MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	CACTTT	2	12	36749	36760	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014729	ACGCGC	2	12	40900	40911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014729	TGAAAG	2	12	91495	91506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014729	TTCGTG	2	12	102958	102969	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014729	CGCGAA	2	12	121864	121875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014729	GTGTTT	2	12	168049	168060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014729	CGTCGG	2	12	188711	188722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014729	CCGAAT	2	12	189919	189930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014729	ACAATA	9	54	190758	190811	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014729	GTTCGA	2	12	192774	192785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014729	GTTCGA	2	12	192798	192809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014729	GTTCGA	2	12	192822	192833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014729	ACCGTA	2	12	227104	227115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014729	CCGAAC	2	12	243699	243710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014729	CTCTCG	2	12	281943	281954	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014729	TCACAC	2	12	284391	284402	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014729	TGCGGC	2	12	302945	302956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014729	ACTCAA	2	12	304392	304403	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014729	AGGAAC	2	12	304786	304797	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014729	TGACGC	2	12	306996	307007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014729	TCAGTG	2	12	345381	345392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014729	CTTCGA	2	12	357265	357276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014729	GGACGC	2	12	385748	385759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014729	CCCGAC	2	12	389846	389857	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014729	ATGTCG	2	12	403663	403674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014729	TATTGA	2	12	411914	411925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014729	AAACGC	2	12	442812	442823	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014729	TGCGAT	2	12	443556	443567	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014729	TGCGAT	2	12	444043	444054	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014729	GCTGTC	2	12	482609	482620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014729	AACGAC	2	12	523707	523718	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014729	AGTGAA	2	12	572178	572189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014729	TATTCT	2	12	644886	644897	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014729	GTTCTC	2	12	689313	689324	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014729	AAATAT	2	12	824252	824263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014729	CGATCT	2	12	828214	828225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014729	CACTGT	2	12	903939	903950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014729	TCACAC	2	12	977822	977833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014729	TTCCGC	2	12	1002506	1002517	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014729	CAACGA	2	12	1050744	1050755	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014729	CCATAA	2	12	1069806	1069817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014729	GCGGAC	2	12	1092902	1092913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014729	TTTCAC	2	12	1164894	1164905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014729	GTCAAC	2	12	1230006	1230017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014729	GACGGT	2	12	1244865	1244876	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014729	AATTCT	2	12	1257795	1257806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014729	ACGATT	2	12	1279040	1279051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014729	ACTCGG	2	12	1282126	1282137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014729	CGAGAG	2	12	1293486	1293497	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014729	TACCCG	2	12	1318343	1318354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014729	GCTACC	2	12	1361681	1361692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014729	TGTTCC	2	12	1377494	1377505	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014729	TTGAGT	2	12	1377889	1377900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014729	GCCGCA	2	12	1379336	1379347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014729	CCGAGT	2	12	1403445	1403456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014729	CGAGGG	2	12	1414842	1414853	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014729	TCGGGT	2	12	1415234	1415245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014729	AAAGAC	2	12	1416225	1416236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014729	GTTGTG	2	12	1423151	1423162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014729	TTCGAG	2	12	1462201	1462212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014729	AGGGCG	2	12	1515897	1515908	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014729	TCTCTG	2	12	1543347	1543358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014729	TTCCTG	4	24	1543359	1543382	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014729	TGACGT	2	12	1570629	1570640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014729	CGTTGT	2	12	1570650	1570661	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014729	GAACGG	2	12	1709233	1709244	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014729	TCGCTG	2	12	1770380	1770391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014729	GTGTCG	2	12	1835956	1835967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014729	GGTGTA	2	12	1869965	1869976	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014729	ACCGCA	2	12	1917933	1917944	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014729	ACCGCA	2	12	1917954	1917965	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014729	AGTTAG	2	12	1927986	1927997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014729	CCGTTC	2	12	1928223	1928234	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014729	AATGTG	2	12	1946939	1946950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014729	ATATAA	2	12	1978631	1978642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014729	TTTCAT	2	12	1986659	1986670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014729	CGCGGA	2	12	2009091	2009102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014729	GGATTC	2	12	2087821	2087832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014729	CCGACC	2	12	2177633	2177644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014729	AACGCG	2	12	2200910	2200921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014729	GCGAAC	2	12	2214120	2214131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014729	GAAAAC	2	12	2317951	2317962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014729	CCGTGT	2	12	2343829	2343840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014729	ATTACG	2	12	2347090	2347101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014729	CGGACG	2	12	2387668	2387679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014729	GAGAAA	2	12	2390040	2390051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014729	GACGGG	2	12	2441033	2441044	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014729	TTTCGA	2	12	2458073	2458084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014729	AGTGAA	2	12	2505268	2505279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014729	AGTCGG	2	12	2513189	2513200	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014729	ACTCGC	2	12	2590778	2590789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014729	AGTGAA	2	12	2605810	2605821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014729	CGAATT	2	12	2626010	2626021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014729	ACGGCG	2	12	2630132	2630143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014729	TCACCG	2	12	2712518	2712529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014729	CCTGCA	2	12	2717123	2717134	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014729	AGACAT	2	12	2739534	2739545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014729	CCCTCC	2	12	2777574	2777585	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_014729	TTCACT	2	12	2786639	2786650	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014729	TAACTA	2	12	2791564	2791575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.