MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014654	TTA	2	6	682159	682164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014654	AT	3	6	683011	683016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014654	TAA	2	6	683017	683022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014654	ATA	3	9	683049	683057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014654	ATA	2	6	683076	683081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014654	ATG	2	6	683111	683116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014654	A	8	8	684176	684183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014654	TAA	2	6	684185	684190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014654	A	6	6	684189	684194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014654	TAC	2	6	684230	684235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_014654	AGG	2	6	684252	684257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014654	ATT	2	6	685318	685323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014654	TAAAAA	2	12	685373	685384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014654	AAAG	2	8	685404	685411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014654	GAA	2	6	685425	685430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014654	ATG	2	6	685435	685440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014654	A	6	6	685456	685461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014654	AGA	2	6	685466	685471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014654	T	6	6	686464	686469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014654	ATTA	2	8	687583	687590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_014654	ATT	2	6	687612	687617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014654	TA	3	6	687986	687991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014654	AAAG	2	8	688023	688030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014654	GAA	2	6	688079	688084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014654	A	7	7	690440	690446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014654	AAT	2	6	690476	690481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014654	TAT	2	6	690511	690516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014654	CTC	2	6	690568	690573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_014654	CAT	3	9	690639	690647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_014654	TTA	2	6	690663	690668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014654	ATTT	2	8	690692	690699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014654	TAT	2	6	690701	690706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014654	T	7	7	690776	690782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014654	TTA	2	6	690846	690851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014654	T	6	6	690868	690873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014654	T	7	7	690917	690923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014654	GAAG	2	8	691030	691037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014654	AACAA	2	10	691108	691117	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_014654	CAG	2	6	691152	691157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_014654	TGA	2	6	691215	691220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014654	GCA	2	6	691271	691276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014654	TAG	2	6	691284	691289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014654	TGG	2	6	691292	691297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014654	AT	3	6	691298	691303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014654	AGG	2	6	691328	691333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014654	AAC	2	6	691347	691352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_014654	GCT	2	6	691393	691398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_014654	GA	3	6	691431	691436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014654	GCG	2	6	691452	691457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014654	GAAA	2	8	691467	691474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014654	AAG	2	6	691680	691685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014654	TGG	3	9	691704	691712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014654	ACT	2	6	691719	691724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014654	ATAG	2	8	691741	691748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014654	ACA	2	6	691770	691775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014654	GAA	2	6	691832	691837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014654	TAAA	2	8	691853	691860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_014654	AT	3	6	691869	691874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014654	GGT	2	6	691893	691898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014654	TAG	2	6	691955	691960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014654	TAA	2	6	691994	691999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014654	TGAT	2	8	692024	692031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014654	GAT	2	6	692047	692052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014654	GGC	2	6	692068	692073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014654	GCT	2	6	692085	692090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014654	TGA	2	6	692160	692165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014654	AG	3	6	692201	692206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014654	TTG	2	6	692228	692233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014654	GAA	2	6	692291	692296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014654	TAG	2	6	692319	692324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014654	CTA	2	6	692469	692474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_014654	AAAG	2	8	692492	692499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014654	GAA	2	6	692528	692533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014654	GAA	2	6	692559	692564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014654	AAG	2	6	692606	692611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014654	ACCA	2	8	692689	692696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_014654	TTA	2	6	692698	692703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014654	GGT	2	6	692791	692796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014654	ATTA	2	8	692816	692823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014654	TCC	2	6	692827	692832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_014654	ACA	2	6	692847	692852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014654	AAT	2	6	692895	692900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014654	ATTAT	2	10	692952	692961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014654	A	6	6	692964	692969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014654	ATA	2	6	692973	692978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014654	ATA	2	6	693057	693062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_014654	ATT	2	6	693080	693085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_014654	AGT	2	6	693101	693106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014654	GATT	2	8	693290	693297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_014654	T	6	6	693296	693301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014654	A	7	7	693347	693353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_014654	TAT	2	6	693366	693371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014654	A	6	6	693376	693381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014654	ATAA	2	8	694400	694407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_014654	TTG	2	6	694437	694442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014654	TTC	2	6	694450	694455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014654	TAC	2	6	694460	694465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_014654	AG	3	6	694487	694492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014654	AGC	2	6	694506	694511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_014654	AAT	2	6	694518	694523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_014654	TGA	2	6	694579	694584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014654	AGA	2	6	694666	694671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014654	ATAA	2	8	694685	694692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014654	A	6	6	694694	694699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014654	AT	3	6	694725	694730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014654	A	6	6	694751	694756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014654	GAA	2	6	694784	694789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014654	GCT	2	6	694958	694963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014654	TAAA	2	8	694965	694972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014654	ATT	2	6	695041	695046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014654	TCATT	2	10	695126	695135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_014654	AGT	2	6	695174	695179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014654	A	6	6	695195	695200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014654	ATT	2	6	695217	695222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014654	AAC	2	6	695225	695230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_014654	A	6	6	695295	695300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014654	A	6	6	695330	695335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_014654	GAGC	2	8	695351	695358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_014654	AACA	2	8	695361	695368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3120	NC_014654	AAT	2	6	696201	696206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014654	ATT	2	6	696233	696238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014654	TGG	2	6	696246	696251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014654	T	7	7	696254	696260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014654	TAA	2	6	696295	696300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014654	AATA	2	8	696334	696341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014654	AAT	2	6	696345	696350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014654	GGT	2	6	696362	696367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014654	TA	3	6	697450	697455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014654	GTA	2	6	697566	697571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014654	TGA	2	6	697574	697579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014654	ATAG	2	8	697671	697678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014654	AGA	2	6	697728	697733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_014654	AGA	2	6	697742	697747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014654	ATTA	2	8	697821	697828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014654	ACA	2	6	697864	697869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_014654	GCA	2	6	697919	697924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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