MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	AG	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014731	TC	3	6	1135	1140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014731	GA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014731	CA	3	6	8020	8025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014731	AC	3	6	8652	8657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014731	GC	3	6	11648	11653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014731	GT	3	6	11723	11728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014731	GA	3	6	12132	12137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014731	AG	3	6	12194	12199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014731	GA	3	6	14644	14649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014731	TC	3	6	14925	14930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014731	CT	3	6	14974	14979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014731	GA	3	6	15407	15412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014731	TC	3	6	29174	29179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014731	AC	3	6	29438	29443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014731	GA	3	6	29604	29609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014731	AG	3	6	30210	30215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014731	TA	3	6	31638	31643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014731	CA	3	6	42625	42630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014731	AC	3	6	46263	46268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014731	TC	3	6	47373	47378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014731	GT	3	6	48354	48359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014731	AC	3	6	48614	48619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014731	TC	3	6	50149	50154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014731	GA	3	6	54893	54898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014731	AG	3	6	54959	54964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014731	AC	3	6	54972	54977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014731	TG	3	6	55034	55039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014731	AG	4	8	56703	56710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014731	TA	3	6	57661	57666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014731	AT	3	6	57803	57808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014731	GA	3	6	58028	58033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014731	AG	3	6	61531	61536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014731	CA	3	6	65964	65969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014731	TG	3	6	68241	68246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014731	GT	3	6	68262	68267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014731	AT	3	6	76994	76999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014731	AT	3	6	88186	88191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014731	TG	3	6	88505	88510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014731	CA	3	6	91276	91281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014731	CT	3	6	91680	91685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014731	GC	3	6	94098	94103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014731	TG	3	6	94317	94322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014731	GT	3	6	94428	94433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014731	CT	3	6	97029	97034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014731	GA	3	6	97050	97055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014731	CA	3	6	97833	97838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014731	TA	3	6	99854	99859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014731	AC	3	6	105648	105653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014731	CG	3	6	105818	105823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014731	GT	3	6	109248	109253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014731	GA	3	6	109905	109910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014731	GT	3	6	112877	112882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014731	GA	3	6	112908	112913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014731	GA	4	8	118975	118982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014731	AG	3	6	122451	122456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014731	GA	4	8	122579	122586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014731	CT	3	6	122599	122604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014731	GA	4	8	122882	122889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014731	AT	3	6	123057	123062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014731	AG	3	6	123472	123477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014731	TC	3	6	123528	123533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014731	CA	3	6	124137	124142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014731	CA	3	6	126307	126312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014731	AT	3	6	126321	126326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014731	GA	3	6	126707	126712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014731	GT	3	6	126782	126787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014731	AG	3	6	127992	127997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014731	CT	3	6	128838	128843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014731	TG	3	6	129006	129011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014731	TG	3	6	133222	133227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014731	GA	3	6	135118	135123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014731	TA	4	8	138371	138378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014731	GA	3	6	139227	139232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014731	CA	3	6	146069	146074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014731	CG	3	6	146245	146250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014731	CG	3	6	146257	146262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014731	AG	3	6	146381	146386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014731	TC	4	8	147196	147203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014731	TC	3	6	147645	147650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014731	AG	3	6	148694	148699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014731	GA	3	6	148979	148984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014731	AT	3	6	149191	149196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014731	GA	3	6	149231	149236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014731	TC	3	6	150147	150152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014731	GT	3	6	150475	150480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014731	TC	3	6	151646	151651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014731	AG	3	6	153104	153109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014731	GA	3	6	153132	153137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014731	GA	3	6	153174	153179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014731	AT	3	6	157229	157234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014731	CA	3	6	157982	157987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014731	AC	3	6	168519	168524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014731	GA	3	6	168976	168981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014731	CT	3	6	170700	170705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014731	CT	3	6	170715	170720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014731	TG	3	6	172391	172396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014731	AT	3	6	180551	180556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014731	TG	3	6	180570	180575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014731	CT	3	6	183731	183736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014731	TC	3	6	189787	189792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014731	GT	3	6	190745	190750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014731	CT	3	6	193838	193843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014731	GC	4	8	194041	194048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014731	TC	3	6	194126	194131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014731	AT	3	6	198473	198478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014731	GC	3	6	202973	202978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014731	TA	3	6	203328	203333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014731	CT	3	6	207825	207830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014731	AC	3	6	209662	209667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014731	TG	3	6	209685	209690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014731	AT	3	6	209832	209837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014731	GA	3	6	214813	214818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014731	TC	3	6	217595	217600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014731	CA	3	6	218347	218352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014731	CA	3	6	218385	218390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014731	AT	3	6	231712	231717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014731	TC	4	8	237044	237051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014731	AT	3	6	238985	238990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014731	GA	3	6	239112	239117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014731	TA	4	8	240258	240265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014731	AG	3	6	241596	241601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014731	CA	4	8	241614	241621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014731	TC	4	8	241982	241989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014731	TC	3	6	242305	242310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014731	GC	3	6	242703	242708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014731	AG	3	6	251660	251665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014731	CG	3	6	251781	251786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014731	CT	3	6	252011	252016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014731	CT	3	6	252034	252039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014731	CA	3	6	253511	253516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014731	TC	3	6	255307	255312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014731	GT	3	6	255800	255805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014731	TG	3	6	255884	255889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014731	TA	3	6	260344	260349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014731	AT	3	6	270837	270842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014731	CT	3	6	272263	272268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014731	GT	3	6	274736	274741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014731	AT	3	6	274842	274847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014731	CA	3	6	280580	280585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014731	TA	3	6	283540	283545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014731	AG	3	6	287180	287185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014731	AG	3	6	287302	287307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014731	CA	3	6	287389	287394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014731	AT	3	6	287525	287530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014731	AT	3	6	287574	287579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014731	TC	3	6	287929	287934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014731	GT	3	6	287985	287990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014731	AT	3	6	288424	288429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014731	AT	3	6	288431	288436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014731	AT	3	6	288438	288443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014731	CA	3	6	288507	288512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014731	GA	4	8	290196	290203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014731	AG	3	6	290404	290409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014731	CT	3	6	295074	295079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_014731	AT	3	6	305838	305843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.