	109817	109822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014735	GA	4	8	111416	111423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014735	CG	3	6	112407	112412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014735	CG	3	6	112535	112540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014735	AC	3	6	112550	112555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014735	AG	3	6	112640	112645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014735	TG	3	6	112919	112924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014735	AT	3	6	118372	118377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014735	CA	3	6	118378	118383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014735	GA	3	6	118393	118398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014735	GC	3	6	118589	118594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014735	TG	3	6	119778	119783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014735	AT	3	6	128218	128223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014735	AG	3	6	128484	128489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014735	GA	3	6	129336	129341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014735	TA	3	6	129423	129428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014735	AG	3	6	129460	129465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014735	GC	3	6	133850	133855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014735	GA	3	6	133996	134001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014735	AG	3	6	145260	145265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014735	GT	3	6	146741	146746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014735	TA	3	6	146790	146795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014735	TC	3	6	149505	149510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014735	TA	3	6	149642	149647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014735	TA	3	6	149662	149667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014735	CT	3	6	153889	153894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014735	TC	3	6	154089	154094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014735	TA	4	8	156457	156464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014735	AG	3	6	158874	158879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014735	GA	3	6	158894	158899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014735	CT	3	6	158988	158993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014735	GA	3	6	159017	159022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014735	GA	3	6	159094	159099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014735	AT	3	6	159565	159570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014735	AT	3	6	159661	159666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014735	GT	3	6	159803	159808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014735	AT	3	6	159977	159982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014735	AG	3	6	162929	162934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014735	AC	3	6	162984	162989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014735	TG	3	6	163170	163175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014735	GT	3	6	164390	164395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014735	CA	3	6	164804	164809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014735	GT	3	6	165046	165051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014735	TC	4	8	165855	165862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014735	TA	3	6	165980	165985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014735	GT	3	6	184740	184745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014735	GT	3	6	185958	185963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014735	AC	7	14	199292	199305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014735	TC	3	6	200607	200612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014735	TG	3	6	202717	202722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014735	TC	3	6	207021	207026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014735	TA	3	6	212393	212398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014735	AT	3	6	217213	217218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014735	TC	3	6	220465	220470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014735	TC	3	6	228302	228307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014735	TG	3	6	235011	235016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014735	GA	3	6	237404	237409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014735	TC	3	6	237433	237438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014735	CT	3	6	240232	240237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014735	AC	3	6	244833	244838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014735	AT	3	6	249163	249168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014735	TC	3	6	254361	254366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014735	TC	3	6	258742	258747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014735	AT	3	6	261931	261936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014735	TC	3	6	261975	261980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014735	CG	3	6	265051	265056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014735	GT	3	6	269951	269956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014735	AT	3	6	273000	273005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014735	TC	3	6	273126	273131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014735	GC	3	6	275459	275464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014735	AT	3	6	275870	275875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014735	AT	3	6	278193	278198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014735	TC	3	6	281331	281336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014735	AG	3	6	287694	287699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014735	CG	3	6	291060	291065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014735	AC	3	6	292792	292797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014735	AC	3	6	292990	292995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014735	AG	3	6	293015	293020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014735	TG	3	6	293423	293428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014735	GT	3	6	293818	293823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014735	AC	3	6	293833	293838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014735	AC	3	6	301635	301640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014735	CA	3	6	304090	304095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014735	TC	3	6	304233	304238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014735	AT	3	6	304271	304276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014735	TA	3	6	307400	307405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014735	AG	3	6	307407	307412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014735	TC	3	6	307533	307538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014735	AG	3	6	308896	308901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014735	TC	3	6	309002	309007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014735	TA	3	6	309591	309596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014735	TA	3	6	319985	319990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014735	GT	3	6	320028	320033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014735	TG	3	6	320043	320048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014735	AT	3	6	320753	320758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.