MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 1664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014560	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014560	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014560	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014560	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014560	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014560	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014560	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014560	AAC	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014560	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014560	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014560	TGT	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014560	GGT	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014560	TAA	3	9	9367	9375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014560	TTA	2	6	9789	9794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014560	ATT	2	6	9868	9873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014560	TTA	2	6	9933	9938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014560	AGG	2	6	12828	12833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014560	ACC	2	6	13718	13723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014560	CTG	2	6	16794	16799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014560	GGT	2	6	22883	22888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014560	TGT	2	6	22915	22920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014560	TCA	2	6	22927	22932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014560	GGT	2	6	25865	25870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014560	TTA	2	6	26061	26066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014560	GAT	2	6	27389	27394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014560	TAA	2	6	40623	40628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014560	CTT	2	6	44423	44428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014560	CTT	2	6	44619	44624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014560	TAG	2	6	44956	44961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014560	GTA	2	6	51336	51341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014560	CTT	2	6	51388	51393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014560	ATC	2	6	51408	51413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014560	TGA	2	6	51458	51463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014560	TTG	2	6	51549	51554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014560	ATT	2	6	51561	51566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014560	TGT	2	6	51612	51617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014560	TAA	2	6	51637	51642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014560	CAT	2	6	51647	51652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014560	AGT	2	6	51660	51665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014560	AAT	2	6	51848	51853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014560	AAG	2	6	51883	51888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014560	TGC	2	6	51924	51929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014560	ATA	2	6	52000	52005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014560	TTC	2	6	52207	52212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014560	CAA	2	6	52288	52293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014560	CAA	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014560	CTA	2	6	52415	52420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014560	TAA	2	6	61406	61411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014560	GTT	2	6	61428	61433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014560	ATT	2	6	61453	61458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014560	ATT	2	6	61484	61489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014560	ATC	2	6	61567	61572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014560	TTA	2	6	61877	61882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014560	TAA	2	6	61905	61910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014560	AGA	2	6	62147	62152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014560	GCT	2	6	62188	62193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014560	AAG	2	6	62263	62268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014560	CAG	2	6	62377	62382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014560	GAA	2	6	64015	64020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014560	AGA	2	6	64023	64028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014560	AGA	2	6	64058	64063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014560	TTA	2	6	64076	64081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014560	CAA	2	6	64133	64138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014560	ATC	2	6	64183	64188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014560	TAG	2	6	64544	64549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014560	AGA	2	6	64629	64634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014560	AAT	2	6	64684	64689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014560	CTT	2	6	64694	64699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014560	TGA	2	6	64713	64718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014560	CTA	2	6	64799	64804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014560	ATA	2	6	64856	64861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014560	TTA	2	6	65201	65206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014560	ACG	2	6	65213	65218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014560	ACC	2	6	65225	65230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014560	CAA	2	6	65463	65468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014560	TTA	2	6	65718	65723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014560	GAC	2	6	65748	65753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014560	ATG	2	6	65809	65814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014560	CAG	2	6	65820	65825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014560	TTG	2	6	65866	65871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014560	AGA	2	6	66075	66080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014560	CTT	2	6	66234	66239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014560	AGG	2	6	66306	66311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014560	GAT	2	6	66400	66405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014560	AGA	2	6	66438	66443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014560	AAG	2	6	66629	66634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014560	AGA	2	6	66702	66707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014560	AGA	2	6	66810	66815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014560	GAA	2	6	66820	66825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014560	GGT	2	6	67769	67774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014560	AGA	2	6	67800	67805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014560	GTT	2	6	67816	67821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014560	AGA	2	6	67822	67827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014560	GTG	2	6	67865	67870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014560	TAG	2	6	67910	67915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014560	CTT	2	6	68423	68428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014560	AAG	2	6	68467	68472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014560	TCT	2	6	68533	68538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014560	ATG	2	6	68540	68545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014560	CTT	2	6	68642	68647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014560	AAG	2	6	68729	68734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014560	GAA	2	6	68935	68940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014560	AGA	2	6	69003	69008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014560	TCA	2	6	69028	69033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014560	TTA	3	9	69188	69196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014560	TTG	2	6	70012	70017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014560	GAT	2	6	70027	70032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014560	GAG	2	6	70471	70476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014560	AAG	2	6	70481	70486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014560	TAT	2	6	70642	70647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014560	TAA	2	6	70719	70724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014560	AGA	2	6	70731	70736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014560	CTA	2	6	70853	70858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014560	CTA	2	6	71100	71105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014560	TTA	2	6	71131	71136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014560	TGA	2	6	71355	71360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014560	GCG	2	6	71486	71491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014560	AGA	2	6	71553	71558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014560	GAT	2	6	71578	71583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014560	CAA	3	9	71619	71627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014560	TGA	2	6	71676	71681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014560	TGG	2	6	71888	71893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014560	AAC	2	6	72266	72271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014560	ACA	2	6	75895	75900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014560	TTG	2	6	75922	75927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014560	ATT	3	9	78654	78662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014560	TGG	2	6	78790	78795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014560	CTT	2	6	81067	81072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014560	TAT	2	6	81093	81098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014560	CTT	2	6	81103	81108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014560	CCA	2	6	82327	82332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014560	ATT	2	6	82382	82387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014560	GGA	2	6	82883	82888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014560	TGT	2	6	84404	84409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014560	AAG	2	6	84445	84450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014560	ATT	2	6	88843	88848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014560	ATT	2	6	88853	88858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014560	TAA	2	6	90107	90112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014560	TTA	2	6	97006	97011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014560	AAT	2	6	99387	99392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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