MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014729	ACCC	2	8	544867	544874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_014729	CGA	2	6	546623	546628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_014729	TGT	2	6	546858	546863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014729	CAA	2	6	546864	546869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014729	CGAC	2	8	546942	546949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_014729	CG	3	6	546964	546969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_014729	CCTG	2	8	546974	546981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_014729	C	6	6	547525	547530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1509	NC_014729	GAA	2	6	547556	547561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014729	CGT	2	6	552046	552051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014729	CTGT	2	8	552091	552098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_014729	CCG	2	6	553795	553800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_014729	TGG	2	6	553963	553968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014729	CCT	2	6	554005	554010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_014729	TGTT	2	8	554011	554018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014729	GTG	2	6	554074	554079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014729	CGA	2	6	554887	554892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_014729	CGC	2	6	554913	554918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_014729	AGCG	2	8	554925	554932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_014729	GT	3	6	554933	554938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014729	TTC	2	6	554956	554961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_014729	ACC	2	6	554987	554992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_014729	GGT	2	6	555727	555732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014729	TTG	2	6	556780	556785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014729	GACT	2	8	556847	556854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_014729	CGT	2	6	556877	556882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_014729	CT	3	6	556900	556905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_014729	CCG	2	6	556924	556929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_014729	CG	3	6	556928	556933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_014729	TCG	2	6	556953	556958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014729	CAC	2	6	558288	558293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_014729	TCG	2	6	560437	560442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014729	ACA	2	6	560512	560517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014729	CCGT	2	8	560525	560532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_014729	CAA	2	6	562446	562451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014729	TAC	2	6	562452	562457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_014729	GAC	2	6	564085	564090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_014729	GC	4	8	564124	564131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_014729	TGG	2	6	564426	564431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1541	NC_014729	CTT	2	6	564785	564790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_014729	TTGT	2	8	564812	564819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014729	AC	3	6	564843	564848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_014729	GTCG	2	8	564897	564904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_014729	TCT	2	6	564939	564944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014729	GACT	2	8	567009	567016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_014729	CTT	2	6	567038	567043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014729	CTTTA	2	10	567075	567084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_014729	GGA	2	6	567122	567127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014729	CGTTC	2	10	567635	567644	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1551	NC_014729	A	6	6	567658	567663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014729	TTC	2	6	567737	567742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1554	NC_014729	ACG	2	6	570088	570093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_014729	GC	3	6	570094	570099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_014729	T	6	6	570102	570107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014729	GCC	2	6	570109	570114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_014729	TTGA	2	8	571413	571420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014729	GAC	2	6	571450	571455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_014729	TCG	2	6	572094	572099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_014729	GCC	2	6	572117	572122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_014729	AGTGAA	2	12	572178	572189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014729	CG	3	6	572266	572271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_014729	GA	3	6	572306	572311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014729	TGA	2	6	572538	572543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1567	NC_014729	C	6	6	573674	573679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1568	NC_014729	CGT	2	6	573687	573692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014729	GACG	2	8	573789	573796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_014729	TC	3	6	573854	573859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_014729	AT	3	6	573928	573933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014729	ACG	2	6	573942	573947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_014729	TG	3	6	574728	574733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_014729	CG	3	6	574767	574772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_014729	GCACC	2	10	574794	574803	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1577	NC_014729	TGG	2	6	576202	576207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014729	TATT	2	8	577243	577250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_014729	CGT	2	6	578877	578882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014729	GT	3	6	578945	578950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014729	AT	3	6	578951	578956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014729	TTGG	2	8	579051	579058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014729	ACG	2	6	579060	579065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_014729	GAC	2	6	580260	580265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_014729	GAG	2	6	583512	583517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_014729	CGG	2	6	583599	583604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1598	NC_014729	GCG	2	6	584870	584875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_014729	CG	3	6	584899	584904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_014729	GCG	2	6	584910	584915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_014729	TC	3	6	585061	585066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_014729	CAGT	2	8	585925	585932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_014729	CGG	2	6	585966	585971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_014729	TG	3	6	587006	587011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014729	TCT	2	6	587118	587123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1609	NC_014729	CCTG	2	8	589384	589391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_014729	CAAA	2	8	589443	589450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1612	NC_014729	GTA	2	6	590827	590832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014729	CTG	2	6	590872	590877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1615	NC_014729	CTG	2	6	590920	590925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_014729	TG	3	6	592739	592744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014729	GC	3	6	594781	594786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_014729	TCG	2	6	596079	596084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_014729	AACG	2	8	597484	597491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_014729	CGC	2	6	597528	597533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1624	NC_014729	TCG	2	6	597559	597564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014729	GTG	2	6	597565	597570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_014729	ACGCG	2	10	597595	597604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1628	NC_014729	TGG	2	6	597665	597670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014729	TG	3	6	597729	597734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014729	A	6	6	598378	598383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014729	AAT	2	6	600426	600431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014729	TA	3	6	600516	600521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014729	GCGA	2	8	601547	601554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_014729	CGA	2	6	601556	601561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_014729	CCCGA	2	10	601582	601591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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