MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GA	7	14	7364	7377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014560	CA	3	6	16773	16778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014560	TA	3	6	27510	27515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014560	AG	3	6	40643	40648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014560	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014560	TC	3	6	44507	44512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014560	AG	3	6	44997	45002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014560	AC	3	6	52246	52251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014560	TC	3	6	62173	62178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014560	GC	3	6	65011	65016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014560	CT	3	6	65116	65121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014560	AG	4	8	65545	65552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014560	GC	3	6	65995	66000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014560	AG	3	6	66546	66551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014560	TC	3	6	66751	66756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014560	GT	3	6	66838	66843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014560	GA	3	6	68016	68021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014560	TC	3	6	68048	68053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014560	AG	3	6	68782	68787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014560	GA	3	6	69178	69183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014560	AC	3	6	69205	69210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014560	AG	3	6	70065	70070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014560	TA	3	6	70279	70284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014560	GC	3	6	70340	70345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014560	AG	3	6	70918	70923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014560	GT	3	6	70996	71001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014560	AG	3	6	71400	71405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014560	AG	3	6	72466	72471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014560	AG	3	6	72478	72483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014560	AG	3	6	72490	72495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014560	AG	3	6	76013	76018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014560	TA	3	6	81145	81150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014560	TA	3	6	82388	82393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014560	TC	3	6	84335	84340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014560	TC	3	6	84361	84366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014560	AG	3	6	88905	88910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014560	AG	3	6	97330	97335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014560	CT	3	6	99955	99960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014560	TA	3	6	100852	100857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014560	AG	3	6	102008	102013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014560	GA	3	6	111049	111054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014560	CT	3	6	116380	116385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014560	TG	3	6	138783	138788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014560	AG	3	6	138789	138794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014560	TC	3	6	166851	166856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014560	CA	3	6	166992	166997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014560	TC	3	6	169026	169031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014560	TA	3	6	178222	178227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014560	AC	3	6	178629	178634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014560	GT	3	6	181164	181169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014560	GA	4	8	181337	181344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014560	AT	3	6	189302	189307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014560	GA	3	6	189308	189313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014560	AG	3	6	194539	194544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014560	CT	3	6	194557	194562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014560	TA	3	6	209861	209866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014560	AT	3	6	210706	210711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014560	TA	3	6	212677	212682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014560	CT	3	6	212803	212808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014560	AT	3	6	220781	220786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014560	TG	3	6	233164	233169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014560	CT	3	6	235859	235864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014560	TC	3	6	236012	236017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014560	AG	3	6	239403	239408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014560	GT	3	6	240797	240802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014560	TA	3	6	271689	271694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014560	AG	3	6	309016	309021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014560	GA	3	6	331441	331446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014560	TG	3	6	334896	334901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014560	AG	3	6	341305	341310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014560	GT	3	6	349594	349599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014560	GA	3	6	349829	349834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014560	TA	3	6	382472	382477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014560	AT	3	6	384422	384427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014560	AG	3	6	386104	386109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014560	GA	4	8	395647	395654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014560	TG	3	6	414015	414020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014560	GT	3	6	420335	420340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014560	AG	3	6	426719	426724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014560	AT	3	6	436048	436053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014560	TA	3	6	448906	448911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014560	GC	3	6	448998	449003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014560	AT	4	8	463736	463743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014560	TA	3	6	477265	477270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014560	AT	3	6	477332	477337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014560	AG	3	6	498020	498025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014560	TA	3	6	505386	505391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014560	AG	4	8	507168	507175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014560	AT	3	6	516600	516605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014560	TC	3	6	517234	517239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014560	GT	3	6	517545	517550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014560	CA	3	6	518490	518495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014560	CT	3	6	519341	519346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014560	TC	3	6	519365	519370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014560	TC	4	8	520968	520975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014560	TC	3	6	521246	521251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014560	AT	3	6	530800	530805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014560	GT	3	6	534850	534855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014560	TG	3	6	537214	537219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014560	AG	3	6	541046	541051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014560	AG	3	6	546540	546545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014560	AG	3	6	548098	548103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014560	AG	3	6	548149	548154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014560	AG	3	6	548185	548190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014560	GT	3	6	549563	549568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014560	TG	3	6	553355	553360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014560	TC	3	6	554135	554140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014560	GA	3	6	555029	555034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014560	CA	3	6	560328	560333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014560	AT	3	6	560706	560711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014560	GA	4	8	560832	560839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014560	TA	3	6	565017	565022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014560	AT	3	6	569526	569531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014560	TA	3	6	570462	570467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014560	TA	3	6	577700	577705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014560	TC	3	6	594474	594479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014560	AT	3	6	596233	596238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014560	AG	3	6	623705	623710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014560	CT	3	6	652370	652375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014560	CT	6	12	652382	652393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014560	TA	3	6	668371	668376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014560	AT	3	6	668377	668382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014560	CT	3	6	669632	669637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014560	TA	3	6	683880	683885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014560	TA	3	6	708323	708328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014560	TA	3	6	709210	709215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014560	AT	3	6	709322	709327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014560	AC	3	6	719835	719840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014560	AG	3	6	725814	725819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014560	TC	3	6	725881	725886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014560	AG	3	6	726118	726123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014560	CT	3	6	731923	731928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014560	TA	3	6	732009	732014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014560	TC	8	16	743683	743698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014560	CT	3	6	757135	757140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014560	AT	4	8	757370	757377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014560	GC	3	6	757537	757542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014560	GA	3	6	761535	761540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014560	GT	4	8	768904	768911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014560	GA	3	6	804580	804585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014560	TC	3	6	809490	809495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014560	TC	3	6	819534	819539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014560	CT	3	6	836267	836272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014560	CA	3	6	836281	836286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014560	AT	3	6	847501	847506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014560	CT	3	6	871974	871979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014560	CT	3	6	872437	872442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014560	AC	3	6	893073	893078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014560	CT	3	6	898979	898984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014560	GA	3	6	905980	905985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014560	AT	3	6	914071	914076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_014560	GA	3	6	914950	914955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014560	CT	3	6	925269	925274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.