MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014654	AAAACA	2	12	2552293	2552304	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10002	NC_014654	TAT	2	6	2552318	2552323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014654	AAT	2	6	2552331	2552336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014654	ATT	2	6	2552365	2552370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_014654	ATA	2	6	2552379	2552384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014654	TA	3	6	2552383	2552388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014654	TTAATA	2	12	2552412	2552423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014654	ATT	2	6	2552440	2552445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014654	GCCT	2	8	2552493	2552500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_014654	TGA	2	6	2552519	2552524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_014654	TAAT	2	8	2552539	2552546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_014654	T	6	6	2552554	2552559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_014654	ATA	2	6	2552572	2552577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_014654	ATA	2	6	2552580	2552585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_014654	GGA	2	6	2552598	2552603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_014654	TTA	2	6	2552887	2552892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014654	CT	3	6	2553759	2553764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_014654	GTA	2	6	2553772	2553777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_014654	TAC	2	6	2553817	2553822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_014654	ATA	2	6	2553843	2553848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014654	CAG	2	6	2553915	2553920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_014654	GACT	2	8	2553938	2553945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10023	NC_014654	CTT	2	6	2553968	2553973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_014654	CTA	2	6	2554055	2554060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_014654	T	8	8	2554086	2554093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_014654	AAT	2	6	2554182	2554187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_014654	TAT	2	6	2554236	2554241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_014654	ATTAA	2	10	2554253	2554262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_014654	TCC	2	6	2554282	2554287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_014654	TAA	2	6	2554296	2554301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_014654	TA	3	6	2554345	2554350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_014654	AT	3	6	2554367	2554372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_014654	CTT	2	6	2554634	2554639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014654	ATT	2	6	2554655	2554660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_014654	TAA	2	6	2554714	2554719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_014654	AAG	2	6	2554767	2554772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_014654	CTA	2	6	2554821	2554826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_014654	A	7	7	2554863	2554869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_014654	A	7	7	2554886	2554892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_014654	A	6	6	2554894	2554899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_014654	GC	3	6	2555004	2555009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_014654	AGTC	2	8	2555045	2555052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_014654	ACA	2	6	2555088	2555093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_014654	ATT	2	6	2555097	2555102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014654	T	7	7	2555112	2555118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_014654	GAG	2	6	2555147	2555152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_014654	TAA	2	6	2555678	2555683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_014654	TAC	2	6	2556589	2556594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_014654	TTC	2	6	2557109	2557114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_014654	ATTTA	2	10	2557136	2557145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_014654	A	6	6	2557145	2557150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_014654	ATT	2	6	2557157	2557162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014654	CTT	2	6	2557191	2557196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_014654	T	6	6	2557923	2557928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014654	AGAA	2	8	2557953	2557960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_014654	CTAT	2	8	2557990	2557997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_014654	TAT	2	6	2561567	2561572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_014654	TTATTT	2	12	2561584	2561595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_014654	TAA	2	6	2561646	2561651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_014654	ATT	2	6	2561673	2561678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_014654	AAT	2	6	2561681	2561686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014654	TAT	2	6	2562359	2562364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_014654	TATT	2	8	2562378	2562385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014654	TA	3	6	2562450	2562455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_014654	AT	3	6	2562465	2562470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_014654	AGG	2	6	2563615	2563620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_014654	A	6	6	2564128	2564133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_014654	TTAA	2	8	2564152	2564159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014654	TAT	2	6	2565370	2565375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014654	ATT	2	6	2565377	2565382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_014654	CTATT	2	10	2565392	2565401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10072	NC_014654	A	7	7	2565427	2565433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014654	AAAG	2	8	2565446	2565453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014654	TTAT	2	8	2565469	2565476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_014654	A	7	7	2566137	2566143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_014654	CTC	2	6	2566144	2566149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10077	NC_014654	AAAT	2	8	2566171	2566178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_014654	ATA	2	6	2566222	2566227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_014654	A	6	6	2566241	2566246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_014654	A	8	8	2566261	2566268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014654	ATA	2	6	2566301	2566306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_014654	TA	3	6	2566310	2566315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014654	TAAT	2	8	2566323	2566330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014654	A	7	7	2567663	2567669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014654	AGC	2	6	2567672	2567677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_014654	GCT	2	6	2567690	2567695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_014654	TCT	2	6	2567705	2567710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_014654	ATT	2	6	2567735	2567740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_014654	CCT	2	6	2568388	2568393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_014654	CCT	2	6	2568782	2568787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_014654	ACT	2	6	2568800	2568805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_014654	TA	4	8	2568806	2568813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_014654	CTT	2	6	2568838	2568843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_014654	TAT	2	6	2568849	2568854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_014654	AT	4	8	2568862	2568869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014654	AT	3	6	2568881	2568886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014654	TAT	2	6	2568907	2568912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014654	TAAAG	3	15	2568915	2568929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_014654	AGG	2	6	2568956	2568961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014654	C	6	6	2569931	2569936	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10101	NC_014654	T	7	7	2569951	2569957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_014654	AAT	2	6	2569994	2569999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014654	AAAT	2	8	2570006	2570013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_014654	TAA	2	6	2570093	2570098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_014654	TTAA	2	8	2570108	2570115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_014654	ATT	2	6	2570795	2570800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_014654	TAA	2	6	2570802	2570807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_014654	TAT	2	6	2570830	2570835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_014654	A	7	7	2570847	2570853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_014654	TCC	2	6	2573272	2573277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_014654	A	6	6	2574568	2574573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_014654	TCC	2	6	2574582	2574587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_014654	ACT	2	6	2574624	2574629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_014654	T	6	6	2574648	2574653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_014654	CTT	2	6	2576034	2576039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_014654	A	10	10	2576060	2576069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_014654	TTAAA	2	10	2576118	2576127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_014654	AAT	2	6	2576128	2576133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_014654	AGT	2	6	2576168	2576173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_014654	ATT	2	6	2576203	2576208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_014654	A	7	7	2576232	2576238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014654	ATA	2	6	2576241	2576246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014654	ATA	2	6	2576253	2576258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_014654	CAAA	2	8	2580050	2580057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_014654	T	6	6	2580102	2580107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_014654	AATTAA	2	12	2580417	2580428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014654	TA	3	6	2580465	2580470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_014654	TAT	2	6	2580474	2580479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_014654	TAG	2	6	2580507	2580512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_014654	CTT	2	6	2580526	2580531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_014654	AGG	2	6	2580554	2580559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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