MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	TC	3	6	4960	4965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014555	AC	3	6	6284	6289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014555	GC	3	6	6316	6321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014555	CG	3	6	6866	6871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014555	GA	6	12	7034	7045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014555	CT	3	6	13409	13414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014555	CA	3	6	16450	16455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014555	CT	4	8	22555	22562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014555	AG	3	6	25192	25197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014555	TA	3	6	26814	26819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014555	AG	3	6	38569	38574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014555	GC	3	6	42212	42217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014555	TG	3	6	46822	46827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014555	AG	3	6	53915	53920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014555	TC	3	6	54197	54202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014555	GC	3	6	56464	56469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014555	GC	3	6	56535	56540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014555	CT	3	6	56640	56645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014555	AG	4	8	57069	57076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014555	GC	3	6	57519	57524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014555	AG	3	6	61586	61591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014555	TA	3	6	61800	61805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014555	GT	3	6	62518	62523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014555	CA	3	6	73808	73813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014555	TA	5	10	73866	73875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014555	TC	3	6	74902	74907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014555	AG	3	6	79398	79403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014555	AG	3	6	87842	87847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014555	CT	3	6	90456	90461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014555	TA	3	6	91356	91361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014555	GT	3	6	93445	93450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014555	CT	3	6	106650	106655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014555	TA	3	6	119238	119243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014555	CA	3	6	127866	127871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014555	AG	3	6	128835	128840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014555	TA	3	6	128876	128881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014555	CT	3	6	129847	129852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014555	TG	3	6	157455	157460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014555	CT	3	6	158462	158467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014555	TC	3	6	160882	160887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014555	AC	3	6	170377	170382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014555	AT	3	6	176083	176088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014555	GA	3	6	176089	176094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014555	CT	3	6	181218	181223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014555	GC	3	6	181304	181309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014555	GC	3	6	203519	203524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014555	AT	3	6	206382	206387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014555	AG	3	6	215579	215584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014555	TG	3	6	218358	218363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014555	GT	3	6	225904	225909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014555	TC	3	6	258014	258019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014555	AT	3	6	258222	258227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014555	AG	3	6	295466	295471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014555	AT	3	6	315297	315302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014555	AT	3	6	315411	315416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014555	TC	3	6	319838	319843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014555	AG	3	6	326403	326408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014555	GA	3	6	352241	352246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014555	AT	3	6	370057	370062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014555	AG	3	6	371747	371752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014555	AG	3	6	373195	373200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014555	GA	4	8	381277	381284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014555	GT	3	6	405554	405559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014555	AT	3	6	421218	421223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014555	TA	3	6	434018	434023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014555	GC	3	6	434110	434115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014555	AT	4	8	448839	448846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014555	AG	3	6	452131	452136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014555	GT	3	6	462081	462086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014555	TG	4	8	462356	462363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014555	TA	3	6	463736	463741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014555	CT	3	6	468227	468232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014555	TC	3	6	468378	468383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014555	AG	3	6	469272	469277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014555	TA	3	6	472241	472246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014555	TA	3	6	473478	473483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014555	GA	3	6	485510	485515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014555	GA	5	10	485983	485992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014555	CA	3	6	486051	486056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014555	TG	3	6	491786	491791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014555	AT	3	6	508219	508224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014555	GA	3	6	510072	510077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014555	CT	3	6	510101	510106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014555	GA	3	6	510186	510191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014555	CT	3	6	510215	510220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014555	CT	3	6	510329	510334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014555	AC	3	6	510377	510382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014555	CT	3	6	510768	510773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014555	GA	3	6	510855	510860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014555	CT	3	6	510884	510889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014555	CT	3	6	511115	511120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014555	CT	3	6	511229	511234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014555	GA	3	6	511521	511526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014555	CT	3	6	511550	511555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014555	CT	3	6	511667	511672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014555	TC	3	6	512112	512117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014555	AG	4	8	517996	518003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014555	GA	3	6	519573	519578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014555	CT	3	6	521184	521189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014555	CT	3	6	522169	522174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014555	GA	3	6	522629	522634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014555	CT	3	6	532676	532681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014555	AG	3	6	538228	538233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014555	GA	3	6	545091	545096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014555	TA	3	6	549478	549483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014555	AC	3	6	550908	550913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014555	TA	3	6	555113	555118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014555	TG	3	6	565974	565979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014555	GC	3	6	577924	577929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014555	GC	3	6	578995	579000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014555	AG	3	6	579006	579011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014555	TG	3	6	579708	579713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014555	GC	3	6	579835	579840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014555	AT	3	6	587053	587058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014555	AT	3	6	614923	614928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014555	TC	3	6	615489	615494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014555	CT	3	6	645423	645428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014555	CT	3	6	670124	670129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014555	TA	3	6	670499	670504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014555	TC	3	6	670619	670624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014555	TA	3	6	670819	670824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014555	AT	3	6	687725	687730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014555	TA	3	6	687744	687749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014555	AT	3	6	687762	687767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014555	TA	3	6	711642	711647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014555	TC	4	8	711757	711764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014555	AG	3	6	714986	714991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014555	CT	3	6	723271	723276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014555	AT	3	6	726647	726652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014555	TA	3	6	731821	731826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014555	GA	8	16	739697	739712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014555	CT	3	6	746622	746627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014555	CT	3	6	747149	747154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014555	TA	3	6	747339	747344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014555	GA	3	6	750510	750515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014555	AG	3	6	767132	767137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014555	GA	3	6	792866	792871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014555	TC	3	6	797770	797775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014555	TC	3	6	807263	807268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014555	AT	3	6	838132	838137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014555	CT	3	6	849645	849650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014555	CT	3	6	850399	850404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014555	CT	3	6	862653	862658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014555	CT	3	6	862811	862816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014555	GC	3	6	863717	863722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014555	CT	3	6	865367	865372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014555	TC	3	6	867511	867516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014555	AC	3	6	883915	883920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014555	AT	3	6	891322	891327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014555	CT	3	6	903805	903810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014555	AT	3	6	903864	903869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014555	GC	3	6	910879	910884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014555	CA	3	6	914267	914272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014555	AT	3	6	928515	928520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_014555	GT	3	6	1572282	1572287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NC_014555	AG	3	6	1576878	1576883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
306	NC_014555	TC	3	6	1577049	1577054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
307	NC_014555	CT	3	6	1578599	1578604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
308	NC_014555	TG	3	6	1580724	1580729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
309	NC_014555	AG	3	6	1597664	1597669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_014555	CT	4	8	1603291	1603298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
311	NC_014555	TG	3	6	1610185	1610190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_014555	AC	3	6	1628067	1628072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.