MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014654	TAT	2	6	274577	274582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014654	TTTC	2	8	274587	274594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_014654	AG	3	6	274614	274619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014654	TTA	2	6	274634	274639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014654	AT	3	6	274677	274682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014654	AGA	2	6	274818	274823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014654	ATT	2	6	274824	274829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014654	T	6	6	274835	274840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014654	T	7	7	274892	274898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014654	ATT	2	6	274998	275003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014654	T	6	6	275002	275007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014654	CAA	2	6	275015	275020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_014654	AT	3	6	275065	275070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014654	TTTC	2	8	275080	275087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_014654	ATG	2	6	275096	275101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014654	TGA	2	6	275107	275112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014654	TAGAT	2	10	275116	275125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014654	GCT	2	6	275218	275223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014654	AGAA	2	8	275283	275290	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014654	TA	3	6	275371	275376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014654	A	6	6	276714	276719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014654	GAGC	2	8	276735	276742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_014654	AACA	2	8	276745	276752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_014654	ATC	2	6	276917	276922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014654	ACT	2	6	276960	276965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_014654	TCTT	2	8	276979	276986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_014654	TTC	2	6	276995	277000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_014654	TCT	2	6	277060	277065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014654	ACTT	2	8	277067	277074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_014654	T	7	7	277073	277079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014654	A	6	6	277121	277126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014654	TGC	2	6	277169	277174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014654	TTTTG	2	10	277237	277246	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014654	CCT	2	6	277267	277272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_014654	T	6	6	277276	277281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014654	TAT	2	6	277310	277315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014654	T	7	7	277328	277334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014654	GTA	2	6	277400	277405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014654	TAAA	2	8	277421	277428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014654	TTA	3	9	277584	277592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014654	AT	3	6	277603	277608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014654	AAG	2	6	277622	277627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014654	T	7	7	278664	278670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014654	CTA	2	6	279428	279433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014654	AAGG	2	8	279442	279449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014654	T	7	7	279527	279533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014654	AAT	2	6	279565	279570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014654	GAT	2	6	279577	279582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014654	TGA	2	6	279606	279611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014654	TAT	2	6	279621	279626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_014654	AGCTGA	2	12	279660	279671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1552	NC_014654	A	7	7	279671	279677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014654	GAG	2	6	279730	279735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014654	A	6	6	279757	279762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014654	A	6	6	279850	279855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014654	ACC	2	6	279863	279868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_014654	ATG	2	6	279950	279955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014654	TCTT	2	8	280125	280132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_014654	TTG	2	6	280267	280272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014654	TGA	2	6	280277	280282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014654	AT	3	6	280286	280291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014654	TAAAA	2	10	280292	280301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014654	AAT	2	6	280412	280417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014654	GCT	2	6	280476	280481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014654	TGC	2	6	280487	280492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014654	AAC	2	6	280525	280530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_014654	GAT	2	6	280551	280556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014654	CAT	2	6	280589	280594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014654	ATT	2	6	280699	280704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014654	ACC	2	6	280733	280738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_014654	TTTA	2	8	280892	280899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014654	A	6	6	281629	281634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014654	AAT	2	6	281706	281711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014654	TTAT	2	8	281783	281790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014654	ATA	2	6	281794	281799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014654	A	6	6	281845	281850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014654	TGA	2	6	281855	281860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014654	TGAC	2	8	281899	281906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_014654	A	7	7	281908	281914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014654	A	6	6	281942	281947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014654	TAA	2	6	281970	281975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014654	T	6	6	284796	284801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014654	GATA	2	8	284844	284851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014654	AATT	2	8	284882	284889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014654	AATT	2	8	284904	284911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014654	T	6	6	284943	284948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014654	ATA	2	6	284949	284954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014654	AGA	2	6	284960	284965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014654	T	7	7	284968	284974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014654	ATA	2	6	284979	284984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014654	AAT	2	6	284988	284993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014654	ATT	2	6	285000	285005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014654	AGG	2	6	285012	285017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014654	AGAT	2	8	286171	286178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014654	A	6	6	286188	286193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014654	ATA	2	6	286500	286505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014654	ATT	2	6	286515	286520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014654	CCA	2	6	286560	286565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_014654	TC	3	6	286793	286798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_014654	ATTA	2	8	286876	286883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014654	TTC	2	6	286920	286925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_014654	TATT	2	8	286947	286954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014654	T	6	6	286953	286958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014654	TCA	2	6	286994	286999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_014654	CAA	2	6	287004	287009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_014654	TTTAG	2	10	287021	287030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014654	AATT	2	8	287041	287048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014654	T	7	7	287047	287053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014654	TGC	2	6	287091	287096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014654	T	6	6	287108	287113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014654	TCT	2	6	287206	287211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014654	TTA	2	6	287303	287308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014654	ATA	2	6	287345	287350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014654	TTA	2	6	287426	287431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014654	GAT	2	6	287458	287463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014654	TAG	2	6	287464	287469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014654	CTTTAT	2	12	287497	287508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1618	NC_014654	CTG	2	6	287509	287514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_014654	GATAAG	2	12	287604	287615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014654	ATT	2	6	287658	287663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014654	GGT	2	6	287697	287702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014654	GA	3	6	287747	287752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014654	A	7	7	287756	287762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014654	CTG	2	6	287795	287800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014654	TAT	2	6	287884	287889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014654	TATAT	2	10	287909	287918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014654	ATTA	2	8	287945	287952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014654	CTA	2	6	288023	288028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_014654	CATA	2	8	288038	288045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_014654	A	6	6	288062	288067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014654	GGA	2	6	288069	288074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014654	AGTT	2	8	288130	288137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014654	AT	3	6	288139	288144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014654	A	6	6	288195	288200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014654	TAT	2	6	288201	288206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014654	TGG	2	6	288251	288256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_014654	CTA	2	6	288259	288264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_014654	AATA	2	8	288297	288304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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