MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 3965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014560	CAAT	2	8	435038	435045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_014560	T	7	7	435080	435086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014560	AAG	2	6	435102	435107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014560	TTGTT	2	10	435970	435979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014560	T	6	6	436020	436025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014560	TAT	2	6	436037	436042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014560	AT	3	6	436048	436053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014560	ATA	2	6	436059	436064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014560	TAA	3	9	436073	436081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014560	TTC	2	6	437116	437121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_014560	ACCC	2	8	438365	438372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1012	NC_014560	A	7	7	439842	439848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014560	CCT	2	6	441300	441305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_014560	AAAATA	2	12	441313	441324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014560	ATAAA	2	10	441343	441352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014560	T	8	8	441357	441364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014560	AAATAA	2	12	441365	441376	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014560	ATTT	2	8	441379	441386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014560	TTA	2	6	441406	441411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014560	A	6	6	441434	441439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014560	TTA	2	6	441456	441461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014560	TTGG	2	8	441488	441495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014560	T	6	6	441512	441517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014560	TAT	2	6	441526	441531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014560	ATC	2	6	448870	448875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014560	GTTT	2	8	448890	448897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014560	TA	3	6	448906	448911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014560	T	6	6	448934	448939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014560	CACC	2	8	448982	448989	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_014560	GC	3	6	448998	449003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_014560	T	7	7	449141	449147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014560	T	6	6	449152	449157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014560	TAA	2	6	449174	449179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014560	GTGG	2	8	449254	449261	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014560	CTT	2	6	449424	449429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014560	A	6	6	449437	449442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014560	TGA	2	6	449450	449455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014560	TCTT	2	8	449465	449472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_014560	GTTTT	2	10	449502	449511	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014560	T	6	6	454685	454690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014560	AAAGC	2	10	454736	454745	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_014560	TGG	2	6	454783	454788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014560	TTC	2	6	454856	454861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014560	TGA	2	6	454878	454883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014560	TAT	2	6	455536	455541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014560	TAAAAA	2	12	455546	455557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014560	TCA	2	6	457467	457472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_014560	TAACA	2	10	462327	462336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1049	NC_014560	ACA	2	6	462340	462345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014560	TAAA	2	8	463714	463721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014560	ATA	2	6	463722	463727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014560	AT	4	8	463736	463743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014560	TAT	2	6	463752	463757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014560	ATT	2	6	463761	463766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014560	TAAAA	2	10	463818	463827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014560	A	6	6	463875	463880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014560	T	6	6	463883	463888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014560	CTT	2	6	464524	464529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014560	T	6	6	464580	464585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014560	ACC	2	6	464653	464658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_014560	A	6	6	465486	465491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014560	T	6	6	466974	466979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014560	AAC	2	6	467071	467076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014560	TAA	2	6	468537	468542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014560	T	6	6	468586	468591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014560	ATT	2	6	468617	468622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014560	T	6	6	474061	474066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014560	A	6	6	475648	475653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014560	A	6	6	475702	475707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014560	TTA	3	9	477252	477260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014560	TA	3	6	477265	477270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014560	AAC	2	6	477272	477277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014560	A	6	6	477315	477320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014560	T	7	7	477324	477330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014560	AT	3	6	477332	477337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014560	A	6	6	477349	477354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014560	TATCC	2	10	477356	477365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_014560	T	6	6	479145	479150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014560	TTTTA	2	10	479155	479164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014560	TAT	2	6	480682	480687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014560	CAA	2	6	480736	480741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014560	AGCG	2	8	480802	480809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_014560	T	10	10	483214	483223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014560	T	7	7	483486	483492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014560	TTG	2	6	483510	483515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014560	GTT	2	6	483524	483529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014560	TAT	2	6	483535	483540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014560	TCA	2	6	484753	484758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014560	A	6	6	484813	484818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014560	T	6	6	484830	484835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014560	TAT	2	6	484842	484847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014560	TGA	2	6	484855	484860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014560	AAAT	2	8	486052	486059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014560	AGTTT	2	10	486136	486145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014560	ACC	2	6	486183	486188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_014560	ATTTT	2	10	487440	487449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014560	T	6	6	487446	487451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014560	CTTA	2	8	490493	490500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_014560	AAT	2	6	490501	490506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014560	TAACT	2	10	490534	490543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_014560	T	6	6	490574	490579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014560	T	6	6	490598	490603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014560	A	6	6	490633	490638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014560	ATT	2	6	494512	494517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014560	TTGA	2	8	495652	495659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014560	AG	3	6	498020	498025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014560	GAAT	2	8	499787	499794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014560	TAA	2	6	499931	499936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014560	CTT	2	6	501870	501875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014560	TA	3	6	505386	505391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014560	TTA	2	6	505432	505437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014560	TACTA	2	10	505447	505456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_014560	GTTT	2	8	505476	505483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014560	T	6	6	505526	505531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014560	AGA	2	6	505624	505629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014560	CAAA	2	8	506082	506089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_014560	T	8	8	506147	506154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014560	GATT	2	8	506168	506175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014560	AG	4	8	507168	507175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014560	GTG	2	6	510936	510941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014560	AAT	2	6	510954	510959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014560	GTT	2	6	514466	514471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014560	T	6	6	514470	514475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014560	TAA	2	6	514480	514485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014560	A	6	6	516589	516594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014560	AT	3	6	516600	516605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014560	GTAA	2	8	516658	516665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014560	TGCT	2	8	516693	516700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_014560	TTG	2	6	516711	516716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014560	T	6	6	516720	516725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014560	T	6	6	516765	516770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014560	TTTG	2	8	516812	516819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014560	TAAA	2	8	516824	516831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014560	TAG	2	6	516873	516878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014560	GGT	2	6	516909	516914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014560	TTA	2	6	516927	516932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014560	AAAAC	2	10	517011	517020	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1138	NC_014560	CAA	2	6	517044	517049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_014560	TAT	2	6	517072	517077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_014560	T	6	6	517124	517129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1423	NC_014560	T	6	6	625056	625061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_014560	CTA	2	6	625441	625446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_014560	GTA	2	6	627532	627537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1428	NC_014560	T	6	6	633291	633296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_014560	ATT	2	6	633297	633302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_014560	AAGA	2	8	639145	639152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_014560	TGA	2	6	639178	639183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_014560	TAA	2	6	642565	642570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_014560	AAAT	2	8	651566	651573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_014560	CTC	2	6	651598	651603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1443	NC_014560	CAC	2	6	651626	651631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1444	NC_014560	TTTAA	2	10	652220	652229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_014560	GGT	2	6	652242	652247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_014560	CT	6	12	652382	652393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_014560	TTTA	2	8	652425	652432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_014560	GAAG	2	8	652448	652455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_014560	CAG	2	6	652494	652499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1456	NC_014560	A	6	6	652531	652536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_014560	ATT	2	6	652540	652545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1459	NC_014560	A	7	7	653388	653394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_014560	TAT	2	6	653473	653478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_014560	A	6	6	653509	653514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1468	NC_014560	TAAA	2	8	657665	657672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_014560	T	6	6	663519	663524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_014560	ATT	2	6	663526	663531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_014560	A	6	6	668241	668246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_014560	A	10	10	668322	668331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_014560	G	7	7	668347	668353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1483	NC_014560	TA	3	6	683880	683885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_014560	TTA	3	9	688956	688964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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